89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_42020 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_42020  hypothetical protein  100 
 
 
123 aa  252  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3567  hypothetical protein  95.93 
 
 
123 aa  245  2e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2745  glutaredoxin  68.6 
 
 
122 aa  181  3e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0841717  normal  0.856746 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1430  glutaredoxin  66.39 
 
 
123 aa  178  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.11658  normal  0.297548 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1400  glutaredoxin  66.39 
 
 
123 aa  176  9e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.111122  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3889  glutaredoxin  65.57 
 
 
123 aa  175  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.280842 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1822  glutaredoxin  66.12 
 
 
123 aa  175  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0545572  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2410  glutaredoxin  61.16 
 
 
123 aa  161  3e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.786564  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1714  hypothetical protein  67.77 
 
 
123 aa  160  7e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1899  glutaredoxin  57.85 
 
 
123 aa  153  8e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.508072 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2034  hypothetical protein  60.33 
 
 
125 aa  149  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144107  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05393  hypothetical protein  55.46 
 
 
119 aa  144  4.0000000000000006e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001457  glutaredoxin  51.26 
 
 
119 aa  137  7e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1844  hypothetical protein  57.98 
 
 
121 aa  136  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.322707 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0816  putative glutaredoxin  50 
 
 
119 aa  130  5e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2758  glutaredoxin  52.59 
 
 
118 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.334545  normal  0.0243575 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2005  glutaredoxin  53.85 
 
 
118 aa  128  3e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.916013  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2797  hypothetical protein  51.72 
 
 
118 aa  123  8.000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1598  glutaredoxin  46.55 
 
 
118 aa  122  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.328495  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2579  glutaredoxin  51.72 
 
 
118 aa  122  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.201508 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1103  glutaredoxin family protein  46.34 
 
 
130 aa  122  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000207624  normal  0.596308 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2487  glutaredoxin  51.72 
 
 
118 aa  121  4e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0780124  normal  0.16751 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2417  glutaredoxin  51.72 
 
 
118 aa  121  4e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.656384  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1830  glutaredoxin  49.14 
 
 
118 aa  121  4e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0383849  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1540  ATP-dependent helicase HrpB  48.28 
 
 
121 aa  119  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1562  glutaredoxin  50.86 
 
 
118 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1710  glutaredoxin  50.86 
 
 
118 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.382993  normal  0.506968 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1688  glutaredoxin  50.86 
 
 
118 aa  118  3e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2669  glutaredoxin  50 
 
 
118 aa  117  6e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0368347  normal  0.0510929 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0167  glutaredoxin family protein  45.97 
 
 
130 aa  117  6e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.08495 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1673  glutaredoxin  50 
 
 
118 aa  117  6e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1594  glutaredoxin  49.14 
 
 
118 aa  117  7e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3628  glutaredoxin  47.41 
 
 
118 aa  117  7.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3634  hypothetical protein  46.22 
 
 
124 aa  116  9e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.466049  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4059  glutaredoxin  41.94 
 
 
130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1501  glutaredoxin  50.86 
 
 
118 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.676522  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0951  glutaredoxin  46.67 
 
 
147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.40724  normal  0.0261252 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3222  glutaredoxin  50.53 
 
 
115 aa  110  5e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2379  glutaredoxin family protein  43.9 
 
 
130 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.272824  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1032  glutaredoxin  44.17 
 
 
130 aa  107  5e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.783959  normal  0.67876 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0827  putative glutaredoxin  44.3 
 
 
89 aa  84  7e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0213  glutaredoxin  40.86 
 
 
118 aa  75.9  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.989623  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0976  glutaredoxin  40.24 
 
 
105 aa  62.8  0.000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5304  glutaredoxin  41.33 
 
 
148 aa  60.1  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29383  predicted protein  31.36 
 
 
309 aa  57  0.00000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.066564  normal  0.454968 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1950  glutaredoxin  41.67 
 
 
80 aa  55.8  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000181605  normal  0.405053 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2423  glutaredoxin  28.57 
 
 
85 aa  53.5  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1175  glutaredoxin  30.49 
 
 
82 aa  52.8  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1387  glutaredoxin  31.17 
 
 
77 aa  50.8  0.000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.252635  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0256  glutaredoxin  30.59 
 
 
86 aa  50.8  0.000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.296093  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1787  glutaredoxin  32.14 
 
 
84 aa  50.4  0.000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.75758  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0847  glutaredoxin  30.95 
 
 
84 aa  50.8  0.000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.352603  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11170  glutaredoxin  37.33 
 
 
78 aa  50.1  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07400  glutaredoxin-like protein  33.75 
 
 
82 aa  49.3  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1084  glutaredoxin  32.53 
 
 
103 aa  48.1  0.00004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2195  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.82 
 
 
284 aa  45.4  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12420  glutaredoxin-like protein  30.49 
 
 
82 aa  45.1  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2207  glutaredoxin 2  31.58 
 
 
215 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.158739 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45400  predicted protein  29.25 
 
 
342 aa  44.3  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2023  glutaredoxin 2  31.58 
 
 
215 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1233  glutaredoxin 2  31.58 
 
 
215 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.929078  normal  0.25689 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0556  glutaredoxin  26.92 
 
 
77 aa  44.3  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0146434  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1277  glutaredoxin 2  31.58 
 
 
215 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0995017  normal  0.525696 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1282  Glutathione S-transferase domain protein  35 
 
 
225 aa  43.5  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1262  glutaredoxin 2  30.26 
 
 
215 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.224556 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3239  hypothetical protein  29.55 
 
 
90 aa  43.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01231  putative glutathione S-transferase  33.33 
 
 
241 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.168526  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2582  glutaredoxin, GrxB family  29.33 
 
 
215 aa  42.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.427911  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2053  hypothetical protein  32.58 
 
 
87 aa  42.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01068  hypothetical protein  29.33 
 
 
215 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.557548  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01060  glutaredoxin 2 (Grx2)  29.33 
 
 
215 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.762215  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0113  putative glutathione S-transferase  32.1 
 
 
241 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1187  glutaredoxin 2  29.33 
 
 
215 aa  42.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1187  glutaredoxin 2  29.33 
 
 
215 aa  42.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2536  glutaredoxin 2  29.33 
 
 
215 aa  42.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.154666  normal  0.170282 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2065  glutaredoxin 2  29.33 
 
 
215 aa  42.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.111207 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2262  glutaredoxin 2  29.33 
 
 
215 aa  42.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1443  glutaredoxin 2  29.33 
 
 
215 aa  42.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.89922  hitchhiker  0.00478743 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2182  glutaredoxin, GrxB family  31.58 
 
 
215 aa  42.7  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.497266  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2798  glutaredoxin 2  30.67 
 
 
215 aa  41.6  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.848662  normal  0.112338 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01251  putative glutathione S-transferase  37.66 
 
 
241 aa  41.2  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.621374 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2899  glutaredoxin-like protein, YruB-family  31.08 
 
 
81 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2107  glutaredoxin  29.27 
 
 
94 aa  41.2  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.367569  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01261  putative glutathione S-transferase  32.1 
 
 
241 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.991625  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1578  glutaredoxin 2  29.33 
 
 
215 aa  40.8  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2078  glutaredoxin 2  30.26 
 
 
215 aa  40.4  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.504039  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0406  glutaredoxin  29.11 
 
 
86 aa  40.4  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.394009  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1801  glutaredoxin 2  31.58 
 
 
215 aa  40.4  0.009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.690184  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01271  putative glutathione S-transferase  30.86 
 
 
241 aa  40  0.01  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.867718  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>