41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1223 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_1223  Glutathione S-transferase domain protein  100 
 
 
229 aa  472  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000515515 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1078  Glutathione S-transferase domain  90.39 
 
 
229 aa  430  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000010734 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0774  glutathione S-transferase domain-containing protein  59.39 
 
 
229 aa  283  1.0000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.264601 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1550  lignin degradation protein  59.63 
 
 
226 aa  272  3e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.355245  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4134  glutathione S-transferase-like  48.39 
 
 
231 aa  210  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4820  Glutathione S-transferase domain  50.23 
 
 
231 aa  206  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.651391  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2357  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.42 
 
 
238 aa  206  3e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.396368  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4143  glutathione S-transferase-like protein  45.33 
 
 
231 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.595769  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1788  putative glutathione S-transferase (GST)  47.42 
 
 
229 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1599  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.23 
 
 
226 aa  193  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0946501 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7062  Glutathione S-transferase domain protein  45.61 
 
 
229 aa  187  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00932246  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2618  glutathione S-transferase domain protein  43.52 
 
 
236 aa  174  7e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3099  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.89 
 
 
232 aa  174  8e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.937068  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4017  glutathione S-transferase-like  40.53 
 
 
232 aa  173  1.9999999999999998e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.678212 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6243  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.23 
 
 
229 aa  170  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.247558 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2685  glutathione S-transferase-like protein  38.77 
 
 
236 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.702474  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2863  putative lignin beta-etherase  40.48 
 
 
222 aa  160  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.300835  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1948  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.73 
 
 
232 aa  139  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05770  Glutathione S-transferase-like protein  37.89 
 
 
230 aa  137  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.765948  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2405  glutathione S-transferase-like  33.17 
 
 
279 aa  117  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1652  hypothetical protein  31.47 
 
 
237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887044  normal  0.0204387 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00480  expressed protein  26.67 
 
 
252 aa  63.2  0.000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02948  glutathione S-transferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07930)  23.87 
 
 
268 aa  57.8  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0881  glutathione S-transferase domain protein  26.13 
 
 
263 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0898679  normal  0.46136 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0854  Glutathione S-transferase domain protein  26.13 
 
 
263 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2771  Glutathione S-transferase domain protein  26.39 
 
 
225 aa  50.1  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00309034  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1907  glutathione S-transferase-like protein  27.14 
 
 
263 aa  47.8  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0464392  normal  0.0635336 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02592  conserved hypothetical protein  25.64 
 
 
271 aa  47.4  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.121449  normal  0.298423 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4250  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.63 
 
 
202 aa  46.6  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.127206  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1478  putative glutathione S-transferase  25 
 
 
239 aa  46.2  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.184026  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1437  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.85 
 
 
202 aa  45.8  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000241692  hitchhiker  0.000981469 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27580  putative glutathione S-transferase  35.09 
 
 
220 aa  45.1  0.0009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.08808  decreased coverage  0.00115097 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01821  putative glutathione S-transferase  24.47 
 
 
239 aa  44.7  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0879846  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0500  Glutathione S-transferase domain  36.78 
 
 
222 aa  44.3  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0342057 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0854  maleylacetoacetate isomerase  26.92 
 
 
214 aa  43.9  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.186068  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0190  Glutaredoxin 2-like protein  25.91 
 
 
227 aa  43.9  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2019  maleylacetoacetate isomerase  30.47 
 
 
213 aa  42.7  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.70314  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1555  glutathione S-transferase-like  27.72 
 
 
203 aa  42.4  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4141  maleylacetoacetate isomerase  26.06 
 
 
214 aa  42.4  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1478  glutathione S-transferase domain-containing protein  23.76 
 
 
263 aa  42.4  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.204587  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3597  maleylacetoacetate isomerase  29.12 
 
 
221 aa  42  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0169924  normal  0.0485989 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>