183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_1837 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_1837  glutathione S-transferase domain-containing protein  100 
 
 
223 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.189454  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1759  glutathione S-transferase domain-containing protein  92.83 
 
 
223 aa  423  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.296868  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2262  glutathione S-transferase domain-containing protein  81.61 
 
 
223 aa  378  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0073858  normal  0.576131 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2379  glutathione S-transferase domain-containing protein  62.84 
 
 
218 aa  273  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0241136  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1980  Glutathione S-transferase domain protein  62.39 
 
 
218 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000166041  hitchhiker  0.000000103503 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2482  glutathione S-transferase domain-containing protein  63.01 
 
 
218 aa  272  3e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00197657  hitchhiker  0.000578467 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2367  glutathione S-transferase domain-containing protein  61.47 
 
 
218 aa  266  2e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00131044  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2288  glutathione-S-transferase domain-containing protein  72.73 
 
 
172 aa  255  4e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0678  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.68 
 
 
215 aa  207  1e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1780  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.77 
 
 
227 aa  206  2e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.736993  normal  0.873608 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0842  glutathione S-transferase  52.15 
 
 
218 aa  205  4e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0878  glutathione S-transferase-like  51.94 
 
 
239 aa  202  2e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1043  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.97 
 
 
213 aa  199  3.9999999999999996e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1534  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.2 
 
 
238 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.56665  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2661  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.4 
 
 
219 aa  193  2e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.33351  normal  0.0369922 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1972  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.54 
 
 
244 aa  192  4e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000513659  normal  0.0621528 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2253  hypothetical protein  50.25 
 
 
213 aa  186  2e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.867065  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0507  glutathione S-transferase-like protein  50.23 
 
 
205 aa  186  3e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0347  glutathione S-transferase-like protein  46.12 
 
 
246 aa  184  9e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.158155  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2101  glutathione S-transferase-like protein  46.7 
 
 
242 aa  179  4e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2525  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.16 
 
 
241 aa  176  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1938  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.06 
 
 
228 aa  176  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3105  hypothetical protein  46.34 
 
 
216 aa  169  3e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.028356 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3219  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.5 
 
 
220 aa  168  5e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0014021 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2938  glutathione S-transferase-like  44.29 
 
 
230 aa  167  8e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1555  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.24 
 
 
197 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.419878 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3218  glutathione S-transferase-like protein  48.48 
 
 
194 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.847694 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2333  glutaredoxin  43.46 
 
 
223 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.117922  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1524  Glutathione S-transferase domain protein  43.46 
 
 
223 aa  163  2.0000000000000002e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.37941  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1583  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.72 
 
 
197 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00771057 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3658  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.02 
 
 
219 aa  160  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.250305  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2023  glutathione S-transferase family protein  44.04 
 
 
199 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.905677  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3719  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.72 
 
 
197 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.626847  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0541  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.98 
 
 
202 aa  157  9e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1678  glutathione S-transferase-like protein  45.89 
 
 
206 aa  156  2e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0311729 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1742  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.92 
 
 
217 aa  156  2e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.152495  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1428  hypothetical protein  40.19 
 
 
224 aa  156  3e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0774888  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0630  glutathione S-transferase  39.09 
 
 
219 aa  155  5.0000000000000005e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.731897  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06571  glutathione S-transferase N terminus  37.91 
 
 
219 aa  154  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.737712  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2550  rhodanese domain-containing protein  43.2 
 
 
555 aa  152  2.9999999999999998e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0160345 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1382  glutathione S-transferase  42.65 
 
 
212 aa  152  4e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.253349  normal  0.0983041 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0154  glutathione S-transferase domain-containing protein  40 
 
 
225 aa  152  5e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06961  glutathione S-transferase N terminus  35.48 
 
 
219 aa  152  5e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4827  Glutathione S-transferase domain  43.63 
 
 
221 aa  150  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.7966  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3750  Glutathione S-transferase domain protein  43.63 
 
 
221 aa  150  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525726  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06861  glutathione S-transferase N terminus  38.07 
 
 
219 aa  149  2e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3753  putative glutathione S-transferase  40.93 
 
 
217 aa  149  4e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1636  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.83 
 
 
323 aa  148  6e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1396  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.9 
 
