70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2005 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2005  glutaredoxin  100 
 
 		 118 aa  247  5e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.916013  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1594  glutaredoxin  68.64 
 
 		 118 aa  174  4e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1562  glutaredoxin  66.95 
 
 		 118 aa  169  7.999999999999999e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2487  glutaredoxin  67.8 
 
 		 118 aa  167  3e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0780124  normal  0.16751 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2417  glutaredoxin  67.8 
 
 		 118 aa  167  3e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.656384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2579  glutaredoxin  67.8 
 
 		 118 aa  167  6e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.201508 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2797  hypothetical protein  66.95 
 
 		 118 aa  166  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3628  glutaredoxin  64.41 
 
 		 118 aa  164  5.9999999999999996e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1688  glutaredoxin  66.1 
 
 		 118 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1830  glutaredoxin  59.32 
 
 		 118 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0383849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1710  glutaredoxin  65.25 
 
 		 118 aa  161  3e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.382993  normal  0.506968 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1598  glutaredoxin  58.47 
 
 		 118 aa  160  5.0000000000000005e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.328495  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2758  glutaredoxin  59.32 
 
 		 118 aa  160  7e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.334545  normal  0.0243575 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2669  glutaredoxin  64.96 
 
 		 118 aa  159  9e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0368347  normal  0.0510929 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1673  glutaredoxin  64.96 
 
 		 118 aa  159  9e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1501  glutaredoxin  61.86 
 
 		 118 aa  159  1e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.676522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05393  hypothetical protein  59.66 
 
 		 119 aa  154  3e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001457  glutaredoxin  54.62 
 
 		 119 aa  145  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3634  hypothetical protein  54.78 
 
 		 124 aa  132  9.999999999999999e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.466049  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2745  glutaredoxin  50.43 
 
 		 122 aa  128  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0841717  normal  0.856746 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42020  hypothetical protein  53.85 
 
 		 123 aa  128  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3567  hypothetical protein  52.99 
 
 		 123 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2410  glutaredoxin  49.59 
 
 		 123 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.786564  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1540  ATP-dependent helicase HrpB  56.03 
 
 		 121 aa  126  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1430  glutaredoxin  50 
 
 		 123 aa  125  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.11658  normal  0.297548 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0816  putative glutaredoxin  45.76 
 
 		 119 aa  122  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1400  glutaredoxin  48.28 
 
 		 123 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.111122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3889  glutaredoxin  47.41 
 
 		 123 aa  118  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.280842 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1822  glutaredoxin  47.41 
 
 		 123 aa  118  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0545572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1899  glutaredoxin  47.86 
 
 		 123 aa  117  4.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.508072 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1714  hypothetical protein  49.59 
 
 		 123 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0951  glutaredoxin  45.6 
 
 		 147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.40724  normal  0.0261252 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0167  glutaredoxin family protein  46.61 
 
 		 130 aa  108  3e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.08495 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1103  glutaredoxin family protein  45.76 
 
 		 130 aa  108  3e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000207624  normal  0.596308 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1032  glutaredoxin  45.69 
 
 		 130 aa  107  4.0000000000000004e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.783959  normal  0.67876 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2034  hypothetical protein  45.38 
 
 		 125 aa  106  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144107  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1844  hypothetical protein  45.38 
 
 		 121 aa  102  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.322707 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2379  glutaredoxin family protein  42.37 
 
 		 130 aa  100  8e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.272824  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4059  glutaredoxin  41.88 
 
 		 130 aa  99.8  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3222  glutaredoxin  40.43 
 
 		 115 aa  80.1  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0827  putative glutaredoxin  44 
 
 		 89 aa  72.4  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0213  glutaredoxin  38.82 
 
 		 118 aa  66.6  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.989623  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0976  glutaredoxin  43.9 
 
 		 105 aa  61.2  0.000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12420  glutaredoxin-like protein  41.77 
 
 		 82 aa  60.5  0.000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1387  glutaredoxin  39.73 
 
 		 77 aa  55.8  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.252635  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1950  glutaredoxin  43.06 
 
 		 80 aa  51.2  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000181605  normal  0.405053 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1175  glutaredoxin  31.65 
 
 		 82 aa  50.1  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5304  glutaredoxin  35.53 
 
 		 148 aa  48.9  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29383  predicted protein  29.21 
 
 		 309 aa  47.4  0.00006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.066564  normal  0.454968 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45400  predicted protein  28.16 
 
 		 342 aa  47.4  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2423  glutaredoxin  26.58 
 
 		 85 aa  46.6  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1084  glutaredoxin  34.94 
 
 		 103 aa  46.6  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11170  glutaredoxin  33.33 
 
 		 78 aa  45.4  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2195  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.33 
 
 		 284 aa  44.3  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0556  glutaredoxin  32.43 
 
 		 77 aa  43.9  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0146434  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2798  glutaredoxin 2  33.78 
 
 		 215 aa  43.9  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.848662  normal  0.112338 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2207  glutaredoxin 2  33.33 
 
 		 215 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.158739 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1578  glutaredoxin 2  33.78 
 
 		 215 aa  42.7  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2023  glutaredoxin 2  33.33 
 
 		 215 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1233  glutaredoxin 2  33.33 
 
 		 215 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.929078  normal  0.25689 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1277  glutaredoxin 2  33.33 
 
 		 215 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0995017  normal  0.525696 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07400  glutaredoxin-like protein  38.46 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0847  glutaredoxin  31.25 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.352603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1787  glutaredoxin  28.92 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.75758  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0256  glutaredoxin  29.11 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.296093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1262  glutaredoxin 2  32 
 
 		 215 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.224556 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1282  Glutathione S-transferase domain protein  31.65 
 
 		 225 aa  41.6  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2899  glutaredoxin-like protein, YruB-family  30.67 
 
 		 81 aa  41.2  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000623  glutaredoxin 2  35.62 
 
 		 209 aa  40.8  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3505  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.67 
 
 		 229 aa  40.4  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>