67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2608 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2608  glutaredoxin 2  100 
 
 		 211 aa  431  1e-120  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.24478 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1106  glutaredoxin 2  50 
 
 		 211 aa  215  5e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3221  glutaredoxin 2  50.23 
 
 		 211 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2277  glutaredoxin, GrxB family  44.86 
 
 		 215 aa  194  1e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2182  glutaredoxin, GrxB family  45.79 
 
 		 215 aa  187  1e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.497266  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2798  glutaredoxin 2  41.71 
 
 		 215 aa  178  4e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.848662  normal  0.112338 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1578  glutaredoxin 2  41.59 
 
 		 215 aa  172  5e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1801  glutaredoxin 2  41.43 
 
 		 215 aa  168  5e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.690184  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2582  glutaredoxin, GrxB family  39.25 
 
 		 215 aa  165  4e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.427911  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2262  glutaredoxin 2  39.25 
 
 		 215 aa  165  4e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2065  glutaredoxin 2  39.25 
 
 		 215 aa  165  4e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.111207 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2536  glutaredoxin 2  39.25 
 
 		 215 aa  165  4e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.154666  normal  0.170282 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1443  glutaredoxin 2  39.25 
 
 		 215 aa  165  4e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.89922  hitchhiker  0.00478743 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1187  glutaredoxin 2  39.25 
 
 		 215 aa  165  4e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1187  glutaredoxin 2  39.25 
 
 		 215 aa  165  4e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01060  glutaredoxin 2 (Grx2)  39.25 
 
 		 215 aa  165  4e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.762215  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01068  hypothetical protein  39.25 
 
 		 215 aa  165  4e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.557548  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2078  glutaredoxin 2  40.48 
 
 		 215 aa  165  5e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.504039  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1262  glutaredoxin 2  39.25 
 
 		 215 aa  162  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.224556 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1233  glutaredoxin 2  38.79 
 
 		 215 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.929078  normal  0.25689 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2023  glutaredoxin 2  38.79 
 
 		 215 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2207  glutaredoxin 2  38.79 
 
 		 215 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.158739 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1277  glutaredoxin 2  38.32 
 
 		 215 aa  158  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0995017  normal  0.525696 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3458  GrxB family glutaredoxin  34.26 
 
 		 231 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0142149  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2549  glutaredoxin 2  34.6 
 
 		 226 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.511119 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1961  glutaredoxin 2  32.41 
 
 		 216 aa  127  2.0000000000000002e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0519203  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000623  glutaredoxin 2  33.49 
 
 		 209 aa  119  3.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06497  glutaredoxin 2  32.54 
 
 		 209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0245  glutaredoxin 2  32.06 
 
 		 218 aa  113  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38124  predicted protein  28.75 
 
 		 305 aa  79.3  0.00000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0190  Glutaredoxin 2-like protein  26.99 
 
 		 227 aa  60.5  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0678  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.11 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0507  glutathione S-transferase-like protein  26.96 
 
 		 205 aa  52.4  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01251  putative glutathione S-transferase  30.93 
 
 		 241 aa  51.2  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.621374 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1534  glutathione S-transferase domain-containing protein  23.7 
 
 		 238 aa  49.7  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.56665  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0113  putative glutathione S-transferase  29.9 
 
 		 241 aa  48.9  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0788  glutathione S-transferase  32.41 
 
 		 264 aa  48.5  0.00007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.200068 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01261  putative glutathione S-transferase  31.96 
 
 		 241 aa  48.1  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.991625  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2525  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.12 
 
 		 241 aa  47.4  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01231  putative glutathione S-transferase  29.9 
 
 		 241 aa  46.6  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.168526  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3750  Glutathione S-transferase domain protein  38.57 
 
 		 221 aa  47  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4827  Glutathione S-transferase domain  38.57 
 
 		 221 aa  47  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.7966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01271  putative glutathione S-transferase  28.87 
 
 		 241 aa  45.8  0.0005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.867718  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4039  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.52 
 
 		 230 aa  45.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3483  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.87 
 
 		 230 aa  45.4  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.541048  normal  0.515016 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0780  glutaredoxin 2-like protein  26.24 
 
 		 225 aa  45.1  0.0008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00620206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1043  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.92 
 
 		 213 aa  45.1  0.0008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1555  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.37 
 
 		 197 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.419878 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4145  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.12 
 
 		 203 aa  44.3  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.167022 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2661  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.19 
 
 		 219 aa  44.3  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.33351  normal  0.0369922 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1417  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.07 
 
 		 208 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3308  glutathione S-transferase  39.33 
 
 		 221 aa  43.9  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2771  Glutathione S-transferase domain protein  24.77 
 
 		 225 aa  43.5  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00309034  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3831  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.96 
 
 		 223 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.315517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1583  glutathione S-transferase domain-containing protein  28 
 
 		 197 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00771057 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1821  glutathione S-transferase family protein  26.46 
 
 		 200 aa  42.7  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0623474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0846  glutathione S-transferase  33.72 
 
 		 202 aa  42.7  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.289081  normal  0.806951 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3218  glutathione S-transferase-like protein  26.74 
 
 		 194 aa  42.7  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847694 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1830  glutaredoxin  33.77 
 
 		 118 aa  42.7  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0383849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2695  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.1 
 
 		 208 aa  42.4  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00743363 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1399  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.46 
 
 		 200 aa  42.4  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2965  Glutathione S-transferase domain protein  30.1 
 
 		 208 aa  42.4  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0279406  normal  0.0713112 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1837  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.06 
 
 		 223 aa  41.6  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.189454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0878  glutathione S-transferase-like  23.78 
 
 		 239 aa  41.6  0.009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1268  glutathione S-transferase  26.49 
 
 		 215 aa  41.6  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.652561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1780  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.63 
 
 		 227 aa  41.6  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.736993  normal  0.873608 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1907  glutathione S-transferase-like protein  32.29 
 
 		 263 aa  41.6  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0464392  normal  0.0635336 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>