 
323 aa  148  7e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1156  glutathione-S-transferase domain-containing protein  40.28 
 
 
216 aa  147  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2500  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.1 
 
 
218 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2730  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.23 
 
 
221 aa  144  9e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3641  Glutathione S-transferase domain protein  46.38 
 
 
221 aa  142  4e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07381  glutathione S-transferase N terminus  36.61 
 
 
226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.360393 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27941  glutathione S-transferase N terminus protein  39.55 
 
 
333 aa  139  3.9999999999999997e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4576  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.71 
 
 
221 aa  138  6e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0297027  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06911  glutathione S-transferase N terminus  38.39 
 
 
222 aa  138  7e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04766  hypothetical protein  42.13 
 
 
229 aa  135  5e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05689  hypothetical protein  42.13 
 
 
229 aa  135  5e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0069  glutathione S-transferase N terminus  37.95 
 
 
222 aa  134  8e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3613  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.12 
 
 
206 aa  134  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.708574  hitchhiker  0.00347188 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32351  predicted protein  27.33 
 
 
236 aa  56.6  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1112  glutathione S-transferase  28.89 
 
 
209 aa  55.8  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.27507 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1296  glutathione S-transferase-like protein  26.39 
 
 
228 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.041604  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04080  probable glutathione S-transferase  26.04 
 
 
199 aa  53.5  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1347  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.05 
 
 
205 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0485026 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3927  glutathione S-transferase-like  25.46 
 
 
228 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2594  glutathione-S-transferase protein  26.9 
 
 
224 aa  53.1  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.445023 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2730  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.8 
 
 
211 aa  53.5  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000634111 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2451  Glutathione S-transferase domain protein  27.5 
 
 
224 aa  52.8  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00188128  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2049  Glutathione S-transferase domain protein  28.41 
 
 
229 aa  52.4  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.631712  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2587  Glutathione S-transferase domain  26.75 
 
 
195 aa  51.6  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.751074  normal  0.31258 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1417  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.02 
 
 
208 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0751  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.33 
 
 
242 aa  51.6  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0134442  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3434  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.14 
 
 
210 aa  50.4  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.398692  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3323  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.5 
 
 
227 aa  50.8  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0187385  normal  0.129432 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1948  hypothetical protein  27.15 
 
 
207 aa  50.1  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5254  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.43 
 
 
226 aa  49.7  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1394  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.75 
 
 
208 aa  49.3  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4686  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.8 
 
 
205 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06563  elongation factor 1-gamma, putative (Eurofung)  24.26 
 
 
411 aa  48.9  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.246122  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2312  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.28 
 
 
195 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0196665 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4124  glutathione S-transferase-like  24.87 
 
 
217 aa  48.9  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.590461  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1378  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.88 
 
 
208 aa  48.5  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2965  Glutathione S-transferase domain protein  24.88 
 
 
208 aa  48.5  0.00008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0279406  normal  0.0713112 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3532  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.87 
 
 
238 aa  48.5  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0467  Glutathione S-transferase domain  30.17 
 
 
218 aa  47.8  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.336613  hitchhiker  0.000569408 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1953  hypothetical protein  26.49 
 
 
207 aa  48.1  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0291  glutathione S-transferase family protein  30.17 
 
 
218 aa  47.8  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1799  putative glutathione S-transferase (GST)  24.14 
 
 
216 aa  47.8  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.602523  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4810  Glutathione S-transferase domain  25.87 
 
 
217 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2981  glutathione S-transferase  24.62 
 
 
216 aa  47.4  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.897939  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5011  glutathione S-transferase-like protein  25.35 
 
 
221 aa  47  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.05677  normal  0.954106 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1057  Glutathione S-transferase domain protein  28.79 
 
 
203 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0628244  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00524  glutathione S-transferase  25.24 
 
 
234 aa  47.4  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07807  Putative sterigmatocystin biosynthesis protein stcT [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00717]  26.67 
 
 
215 aa  47  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000242501  normal  0.541102 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4176  glutathione S-transferase-like  24.76 
 
 
225 aa  45.8  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5640  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.88 
 
 
225 aa  46.2  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.465258  hitchhiker  0.00190893 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4039  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.86 
 
 
230 aa  45.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2296  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.59 
 
 
204 aa  45.8  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.879102 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>