48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0774 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0774  glutathione S-transferase domain-containing protein  100 
 
 		 229 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.264601 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1223  Glutathione S-transferase domain protein  59.39 
 
 		 229 aa  283  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000515515 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1078  Glutathione S-transferase domain  58.52 
 
 		 229 aa  281  6.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000010734 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1550  lignin degradation protein  60.55 
 
 		 226 aa  280  1e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.355245  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1788  putative glutathione S-transferase (GST)  51.8 
 
 		 229 aa  228  6e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4820  Glutathione S-transferase domain  49.56 
 
 		 231 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.651391  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4134  glutathione S-transferase-like  48.66 
 
 		 231 aa  215  5e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4143  glutathione S-transferase-like protein  48 
 
 		 231 aa  214  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.595769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2357  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.4 
 
 		 238 aa  202  4e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.396368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2618  glutathione S-transferase domain protein  47.32 
 
 		 236 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4017  glutathione S-transferase-like  40.97 
 
 		 232 aa  187  9e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.678212 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1599  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.97 
 
 		 226 aa  187  1e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0946501 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3099  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.38 
 
 		 232 aa  181  1e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.937068  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2685  glutathione S-transferase-like protein  42.29 
 
 		 236 aa  180  1e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.702474  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7062  Glutathione S-transferase domain protein  43.86 
 
 		 229 aa  178  5.999999999999999e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00932246  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1948  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.81 
 
 		 232 aa  176  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2863  putative lignin beta-etherase  40.91 
 
 		 222 aa  174  9e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.300835  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6243  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.79 
 
 		 229 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.247558 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2405  glutathione S-transferase-like  39.42 
 
 		 279 aa  144  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05770  Glutathione S-transferase-like protein  40.09 
 
 		 230 aa  136  3.0000000000000003e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.765948  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1652  hypothetical protein  36.55 
 
 		 237 aa  132  5e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887044  normal  0.0204387 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00480  expressed protein  31.34 
 
 		 252 aa  66.6  0.0000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02948  glutathione S-transferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07930)  24.22 
 
 		 268 aa  65.9  0.0000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0854  Glutathione S-transferase domain protein  27.37 
 
 		 263 aa  65.5  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0881  glutathione S-transferase domain protein  27.37 
 
 		 263 aa  65.5  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0898679  normal  0.46136 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1907  glutathione S-transferase-like protein  27.89 
 
 		 263 aa  61.6  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0464392  normal  0.0635336 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1478  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.92 
 
 		 263 aa  59.3  0.00000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.204587  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27580  putative glutathione S-transferase  35.16 
 
 		 220 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.08808  decreased coverage  0.00115097 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0579  putative glutathione S-transferase  35.71 
 
 		 249 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06190  putative glutathione S-transferase  35.71 
 
 		 249 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0166402 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0788  glutathione S-transferase  28.12 
 
 		 264 aa  50.8  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.200068 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2090  maleylacetoacetate isomerase  37.04 
 
 		 213 aa  50.1  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2334  glutathione S-transferase  34.38 
 
 		 220 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0381359  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2348  putative glutathione S-transferase  29.84 
 
 		 246 aa  48.5  0.00009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1914  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.63 
 
 		 220 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0652856  normal  0.568324 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0384  maleylacetoacetate isomerase (glutathione transferase zeta 1) protein  36.84 
 
 		 216 aa  47.4  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.593741 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0343  putative glutathione S-transferase  30.43 
 
 		 241 aa  47.4  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.889809  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02592  conserved hypothetical protein  25.5 
 
 		 271 aa  46.6  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.121449  normal  0.298423 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26121  putative glutathione S-transferase  31.96 
 
 		 241 aa  46.6  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.551591 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5110  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.21 
 
 		 205 aa  46.2  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0347901 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0240  maleylacetoacetate isomerase  32.65 
 
 		 216 aa  46.2  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2915  putative glutathione S-transferase-related protein  24.77 
 
 		 312 aa  46.2  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0261  maleylacetoacetate isomerase  32.65 
 
 		 214 aa  46.2  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4303  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.63 
 
 		 211 aa  43.9  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1478  putative glutathione S-transferase  23.56 
 
 		 239 aa  43.5  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.184026  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2736  maleylacetoacetate isomerase  25.89 
 
 		 215 aa  42.4  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2873  Glutathione S-transferase domain  32.22 
 
 		 260 aa  42.4  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.606982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2563  putative glutathione S-transferase-related protein  25.76 
 
 		 312 aa  42  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.569618  normal  0.331421 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>