49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E2262 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_2582  glutaredoxin, GrxB family  100 
 
 
215 aa  442  1e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.427911  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01068  hypothetical protein  100 
 
 
215 aa  442  1e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.557548  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1443  glutaredoxin 2  100 
 
 
215 aa  442  1e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.89922  hitchhiker  0.00478743 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2262  glutaredoxin 2  100 
 
 
215 aa  442  1e-123  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2065  glutaredoxin 2  100 
 
 
215 aa  442  1e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.111207 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2536  glutaredoxin 2  100 
 
 
215 aa  442  1e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.154666  normal  0.170282 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1187  glutaredoxin 2  100 
 
 
215 aa  442  1e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1187  glutaredoxin 2  100 
 
 
215 aa  442  1e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01060  glutaredoxin 2 (Grx2)  100 
 
 
215 aa  442  1e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.762215  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1578  glutaredoxin 2  85.12 
 
 
215 aa  387  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2207  glutaredoxin 2  86.05 
 
 
215 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.158739 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2023  glutaredoxin 2  86.05 
 
 
215 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1233  glutaredoxin 2  86.05 
 
 
215 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.929078  normal  0.25689 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1262  glutaredoxin 2  85.58 
 
 
215 aa  387  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.224556 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1277  glutaredoxin 2  85.58 
 
 
215 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0995017  normal  0.525696 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1801  glutaredoxin 2  69.3 
 
 
215 aa  325  3e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.690184  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2078  glutaredoxin 2  69.77 
 
 
215 aa  325  4.0000000000000003e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.504039  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2798  glutaredoxin 2  61.97 
 
 
215 aa  280  1e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.848662  normal  0.112338 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2277  glutaredoxin, GrxB family  58.41 
 
 
215 aa  265  2.9999999999999995e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2182  glutaredoxin, GrxB family  57.01 
 
 
215 aa  262  2e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.497266  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3458  GrxB family glutaredoxin  46.05 
 
 
231 aa  192  2e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0142149  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3221  glutaredoxin 2  43.98 
 
 
211 aa  187  9e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1961  glutaredoxin 2  42.86 
 
 
216 aa  181  5.0000000000000004e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0519203  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1106  glutaredoxin 2  42.59 
 
 
211 aa  180  1e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2549  glutaredoxin 2  42.86 
 
 
226 aa  170  2e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.511119 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2608  glutaredoxin 2  39.25 
 
 
211 aa  165  4e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.24478 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38124  predicted protein  32.08 
 
 
305 aa  109  4.0000000000000004e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06497  glutaredoxin 2  31.43 
 
 
209 aa  107  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0245  glutaredoxin 2  29.38 
 
 
218 aa  106  3e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000623  glutaredoxin 2  28.57 
 
 
209 aa  101  9e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0190  Glutaredoxin 2-like protein  23.58 
 
 
227 aa  49.3  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1437  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.79 
 
 
202 aa  47.8  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000241692  hitchhiker  0.000981469 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5304  glutaredoxin  32.1 
 
 
148 aa  47.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1830  glutaredoxin  35.06 
 
 
118 aa  45.8  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0383849  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01251  putative glutathione S-transferase  27.08 
 
 
241 aa  45.8  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.621374 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2771  Glutathione S-transferase domain protein  32.1 
 
 
225 aa  45.1  0.0009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00309034  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05393  hypothetical protein  33.78 
 
 
119 aa  43.9  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01231  putative glutathione S-transferase  28.12 
 
 
241 aa  43.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.168526  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3567  hypothetical protein  30.67 
 
 
123 aa  43.5  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0062  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.77 
 
 
231 aa  42.7  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01271  putative glutathione S-transferase  28.12 
 
 
241 aa  42.7  0.005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.867718  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0976  glutaredoxin  33.78 
 
 
105 aa  42.4  0.005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42020  hypothetical protein  29.33 
 
 
123 aa  42.4  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1478  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.01 
 
 
263 aa  42  0.008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.204587  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001457  glutaredoxin  30.77 
 
 
119 aa  42  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2758  glutaredoxin  31.65 
 
 
118 aa  41.6  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.334545  normal  0.0243575 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1678  glutathione S-transferase-like protein  25.14 
 
 
206 aa  41.6  0.008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0311729 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3483  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.59 
 
 
230 aa  41.6  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.541048  normal  0.515016 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0113  putative glutathione S-transferase  27.78 
 
 
241 aa  41.6  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>