59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1848 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_1848  putative glutathione S-transferase-related protein  100 
 
 
315 aa  646    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.417859 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2563  putative glutathione S-transferase-related protein  76.97 
 
 
312 aa  502  1e-141  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.569618  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2490  putative glutathione S-transferase-related protein  67.87 
 
 
313 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2869  putative glutathione S-transferase-related protein  66.34 
 
 
318 aa  427  1e-118  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.658841  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2915  putative glutathione S-transferase-related protein  69.03 
 
 
312 aa  424  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1699  putative glutathione S-transferase-related protein  63.16 
 
 
308 aa  397  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.7383 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2004  putative glutathione S-transferase-related protein  63.16 
 
 
308 aa  397  1e-109  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.344243  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1479  Glutathione S-transferase domain protein  47.62 
 
 
318 aa  295  8e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.627969  normal  0.0228599 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1438  Glutathione S-transferase domain  48.57 
 
 
318 aa  293  2e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.44949  normal  0.0129155 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0981  hypothetical protein  49.03 
 
 
311 aa  290  2e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1783  putative glutathione S-transferase-related protein  48.7 
 
 
310 aa  276  3e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.402117 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1768  putative glutathione S-transferase-related protein  47.62 
 
 
318 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.628601  normal  0.290631 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1263  hypothetical protein  44.77 
 
 
310 aa  272  5.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0732347  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3552  glutathione S-transferase-like protein  47.08 
 
 
311 aa  272  6e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.872782  normal  0.141986 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1081  hypothetical protein  46.08 
 
 
310 aa  270  2e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.336089  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1259  hypothetical protein  45.78 
 
 
311 aa  268  8e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.878186  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14170  hypothetical protein  46.1 
 
 
311 aa  268  1e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.055058 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1847  putative glutathione S-transferase-related protein  42.72 
 
 
310 aa  247  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.116781 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11360  hypothetical protein  44.44 
 
 
311 aa  242  7.999999999999999e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.596022  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1650  hypothetical protein  35.6 
 
 
310 aa  195  1e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.227985  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03487  conserved hypothetical protein  28.86 
 
 
341 aa  97.8  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.67628  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1478  putative glutathione S-transferase  28.27 
 
 
239 aa  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.184026  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01821  putative glutathione S-transferase  28.27 
 
 
239 aa  63.9  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0879846  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0854  Glutathione S-transferase domain protein  27.32 
 
 
263 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0881  glutathione S-transferase domain protein  27.32 
 
 
263 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0898679  normal  0.46136 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1478  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.13 
 
 
263 aa  60.5  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.204587  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0788  glutathione S-transferase  26.12 
 
 
264 aa  57.8  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.200068 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1907  glutathione S-transferase-like protein  25.63 
 
 
263 aa  57.4  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0464392  normal  0.0635336 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1788  putative glutathione S-transferase (GST)  26.98 
 
 
229 aa  57.8  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2783  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.53 
 
 
225 aa  57  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26121  putative glutathione S-transferase  26.11 
 
 
241 aa  56.2  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.551591 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4017  glutathione S-transferase-like  24.66 
 
 
232 aa  55.8  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.678212 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1144  glutathione S-transferase  27.53 
 
 
241 aa  55.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2805  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.53 
 
 
225 aa  55.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383982  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3308  glutathione S-transferase  27.37 
 
 
221 aa  53.5  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4143  glutathione S-transferase-like protein  23.68 
 
 
231 aa  53.5  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.595769  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1550  lignin degradation protein  27.27 
 
 
226 aa  52.4  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.355245  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0485  glutathione S-transferase  27.73 
 
 
368 aa  52  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.917959  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2019  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.32 
 
 
262 aa  52  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.569659 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0275  glutathione S-transferase-like  26.4 
 
 
221 aa  52  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0888177 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2825  glutathione S-transferase-like  25.14 
 
 
221 aa  50.8  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01251  putative glutathione S-transferase  23.58 
 
 
241 aa  50.4  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.621374 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2348  putative glutathione S-transferase  27.49 
 
 
246 aa  50.1  0.00005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2289  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.31 
 
 
252 aa  50.1  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.497964  normal  0.298446 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0343  putative glutathione S-transferase  32.67 
 
 
241 aa  49.7  0.00007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.889809  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6850  Glutathione S-transferase domain protein  30.99 
 
 
213 aa  48.5  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.226481 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1948  glutathione S-transferase domain-containing protein  23.79 
 
 
232 aa  48.1  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2451  Glutathione S-transferase domain protein  25.45 
 
 
224 aa  46.6  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00188128  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3441  maleylacetoacetate isomerase  23.44 
 
 
219 aa  46.6  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3702  Glutathione S-transferase domain protein  24.44 
 
 
226 aa  45.4  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2771  Glutathione S-transferase domain protein  32.5 
 
 
225 aa  44.3  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00309034  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4998  glutathione S-transferase-like protein  32.98 
 
 
223 aa  43.9  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0183331  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06190  putative glutathione S-transferase  31.19 
 
 
249 aa  43.1  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0166402 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2398  glutathione S-transferase-like protein  26.18 
 
 
408 aa  43.1  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.416741  normal  0.054689 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4945  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.46 
 
 
232 aa  43.1  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.25103 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3336  glutathione S-transferase  23.87 
 
 
362 aa  43.1  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0579  putative glutathione S-transferase  30.28 
 
 
249 aa  42.7  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1977  glutathione S-transferase domain-containing protein  23.33 
 
 
222 aa  42.7  0.008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290176  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6309  glutathione S-transferase domain-containing protein  22.65 
 
 
267 aa  42.4  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>