101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1830 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1830  glutaredoxin  100 
 
 		 118 aa  246  6e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0383849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2758  glutaredoxin  85.59 
 
 		 118 aa  215  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.334545  normal  0.0243575 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2579  glutaredoxin  74.58 
 
 		 118 aa  200  5e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.201508 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2417  glutaredoxin  74.58 
 
 		 118 aa  200  6e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.656384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2487  glutaredoxin  74.58 
 
 		 118 aa  200  6e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0780124  normal  0.16751 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1562  glutaredoxin  74.58 
 
 		 118 aa  198  1.9999999999999998e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2797  hypothetical protein  73.73 
 
 		 118 aa  193  8.000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1598  glutaredoxin  70.34 
 
 		 118 aa  192  1e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.328495  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1501  glutaredoxin  73.73 
 
 		 118 aa  191  3e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.676522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1688  glutaredoxin  72.03 
 
 		 118 aa  188  2e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1710  glutaredoxin  71.19 
 
 		 118 aa  188  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.382993  normal  0.506968 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1673  glutaredoxin  70.34 
 
 		 118 aa  186  8e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2669  glutaredoxin  70.34 
 
 		 118 aa  186  8e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0368347  normal  0.0510929 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1594  glutaredoxin  68.64 
 
 		 118 aa  182  1.0000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3628  glutaredoxin  67.8 
 
 		 118 aa  174  4e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2005  glutaredoxin  59.32 
 
 		 118 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.916013  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001457  glutaredoxin  57.98 
 
 		 119 aa  152  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05393  hypothetical protein  56.3 
 
 		 119 aa  147  7e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0816  putative glutaredoxin  54.24 
 
 		 119 aa  140  7e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3634  hypothetical protein  51.3 
 
 		 124 aa  130  3.9999999999999996e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.466049  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1540  ATP-dependent helicase HrpB  52.1 
 
 		 121 aa  124  3e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2410  glutaredoxin  46.28 
 
 		 123 aa  124  6e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.786564  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2745  glutaredoxin  50.89 
 
 		 122 aa  123  8.000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0841717  normal  0.856746 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42020  hypothetical protein  49.14 
 
 		 123 aa  121  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1899  glutaredoxin  48.72 
 
 		 123 aa  120  6e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.508072 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3567  hypothetical protein  47.41 
 
 		 123 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1430  glutaredoxin  50 
 
 		 123 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.11658  normal  0.297548 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1714  hypothetical protein  48.76 
 
 		 123 aa  117  7e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1822  glutaredoxin  50.89 
 
 		 123 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0545572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3889  glutaredoxin  50.89 
 
 		 123 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.280842 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1400  glutaredoxin  50 
 
 		 123 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.111122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1103  glutaredoxin family protein  45.3 
 
 		 130 aa  111  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000207624  normal  0.596308 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0167  glutaredoxin family protein  44.44 
 
 		 130 aa  106  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.08495 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2034  hypothetical protein  43.7 
 
 		 125 aa  105  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144107  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2379  glutaredoxin family protein  43.59 
 
 		 130 aa  104  5e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.272824  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1032  glutaredoxin  45.69 
 
 		 130 aa  103  9e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.783959  normal  0.67876 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4059  glutaredoxin  42.74 
 
 		 130 aa  102  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1844  hypothetical protein  42.86 
 
 		 121 aa  101  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.322707 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0951  glutaredoxin  41.6 
 
 		 147 aa  101  3e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.40724  normal  0.0261252 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3222  glutaredoxin  46.32 
 
 		 115 aa  91.7  3e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0827  putative glutaredoxin  50.63 
 
 		 89 aa  77.8  0.00000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0213  glutaredoxin  44.05 
 
 		 118 aa  74.3  0.0000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.989623  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0976  glutaredoxin  39.51 
 
 		 105 aa  57  0.00000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1950  glutaredoxin  45.83 
 
 		 80 aa  56.6  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000181605  normal  0.405053 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12420  glutaredoxin-like protein  36.99 
 
 		 82 aa  54.3  0.0000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5304  glutaredoxin  39.19 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29383  predicted protein  32.65 
 
 		 309 aa  52.8  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.066564  normal  0.454968 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2423  glutaredoxin  31.65 
 
 		 85 aa  52.4  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1387  glutaredoxin  37.31 
 
 		 77 aa  51.6  0.000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.252635  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0847  glutaredoxin  32.91 
 
