184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1759 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_1759  glutathione S-transferase domain-containing protein  100 
 
 
223 aa  460  1e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.296868  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1837  glutathione S-transferase domain-containing protein  92.83 
 
 
223 aa  423  1e-117  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.189454  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2262  glutathione S-transferase domain-containing protein  84.75 
 
 
223 aa  394  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0073858  normal  0.576131 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1980  Glutathione S-transferase domain protein  63.76 
 
 
218 aa  280  1e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000166041  hitchhiker  0.000000103503 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2379  glutathione S-transferase domain-containing protein  63.76 
 
 
218 aa  280  2e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0241136  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2482  glutathione S-transferase domain-containing protein  63.93 
 
 
218 aa  278  6e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00197657  hitchhiker  0.000578467 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2367  glutathione S-transferase domain-containing protein  62.39 
 
 
218 aa  272  3e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00131044  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2288  glutathione-S-transferase domain-containing protein  72.73 
 
 
172 aa  252  4.0000000000000004e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0842  glutathione S-transferase  54.07 
 
 
218 aa  218  6e-56  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0678  glutathione S-transferase domain-containing protein  53.81 
 
 
215 aa  216  2.9999999999999998e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1780  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.34 
 
 
227 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.736993  normal  0.873608 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0878  glutathione S-transferase-like  50.94 
 
 
239 aa  208  6e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1534  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.67 
 
 
238 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.56665  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1043  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.97 
 
 
213 aa  200  9.999999999999999e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2661  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.24 
 
 
219 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.33351  normal  0.0369922 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1972  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.08 
 
 
244 aa  196  3e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000513659  normal  0.0621528 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0507  glutathione S-transferase-like protein  50.95 
 
 
205 aa  191  8e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2101  glutathione S-transferase-like protein  47.58 
 
 
242 aa  190  1e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0347  glutathione S-transferase-like protein  46.58 
 
 
246 aa  190  2e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.158155  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2253  hypothetical protein  50.25 
 
 
213 aa  188  7e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.867065  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2525  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.3 
 
 
241 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1938  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.82 
 
 
228 aa  180  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3105  hypothetical protein  44.98 
 
 
216 aa  175  5e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.028356 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1555  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.74 
 
 
197 aa  174  6e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.419878 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2938  glutathione S-transferase-like  45.25 
 
 
230 aa  174  9e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3219  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.29 
 
 
220 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0014021 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1583  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.73 
 
 
197 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00771057 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3218  glutathione S-transferase-like protein  49.49 
 
 
194 aa  169  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.847694 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2333  glutaredoxin  43.18 
 
 
223 aa  169  3e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.117922  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1524  Glutathione S-transferase domain protein  43.93 
 
 
223 aa  169  4e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.37941  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2023  glutathione S-transferase family protein  46.11 
 
 
199 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.905677  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3719  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.73 
 
 
197 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.626847  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3658  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.5 
 
 
219 aa  166  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.250305  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1678  glutathione S-transferase-like protein  46.86 
 
 
206 aa  164  8e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0311729 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0541  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.27 
 
 
202 aa  162  5.0000000000000005e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2550  rhodanese domain-containing protein  42.99 
 
 
555 aa  161  6e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0160345 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1428  hypothetical protein  39.91 
 
 
224 aa  159  2e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0774888  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1742  glutathione S-transferase domain-containing protein  43 
 
 
217 aa  159  3e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.152495  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1156  glutathione-S-transferase domain-containing protein  40.83 
 
 
216 aa  159  4e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06571  glutathione S-transferase N terminus  37.79 
 
 
219 aa  157  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.737712  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3753  putative glutathione S-transferase  41.4 
 
 
217 aa  156  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0154  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.15 
 
 
225 aa  156  3e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06861  glutathione S-transferase N terminus  38.53 
 
 
219 aa  155  5.0000000000000005e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2500  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.58 
 
 
218 aa  154  1e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4827  Glutathione S-transferase domain  42.59 
 
 
221 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.7966  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3750  Glutathione S-transferase domain protein  42.59 
 
 
221 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525726  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06961  glutathione S-transferase N terminus  34.56 
 
 
219 aa  153  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1382  glutathione S-transferase  42.16 
 
 
212 aa  152  2.9999999999999998e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.253349  normal  0.0983041 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1636  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.82 
 
