31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_38124 on replicon NC_011683
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011683  PHATRDRAFT_38124  predicted protein  100 
 
 
305 aa  626  1e-178  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3458  GrxB family glutaredoxin  34.62 
 
 
231 aa  130  3e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0142149  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1801  glutaredoxin 2  32.22 
 
 
215 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.690184  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2078  glutaredoxin 2  31.38 
 
 
215 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.504039  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2023  glutaredoxin 2  30.96 
 
 
215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1233  glutaredoxin 2  30.96 
 
 
215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.929078  normal  0.25689 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1262  glutaredoxin 2  31.38 
 
 
215 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.224556 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2207  glutaredoxin 2  30.96 
 
 
215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.158739 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1443  glutaredoxin 2  32.08 
 
 
215 aa  109  7.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.89922  hitchhiker  0.00478743 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01060  glutaredoxin 2 (Grx2)  32.08 
 
 
215 aa  109  7.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.762215  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2262  glutaredoxin 2  32.08 
 
 
215 aa  109  7.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2065  glutaredoxin 2  32.08 
 
 
215 aa  109  7.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.111207 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2536  glutaredoxin 2  32.08 
 
 
215 aa  109  7.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.154666  normal  0.170282 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1187  glutaredoxin 2  32.08 
 
 
215 aa  109  7.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1187  glutaredoxin 2  32.08 
 
 
215 aa  109  7.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01068  hypothetical protein  32.08 
 
 
215 aa  109  7.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.557548  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2582  glutaredoxin, GrxB family  32.08 
 
 
215 aa  109  7.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.427911  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1277  glutaredoxin 2  30.54 
 
 
215 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0995017  normal  0.525696 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2182  glutaredoxin, GrxB family  33.47 
 
 
215 aa  106  5e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.497266  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1578  glutaredoxin 2  32.37 
 
 
215 aa  106  6e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1961  glutaredoxin 2  30 
 
 
216 aa  103  4e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0519203  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2277  glutaredoxin, GrxB family  31.76 
 
 
215 aa  98.2  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2798  glutaredoxin 2  32.34 
 
 
215 aa  97.1  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.848662  normal  0.112338 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1106  glutaredoxin 2  29.18 
 
 
211 aa  92  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3221  glutaredoxin 2  29.61 
 
 
211 aa  91.3  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2549  glutaredoxin 2  30.83 
 
 
226 aa  86.7  4e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.511119 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2608  glutaredoxin 2  28.75 
 
 
211 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.24478 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06497  glutaredoxin 2  28.27 
 
 
209 aa  72  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000623  glutaredoxin 2  33.33 
 
 
209 aa  69.3  0.00000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0245  glutaredoxin 2  34.88 
 
 
218 aa  67.4  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0190  Glutaredoxin 2-like protein  36.84 
 
 
227 aa  43.5  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>