42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0190 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_0190  Glutaredoxin 2-like protein  100 
 
 		 227 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2771  Glutathione S-transferase domain protein  33.18 
 
 		 225 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00309034  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0780  glutaredoxin 2-like protein  31.28 
 
 		 225 aa  102  5e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00620206  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3221  glutaredoxin 2  26.01 
 
 		 211 aa  71.2  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3458  GrxB family glutaredoxin  24.66 
 
 		 231 aa  66.2  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0142149  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1106  glutaredoxin 2  25.56 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2608  glutaredoxin 2  27.19 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.24478 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4017  glutathione S-transferase-like  27.11 
 
 		 232 aa  59.3  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.678212 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1961  glutaredoxin 2  23.58 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0519203  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2863  putative lignin beta-etherase  26.95 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.300835  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2078  glutaredoxin 2  24.67 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.504039  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2798  glutaredoxin 2  26.22 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.848662  normal  0.112338 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1578  glutaredoxin 2  25.57 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2549  glutaredoxin 2  24.77 
 
 		 226 aa  54.7  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.511119 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2618  glutathione S-transferase domain protein  27 
 
 		 236 aa  52.4  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1801  glutaredoxin 2  23.35 
 
 		 215 aa  52.4  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.690184  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01068  hypothetical protein  24.02 
 
 		 215 aa  52  0.000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.557548  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1443  glutaredoxin 2  24.02 
 
 		 215 aa  52  0.000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.89922  hitchhiker  0.00478743 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2262  glutaredoxin 2  24.02 
 
 		 215 aa  52  0.000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2582  glutaredoxin, GrxB family  24.02 
 
 		 215 aa  52  0.000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.427911  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01060  glutaredoxin 2 (Grx2)  24.02 
 
 		 215 aa  52  0.000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.762215  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2536  glutaredoxin 2  24.02 
 
 		 215 aa  52  0.000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.154666  normal  0.170282 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1187  glutaredoxin 2  24.02 
 
 		 215 aa  52  0.000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1187  glutaredoxin 2  24.02 
 
 		 215 aa  52  0.000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2065  glutaredoxin 2  24.02 
 
 		 215 aa  52  0.000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.111207 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1788  putative glutathione S-transferase (GST)  26.6 
 
 		 229 aa  50.8  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2685  glutathione S-transferase-like protein  27.94 
 
 		 236 aa  48.1  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.702474  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2277  glutaredoxin, GrxB family  23.79 
 
 		 215 aa  46.6  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1078  Glutathione S-transferase domain  25.63 
 
 		 229 aa  45.8  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000010734 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000623  glutaredoxin 2  33.33 
 
 		 209 aa  45.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1223  Glutathione S-transferase domain protein  25.13 
 
 		 229 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000515515 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05770  Glutathione S-transferase-like protein  33.57 
 
 		 230 aa  43.9  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.765948  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2405  glutathione S-transferase-like  28.92 
 
 		 279 aa  43.9  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4134  glutathione S-transferase-like  27.46 
 
 		 231 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2182  glutaredoxin, GrxB family  23.04 
 
 		 215 aa  44.3  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.497266  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38124  predicted protein  36.84 
 
 		 305 aa  43.5  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4143  glutathione S-transferase-like protein  30.28 
 
 		 231 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.595769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4820  Glutathione S-transferase domain  29.37 
 
 		 231 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.651391  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06497  glutaredoxin 2  29.85 
 
 		 209 aa  42.7  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0507  glutathione S-transferase-like protein  36.36 
 
 		 205 aa  42.4  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1650  hypothetical protein  32.94 
 
 		 310 aa  41.6  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.227985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6243  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.23 
 
 		 229 aa  41.6  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.247558 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>