 
323 aa  152  5e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0630  glutathione S-transferase  38.07 
 
 
219 aa  152  5.9999999999999996e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.731897  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1396  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.9 
 
 
323 aa  148  6e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2730  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.23 
 
 
221 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04766  hypothetical protein  43 
 
 
229 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05689  hypothetical protein  43 
 
 
229 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4576  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.63 
 
 
221 aa  144  7.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0297027  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3641  Glutathione S-transferase domain protein  45.28 
 
 
221 aa  143  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07381  glutathione S-transferase N terminus  36.16 
 
 
226 aa  138  4.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.360393 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06911  glutathione S-transferase N terminus  38.39 
 
 
222 aa  138  6e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3613  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.91 
 
 
206 aa  136  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.708574  hitchhiker  0.00347188 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0069  glutathione S-transferase N terminus  37.95 
 
 
222 aa  135  6.0000000000000005e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27941  glutathione S-transferase N terminus protein  38.39 
 
 
333 aa  135  7.000000000000001e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1112  glutathione S-transferase  30.27 
 
 
209 aa  60.8  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.27507 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2451  Glutathione S-transferase domain protein  28.5 
 
 
224 aa  61.2  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00188128  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2049  Glutathione S-transferase domain protein  28.93 
 
 
229 aa  58.9  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.631712  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04080  probable glutathione S-transferase  27.6 
 
 
199 aa  58.5  0.00000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32351  predicted protein  27.84 
 
 
236 aa  58.2  0.00000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2594  glutathione-S-transferase protein  26.9 
 
 
224 aa  55.8  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.445023 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5011  glutathione S-transferase-like protein  28.95 
 
 
221 aa  54.7  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.05677  normal  0.954106 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1347  glutathione S-transferase domain-containing protein  30 
 
 
205 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0485026 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5640  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.32 
 
 
225 aa  53.1  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.465258  hitchhiker  0.00190893 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2730  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.02 
 
 
211 aa  53.1  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000634111 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1953  hypothetical protein  27.33 
 
 
207 aa  52.4  0.000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1948  hypothetical protein  28 
 
 
207 aa  52  0.000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3702  Glutathione S-transferase domain protein  29.06 
 
 
226 aa  52.4  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2587  Glutathione S-transferase domain  27.56 
 
 
195 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.751074  normal  0.31258 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1417  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.63 
 
 
208 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1296  glutathione S-transferase-like protein  27.36 
 
 
228 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.041604  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5254  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.37 
 
 
226 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3323  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.14 
 
 
227 aa  50.4  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0187385  normal  0.129432 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1394  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.75 
 
 
208 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0885  Glutathione S-transferase domain protein  25.38 
 
 
222 aa  50.1  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4124  glutathione S-transferase-like  26.26 
 
 
217 aa  50.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.590461  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00524  glutathione S-transferase  25.68 
 
 
234 aa  49.7  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3927  glutathione S-transferase-like  25.46 
 
 
228 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1378  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.88 
 
 
208 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2965  Glutathione S-transferase domain protein  24.88 
 
 
208 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0279406  normal  0.0713112 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3532  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.87 
 
 
238 aa  49.3  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3962  putative glutathione S-transferase  28 
 
 
223 aa  49.7  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0291  glutathione S-transferase family protein  29.61 
 
 
218 aa  49.3  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0467  Glutathione S-transferase domain  29.61 
 
 
218 aa  49.3  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.336613  hitchhiker  0.000569408 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2762  glutathione S-transferase-like  27.42 
 
 
206 aa  48.9  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1001  glutathione S-transferase  23.23 
 
 
230 aa  48.5  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3505  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.42 
 
 
229 aa  48.5  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1799  putative glutathione S-transferase (GST)  25.12 
 
 
216 aa  48.5  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.602523  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2798  glutaredoxin 2  25.53 
 
 
215 aa  48.5  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.848662  normal  0.112338 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0751  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.73 
 
 
242 aa  48.5  0.00009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0134442  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09304  translation elongation factor eEF-1B gamma subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17120)  27.19 
 
 
219 aa  48.1  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3434  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.63 
 
 
210 aa  48.1  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.398692  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0809  Glutathione S-transferase domain protein  26.73 
 
 
224 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.803645  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2296  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.39 
 
 
204 aa  48.1  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.879102 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>