133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4827 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010678  Rpic_4827  Glutathione S-transferase domain  100 
 
 
221 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.7966  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3750  Glutathione S-transferase domain protein  100 
 
 
221 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525726  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04766  hypothetical protein  75.12 
 
 
229 aa  306  2.0000000000000002e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05689  hypothetical protein  75.12 
 
 
229 aa  306  2.0000000000000002e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1382  glutathione S-transferase  59.52 
 
 
212 aa  253  2.0000000000000002e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.253349  normal  0.0983041 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3658  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.7 
 
 
219 aa  193  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.250305  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0507  glutathione S-transferase-like protein  51.21 
 
 
205 aa  190  2e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1938  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.3 
 
 
228 aa  185  4e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1043  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.07 
 
 
213 aa  181  7e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2938  glutathione S-transferase-like  48.36 
 
 
230 aa  176  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1678  glutathione S-transferase-like protein  47.57 
 
 
206 aa  175  4e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0311729 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0541  glutathione S-transferase domain-containing protein  48 
 
 
202 aa  175  4e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4576  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.78 
 
 
221 aa  168  5e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0297027  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0842  glutathione S-transferase  47.45 
 
 
218 aa  167  2e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3218  glutathione S-transferase-like protein  47.45 
 
 
194 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.847694 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3719  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.5 
 
 
197 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.626847  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1972  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.69 
 
 
244 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000513659  normal  0.0621528 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2101  glutathione S-transferase-like protein  42.29 
 
 
242 aa  162  3e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2550  rhodanese domain-containing protein  48.04 
 
 
555 aa  162  3e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0160345 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0678  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.31 
 
 
215 aa  162  3e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2661  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.75 
 
 
219 aa  162  3e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.33351  normal  0.0369922 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0878  glutathione S-transferase-like  45.41 
 
 
239 aa  161  6e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1583  glutathione S-transferase domain-containing protein  48 
 
 
197 aa  161  6e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00771057 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0347  glutathione S-transferase-like protein  44.24 
 
 
246 aa  160  1e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.158155  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1524  Glutathione S-transferase domain protein  46.61 
 
 
223 aa  160  1e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.37941  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2023  glutathione S-transferase family protein  47.5 
 
 
199 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.905677  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2333  glutaredoxin  46.61 
 
 
223 aa  159  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.117922  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1555  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.5 
 
 
197 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.419878 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1780  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.06 
 
 
227 aa  159  3e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.736993  normal  0.873608 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1534  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.99 
 
 
238 aa  159  5e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.56665  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3105  hypothetical protein  45.54 
 
 
216 aa  157  1e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.028356 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2500  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.26 
 
 
218 aa  157  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2482  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.39 
 
 
218 aa  155  3e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00197657  hitchhiker  0.000578467 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2262  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.06 
 
 
223 aa  155  6e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0073858  normal  0.576131 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2379  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.93 
 
 
218 aa  154  9e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0241136  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1759  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.59 
 
 
223 aa  154  1e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.296868  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1636  glutathione S-transferase domain-containing protein  46 
 
 
323 aa  152  2.9999999999999998e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2367  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.93 
 
 
218 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00131044  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1980  Glutathione S-transferase domain protein  43.93 
 
 
218 aa  152  4e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000166041  hitchhiker  0.000000103503 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0154  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.76 
 
 
225 aa  152  4e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1837  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.63 
 
 
223 aa  150  1e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.189454  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1428  hypothetical protein  40.39 
 
 
224 aa  150  1e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0774888  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2253  hypothetical protein  42.29 
 
 
213 aa  150  1e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.867065  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2525  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.53 
 
 
241 aa  150  2e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1156  glutathione-S-transferase domain-containing protein  39.81 
 
 
216 aa  148  5e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1742  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.89 
 
 
217 aa  147  1.0000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.152495  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3641  Glutathione S-transferase domain protein  47.73 
 
 
221 aa  145  5e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2730  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.45 
 
 
221 aa  144  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27941  glutathione S-transferase N terminus protein  43.48 
 
 
333 aa  142  4e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1396  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.5 
 
 
323 aa  140  9.999999999999999e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07381  glutathione S-transferase N terminus  35.43 
 
 
226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.360393 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0069  glutathione S-transferase N terminus  37.2 
 
