56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2798 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_2798  glutaredoxin 2  100 
 
 
215 aa  440  1e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.848662  normal  0.112338 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1578  glutaredoxin 2  66.67 
 
 
215 aa  297  9e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1233  glutaredoxin 2  66.67 
 
 
215 aa  295  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.929078  normal  0.25689 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2023  glutaredoxin 2  66.67 
 
 
215 aa  295  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2207  glutaredoxin 2  66.67 
 
 
215 aa  295  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.158739 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1262  glutaredoxin 2  66.2 
 
 
215 aa  294  9e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.224556 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1277  glutaredoxin 2  66.2 
 
 
215 aa  292  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0995017  normal  0.525696 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2277  glutaredoxin, GrxB family  61.86 
 
 
215 aa  285  4e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2078  glutaredoxin 2  63.81 
 
 
215 aa  285  5e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.504039  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1801  glutaredoxin 2  63.81 
 
 
215 aa  284  9e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.690184  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1443  glutaredoxin 2  61.97 
 
 
215 aa  280  1e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.89922  hitchhiker  0.00478743 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01068  hypothetical protein  61.97 
 
 
215 aa  280  1e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.557548  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2582  glutaredoxin, GrxB family  61.97 
 
 
215 aa  280  1e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.427911  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2262  glutaredoxin 2  61.97 
 
 
215 aa  280  1e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2065  glutaredoxin 2  61.97 
 
 
215 aa  280  1e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.111207 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2536  glutaredoxin 2  61.97 
 
 
215 aa  280  1e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.154666  normal  0.170282 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1187  glutaredoxin 2  61.97 
 
 
215 aa  280  1e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1187  glutaredoxin 2  61.97 
 
 
215 aa  280  1e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01060  glutaredoxin 2 (Grx2)  61.97 
 
 
215 aa  280  1e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.762215  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2182  glutaredoxin, GrxB family  60.93 
 
 
215 aa  271  4.0000000000000004e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.497266  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3458  GrxB family glutaredoxin  46.76 
 
 
231 aa  203  2e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0142149  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3221  glutaredoxin 2  45.54 
 
 
211 aa  190  1e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1106  glutaredoxin 2  44.6 
 
 
211 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2608  glutaredoxin 2  41.71 
 
 
211 aa  178  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.24478 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1961  glutaredoxin 2  41.86 
 
 
216 aa  170  2e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0519203  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2549  glutaredoxin 2  42.92 
 
 
226 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.511119 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06497  glutaredoxin 2  28.57 
 
 
209 aa  108  5e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0245  glutaredoxin 2  28.57 
 
 
218 aa  102  4e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000623  glutaredoxin 2  30.48 
 
 
209 aa  97.8  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38124  predicted protein  32.34 
 
 
305 aa  97.1  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0190  Glutaredoxin 2-like protein  26.22 
 
 
227 aa  53.9  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0062  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.58 
 
 
231 aa  50.1  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1437  glutathione S-transferase domain-containing protein  33 
 
 
202 aa  49.3  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000241692  hitchhiker  0.000981469 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1759  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.53 
 
 
223 aa  48.5  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.296868  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3483  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.58 
 
 
230 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.541048  normal  0.515016 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4039  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.58 
 
 
230 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4128  glutathione S-transferase-like  24.11 
 
 
206 aa  46.2  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2262  glutathione S-transferase domain-containing protein  25 
 
 
223 aa  46.2  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0073858  normal  0.576131 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3750  Glutathione S-transferase domain protein  26.88 
 
 
221 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525726  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4827  Glutathione S-transferase domain  26.88 
 
 
221 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.7966  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1837  glutathione S-transferase domain-containing protein  25 
 
 
223 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.189454  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6781  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.34 
 
 
237 aa  43.9  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.181591 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2005  glutaredoxin  33.78 
 
 
118 aa  43.9  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.916013  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2579  glutaredoxin  31.65 
 
 
118 aa  43.5  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.201508 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2474  maleylacetoacetate isomerase  35.29 
 
 
222 aa  43.9  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.388492  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1043  glutathione S-transferase domain-containing protein  23.12 
 
 
213 aa  43.1  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2760  glutathione S-transferase-like  36.84 
 
 
215 aa  42.7  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2034  hypothetical protein  34.18 
 
 
125 aa  42.7  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144107  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3567  hypothetical protein  32 
 
 
123 aa  42.7  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2417  glutaredoxin  30.38 
 
 
118 aa  42.4  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.656384  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2487  glutaredoxin  30.38 
 
 
118 aa  42.4  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0780124  normal  0.16751 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2797  hypothetical protein  31.65 
 
 
118 aa  42.7  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1594  glutaredoxin  34.67 
 
 
118 aa  42  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01231  putative glutathione S-transferase  31.4 
 
 
241 aa  42  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.168526  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42020  hypothetical protein  30.67 
 
 
123 aa  41.6  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2525  glutathione S-transferase domain-containing protein  21.76 
 
 
241 aa  41.6  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>