74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2417 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_2487  glutaredoxin  100 
 
 		 118 aa  242  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0780124  normal  0.16751 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2417  glutaredoxin  100 
 
 		 118 aa  242  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.656384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2579  glutaredoxin  97.46 
 
 		 118 aa  239  1e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.201508 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2797  hypothetical protein  92.37 
 
 		 118 aa  226  6e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1710  glutaredoxin  90.68 
 
 		 118 aa  221  2e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.382993  normal  0.506968 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1688  glutaredoxin  89.83 
 
 		 118 aa  221  2e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2669  glutaredoxin  89.83 
 
 		 118 aa  220  6e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0368347  normal  0.0510929 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1673  glutaredoxin  89.83 
 
 		 118 aa  220  6e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1562  glutaredoxin  87.29 
 
 		 118 aa  219  9.999999999999999e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1830  glutaredoxin  74.58 
 
 		 118 aa  200  6e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0383849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2758  glutaredoxin  74.58 
 
 		 118 aa  199  9.999999999999999e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.334545  normal  0.0243575 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1598  glutaredoxin  70.34 
 
 		 118 aa  191  3e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.328495  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1501  glutaredoxin  68.64 
 
 		 118 aa  181  3e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.676522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1594  glutaredoxin  70.34 
 
 		 118 aa  179  1e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3628  glutaredoxin  70.34 
 
 		 118 aa  176  1e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2005  glutaredoxin  67.8 
 
 		 118 aa  167  3e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.916013  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001457  glutaredoxin  58.82 
 
 		 119 aa  149  8.999999999999999e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05393  hypothetical protein  56.3 
 
 		 119 aa  145  2.0000000000000003e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0816  putative glutaredoxin  50.85 
 
 		 119 aa  133  9.999999999999999e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3634  hypothetical protein  52.17 
 
 		 124 aa  128  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.466049  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1540  ATP-dependent helicase HrpB  56.9 
 
 		 121 aa  128  3e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1430  glutaredoxin  50 
 
 		 123 aa  124  5e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.11658  normal  0.297548 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2745  glutaredoxin  51.72 
 
 		 122 aa  123  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0841717  normal  0.856746 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3567  hypothetical protein  51.72 
 
 		 123 aa  121  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42020  hypothetical protein  51.72 
 
 		 123 aa  121  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1822  glutaredoxin  50 
 
 		 123 aa  120  7e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0545572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3889  glutaredoxin  50 
 
 		 123 aa  120  7e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.280842 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1400  glutaredoxin  49.14 
 
 		 123 aa  120  9e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.111122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2410  glutaredoxin  47.93 
 
 		 123 aa  120  9e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.786564  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1103  glutaredoxin family protein  47.86 
 
 		 130 aa  117  3.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000207624  normal  0.596308 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1899  glutaredoxin  46.15 
 
 		 123 aa  117  4.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.508072 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1714  hypothetical protein  49.59 
 
 		 123 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0951  glutaredoxin  46.4 
 
 		 147 aa  111  3e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.40724  normal  0.0261252 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0167  glutaredoxin family protein  45.76 
 
 		 130 aa  110  5e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.08495 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4059  glutaredoxin  47.01 
 
 		 130 aa  110  6e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2034  hypothetical protein  44.54 
 
 		 125 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144107  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2379  glutaredoxin family protein  45.3 
 
 		 130 aa  104  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.272824  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1844  hypothetical protein  43.7 
 
 		 121 aa  102  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.322707 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1032  glutaredoxin  46.15 
 
 		 130 aa  102  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.783959  normal  0.67876 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3222  glutaredoxin  47.37 
 
 		 115 aa  97.1  7e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0827  putative glutaredoxin  50 
 
 		 89 aa  80.9  0.000000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0213  glutaredoxin  42.86 
 
 		 118 aa  73.9  0.0000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.989623  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12420  glutaredoxin-like protein  41.56 
 
 		 82 aa  62.8  0.000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5304  glutaredoxin  41.89 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1950  glutaredoxin  45.83 
 
 		 80 aa  57.4  0.00000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000181605  normal  0.405053 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0976  glutaredoxin  38.27 
 
 		 105 aa  55.1  0.0000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1387  glutaredoxin  34.72 
 
 		 77 aa  52.4  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.252635  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1787  glutaredoxin  32.5 
 
 		 84 aa  50.1  0.000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.75758  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2195  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.37 
 
 		 284 aa  48.9  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2423  glutaredoxin  30.38 
 
 		 85 aa  48.9  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119472  Carotenoid dioxygenase plastidic fusion protein, putative  31 
 
 		 914 aa  48.5  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0452333  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29383  predicted protein  32.93 
 
 		 309 aa  48.1  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.066564  normal  0.454968 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1175  glutaredoxin  30.38 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0847  glutaredoxin  30.38 
 
 		 84 aa  45.4  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.352603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1250  glutaredoxin  31.58 
 
 		 83 aa  44.7  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.461543  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0256  glutaredoxin  30.38 
 
 		 86 aa  45.1  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.296093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0886  glutaredoxin  32.1 
 
 		 87 aa  44.7  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.289839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1402  glutaredoxin 3  31.88 
 
 		 85 aa  44.3  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07400  glutaredoxin-like protein  35.06 
 
 		 82 aa  44.3  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11170  glutaredoxin  36.84 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1084  glutaredoxin  34.67 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45400  predicted protein  28.57 
 
 		 342 aa  43.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2798  glutaredoxin 2  30.38 
 
 		 215 aa  42.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.848662  normal  0.112338 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0245  glutaredoxin 2  38.67 
 
 		 218 aa  42.4  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2053  hypothetical protein  29.55 
 
 		 87 aa  42  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01251  putative glutathione S-transferase  32.43 
 
 		 241 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.621374 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2289  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.49 
 
 		 252 aa  41.6  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.497964  normal  0.298446 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2348  glutaredoxin  32.5 
 
 		 79 aa  41.2  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0181488 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1578  glutaredoxin 2  29.11 
 
 		 215 aa  40.8  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2182  glutaredoxin, GrxB family  32.89 
 
 		 215 aa  40.8  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.497266  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0343  putative glutathione S-transferase  30.26 
 
 		 241 aa  40.4  0.008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.889809  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0296  glutathione S-transferase-like protein  27.63 
 
 		 214 aa  40.4  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.351442  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000623  glutaredoxin 2  37.33 
 
 		 209 aa  40  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0812  glutathione S-transferase  29.87 
 
 		 198 aa  40  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000181934  hitchhiker  0.000010543 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>