50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A2207 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A2207  glutaredoxin 2  100 
 
 		 215 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.158739 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2023  glutaredoxin 2  100 
 
 		 215 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1233  glutaredoxin 2  100 
 
 		 215 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.929078  normal  0.25689 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1277  glutaredoxin 2  99.53 
 
 		 215 aa  443  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0995017  normal  0.525696 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1262  glutaredoxin 2  99.07 
 
 		 215 aa  443  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.224556 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2582  glutaredoxin, GrxB family  86.05 
 
 		 215 aa  389  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.427911  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1443  glutaredoxin 2  86.05 
 
 		 215 aa  389  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.89922  hitchhiker  0.00478743 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2262  glutaredoxin 2  86.05 
 
 		 215 aa  389  1e-107  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01068  hypothetical protein  86.05 
 
 		 215 aa  389  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.557548  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2065  glutaredoxin 2  86.05 
 
 		 215 aa  389  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.111207 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2536  glutaredoxin 2  86.05 
 
 		 215 aa  389  1e-107  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.154666  normal  0.170282 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1187  glutaredoxin 2  86.05 
 
 		 215 aa  389  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1187  glutaredoxin 2  86.05 
 
 		 215 aa  389  1e-107  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01060  glutaredoxin 2 (Grx2)  86.05 
 
 		 215 aa  389  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.762215  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1578  glutaredoxin 2  83.26 
 
 		 215 aa  380  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1801  glutaredoxin 2  70.7 
 
 		 215 aa  328  4e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.690184  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2078  glutaredoxin 2  71.16 
 
 		 215 aa  328  4e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.504039  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2798  glutaredoxin 2  66.67 
 
 		 215 aa  295  3e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.848662  normal  0.112338 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2182  glutaredoxin, GrxB family  59.35 
 
 		 215 aa  275  3e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.497266  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2277  glutaredoxin, GrxB family  59.81 
 
 		 215 aa  275  4e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3458  GrxB family glutaredoxin  48.37 
 
 		 231 aa  198  6e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0142149  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3221  glutaredoxin 2  44.91 
 
 		 211 aa  190  2e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1106  glutaredoxin 2  42.59 
 
 		 211 aa  181  1e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1961  glutaredoxin 2  42.66 
 
 		 216 aa  176  3e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0519203  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2549  glutaredoxin 2  42.4 
 
 		 226 aa  165  5e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.511119 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2608  glutaredoxin 2  38.79 
 
 		 211 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.24478 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38124  predicted protein  30.96 
 
 		 305 aa  110  1.0000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06497  glutaredoxin 2  30 
 
 		 209 aa  105  5e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0245  glutaredoxin 2  28.91 
 
 		 218 aa  105  7e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000623  glutaredoxin 2  27.62 
 
 		 209 aa  99.4  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1830  glutaredoxin  33.33 
 
 		 118 aa  46.6  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0383849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3567  hypothetical protein  32.89 
 
 		 123 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1032  glutaredoxin  40 
 
 		 130 aa  45.4  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.783959  normal  0.67876 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5304  glutaredoxin  32.94 
 
 		 148 aa  45.4  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1437  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.79 
 
 		 202 aa  45.4  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000241692  hitchhiker  0.000981469 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2758  glutaredoxin  33.33 
 
 		 118 aa  45.1  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.334545  normal  0.0243575 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42020  hypothetical protein  31.58 
 
 		 123 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2771  Glutathione S-transferase domain protein  27.1 
 
 		 225 aa  43.9  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00309034  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001457  glutaredoxin  34.25 
 
 		 119 aa  43.5  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01251  putative glutathione S-transferase  27.85 
 
 		 241 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.621374 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05393  hypothetical protein  35.14 
 
 		 119 aa  43.5  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2005  glutaredoxin  33.33 
 
 		 118 aa  43.5  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.916013  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3634  hypothetical protein  34.62 
 
 		 124 aa  42.7  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.466049  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0827  putative glutaredoxin  35.06 
 
 		 89 aa  42.7  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1430  glutaredoxin  32.89 
 
 		 123 aa  42  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.11658  normal  0.297548 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2745  glutaredoxin  32.89 
 
 		 122 aa  42  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0841717  normal  0.856746 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0816  putative glutaredoxin  29.73 
 
 		 119 aa  42  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0062  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.41 
 
 		 231 aa  42  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1594  glutaredoxin  32.43 
 
 		 118 aa  41.6  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2797  hypothetical protein  31.65 
 
 		 118 aa  41.6  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>