 
222 aa  132  6e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06911  glutathione S-transferase N terminus  36.71 
 
 
222 aa  129  3e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3219  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.54 
 
 
220 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0014021 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3753  putative glutathione S-transferase  35.78 
 
 
217 aa  124  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3613  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.16 
 
 
206 aa  121  7e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.708574  hitchhiker  0.00347188 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2288  glutathione-S-transferase domain-containing protein  43.9 
 
 
172 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06571  glutathione S-transferase N terminus  34.16 
 
 
219 aa  115  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.737712  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0630  glutathione S-transferase  38.55 
 
 
219 aa  115  6.9999999999999995e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.731897  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06861  glutathione S-transferase N terminus  34.16 
 
 
219 aa  115  6.9999999999999995e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06961  glutathione S-transferase N terminus  29.82 
 
 
219 aa  105  5e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3532  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.33 
 
 
238 aa  52  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4552  Glutathione S-transferase domain protein  42.67 
 
 
227 aa  52  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0663368  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0263  glutathione S-transferase-like protein  29.27 
 
 
199 aa  51.2  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000123388  hitchhiker  0.00483772 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32351  predicted protein  37.68 
 
 
236 aa  50.4  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4288  Glutathione S-transferase domain  41.33 
 
 
226 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.817272 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1112  glutathione S-transferase  29.41 
 
 
209 aa  49.7  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.27507 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2594  glutathione-S-transferase protein  28.64 
 
 
224 aa  49.7  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.445023 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1486  glutathione S-transferase  29.25 
 
 
204 aa  48.5  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1002  glutathione S-transferase-like protein  28.48 
 
 
199 aa  48.5  0.00007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.110038  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3702  Glutathione S-transferase domain protein  41.33 
 
 
226 aa  48.5  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0764  glutathione S-transferase-like protein  26.62 
 
 
198 aa  47.8  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2451  Glutathione S-transferase domain protein  28.92 
 
 
224 aa  47  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00188128  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00524  glutathione S-transferase  32.84 
 
 
234 aa  47  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2608  glutaredoxin 2  38.57 
 
 
211 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.24478 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1830  stringent starvation protein a  32.35 
 
 
199 aa  46.2  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.855376  normal  0.188895 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2347  Glutathione S-transferase domain protein  24.89 
 
 
237 aa  46.2  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3323  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.23 
 
 
227 aa  46.2  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0187385  normal  0.129432 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2926  putative transcription modulator protein  26.54 
 
 
203 aa  45.8  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2277  glutaredoxin, GrxB family  26.09 
 
 
215 aa  45.8  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3505  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.97 
 
 
229 aa  45.8  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0812  glutathione S-transferase  35.59 
 
 
198 aa  45.8  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000181934  hitchhiker  0.000010543 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3090  glutathione S-transferase  26.67 
 
 
203 aa  45.4  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.840634  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3227  glutathione S-transferase-like protein  26.67 
 
 
203 aa  45.4  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3203  Glutathione S-transferase domain  26.54 
 
 
203 aa  45.4  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.802093 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2856  Glutathione S-transferase domain protein  26.54 
 
 
203 aa  45.4  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.438523 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2695  stringent starvation protein A  26.54 
 
 
203 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0467  Glutathione S-transferase domain  35.21 
 
 
218 aa  45.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.336613  hitchhiker  0.000569408 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3542  glutathione S-transferase  26.54 
 
 
203 aa  44.3  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2974  stringent starvation protein A  26.54 
 
 
203 aa  44.7  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.904673  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3541  Glutathione S-transferase domain  26.54 
 
 
203 aa  44.3  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.468115  normal  0.06049 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0362  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.54 
 
 
203 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0609511  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0444  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.54 
 
 
203 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3259  stringent starvation protein A  26.54 
 
 
203 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1808  stringent starvation protein A  26.54 
 
 
203 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3647  stringent starvation protein A  26.54 
 
 
203 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.48548  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2798  glutaredoxin 2  26.88 
 
 
215 aa  44.7  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.848662  normal  0.112338 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0371  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.54 
 
 
203 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.322532  normal  0.452731 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0347  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.54 
 
 
203 aa  44.3  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0423  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.54 
 
 
203 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102515  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>