 		 84 aa  49.3  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.352603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1175  glutaredoxin  30.38 
 
 		 82 aa  48.5  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2182  glutaredoxin, GrxB family  36.11 
 
 		 215 aa  47.4  0.00007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.497266  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0256  glutaredoxin  34.18 
 
 		 86 aa  47  0.00009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.296093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1277  glutaredoxin 2  33.33 
 
 		 215 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0995017  normal  0.525696 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1233  glutaredoxin 2  33.33 
 
 		 215 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.929078  normal  0.25689 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2023  glutaredoxin 2  33.33 
 
 		 215 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2207  glutaredoxin 2  33.33 
 
 		 215 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.158739 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2277  glutaredoxin, GrxB family  34.67 
 
 		 215 aa  46.2  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01060  glutaredoxin 2 (Grx2)  35.06 
 
 		 215 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.762215  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2582  glutaredoxin, GrxB family  35.06 
 
 		 215 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.427911  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1578  glutaredoxin 2  33.77 
 
 		 215 aa  46.2  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1187  glutaredoxin 2  35.06 
 
 		 215 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1187  glutaredoxin 2  35.06 
 
 		 215 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2536  glutaredoxin 2  35.06 
 
 		 215 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.154666  normal  0.170282 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2065  glutaredoxin 2  35.06 
 
 		 215 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.111207 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2262  glutaredoxin 2  35.06 
 
 		 215 aa  45.8  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1443  glutaredoxin 2  35.06 
 
 		 215 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.89922  hitchhiker  0.00478743 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01068  hypothetical protein  35.06 
 
 		 215 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.557548  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0886  glutaredoxin  36.14 
 
 		 87 aa  46.2  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.289839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2195  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.03 
 
 		 284 aa  45.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1262  glutaredoxin 2  32 
 
 		 215 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.224556 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11170  glutaredoxin  37.66 
 
 		 78 aa  45.1  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1787  glutaredoxin  35.8 
 
 		 84 aa  45.4  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.75758  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1084  glutaredoxin  33.33 
 
 		 103 aa  43.9  0.0008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06497  glutaredoxin 2  36.99 
 
 		 209 aa  43.5  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2757  hypothetical protein  32.14 
 
 		 206 aa  42.7  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3458  GrxB family glutaredoxin  29.87 
 
 		 231 aa  42.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0142149  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119472  Carotenoid dioxygenase plastidic fusion protein, putative  31.33 
 
 		 914 aa  42.7  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0452333  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0245  glutaredoxin 2  38.67 
 
 		 218 aa  42.7  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2608  glutaredoxin 2  33.77 
 
 		 211 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.24478 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1961  glutaredoxin 2  32.89 
 
 		 216 aa  42.7  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0519203  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45400  predicted protein  35.44 
 
 		 342 aa  42.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2348  glutaredoxin  34.18 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0181488 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3221  glutaredoxin 2  35 
 
 		 211 aa  42.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1106  glutaredoxin 2  34.62 
 
 		 211 aa  42.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1250  glutaredoxin  29.21 
 
 		 83 aa  42  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.461543  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2289  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.8 
 
 		 252 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.497964  normal  0.298446 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2952  glutaredoxin-like protein NrdH  31.51 
 
 		 73 aa  42  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.794387  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7384  glutaredoxin protein  29.76 
 
 		 99 aa  41.6  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.405165  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000623  glutaredoxin 2  35.62 
 
 		 209 aa  41.6  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2078  glutaredoxin 2  32.47 
 
 		 215 aa  41.6  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.504039  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2630  hypothetical protein  30.95 
 
 		 206 aa  41.2  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1801  glutaredoxin 2  33.77 
 
 		 215 aa  41.2  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.690184  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3239  hypothetical protein  28.41 
 
 		 90 aa  41.2  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2053  hypothetical protein  29.21 
 
 		 87 aa  40.8  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0290  glutaredoxin-like protein nrdH  29.87 
 
 		 115 aa  40.8  0.007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0883091  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2549  glutaredoxin 2  28.38 
 
 		 226 aa  40.4  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.511119 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2798  glutaredoxin 2  30.14 
 
 		 215 aa  40.4  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.848662  normal  0.112338 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3370  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  32.31 
 
 		 333 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2741  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  32.31 
 
 		 333 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00698708  unclonable  0.00000000287618 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>