68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1501 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1501  glutaredoxin  100 
 
 		 118 aa  245  2e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.676522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1830  glutaredoxin  73.73 
 
 		 118 aa  191  3e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0383849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1688  glutaredoxin  73.73 
 
 		 118 aa  190  5e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1710  glutaredoxin  72.88 
 
 		 118 aa  190  7e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.382993  normal  0.506968 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2669  glutaredoxin  72.65 
 
 		 118 aa  188  2e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0368347  normal  0.0510929 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1673  glutaredoxin  72.65 
 
 		 118 aa  188  2e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2579  glutaredoxin  71.19 
 
 		 118 aa  185  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.201508 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2758  glutaredoxin  72.03 
 
 		 118 aa  184  3e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.334545  normal  0.0243575 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3628  glutaredoxin  71.19 
 
 		 118 aa  182  2.0000000000000003e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2487  glutaredoxin  68.64 
 
 		 118 aa  181  3e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0780124  normal  0.16751 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2417  glutaredoxin  68.64 
 
 		 118 aa  181  3e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.656384  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2797  hypothetical protein  69.49 
 
 		 118 aa  180  5.0000000000000004e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1562  glutaredoxin  68.64 
 
 		 118 aa  180  7e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1594  glutaredoxin  70.34 
 
 		 118 aa  176  1e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1598  glutaredoxin  63.56 
 
 		 118 aa  175  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.328495  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2005  glutaredoxin  61.86 
 
 		 118 aa  159  1e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.916013  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05393  hypothetical protein  54.62 
 
 		 119 aa  139  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001457  glutaredoxin  53.78 
 
 		 119 aa  138  3e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0816  putative glutaredoxin  55.08 
 
 		 119 aa  135  2e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1430  glutaredoxin  52.59 
 
 		 123 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.11658  normal  0.297548 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1714  hypothetical protein  54.55 
 
 		 123 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1400  glutaredoxin  51.79 
 
 		 123 aa  120  5e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.111122  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3634  hypothetical protein  47.83 
 
 		 124 aa  120  6e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.466049  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1822  glutaredoxin  50.89 
 
 		 123 aa  120  7e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0545572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3889  glutaredoxin  50.89 
 
 		 123 aa  120  7e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.280842 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1540  ATP-dependent helicase HrpB  53.04 
 
 		 121 aa  120  9e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2745  glutaredoxin  50 
 
 		 122 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0841717  normal  0.856746 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3567  hypothetical protein  50 
 
 		 123 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2410  glutaredoxin  43.8 
 
 		 123 aa  114  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.786564  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1103  glutaredoxin family protein  50.43 
 
 		 130 aa  114  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000207624  normal  0.596308 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42020  hypothetical protein  50.86 
 
 		 123 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1899  glutaredoxin  43.59 
 
 		 123 aa  109  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.508072 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1844  hypothetical protein  48.74 
 
 		 121 aa  107  5e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.322707 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2034  hypothetical protein  47.06 
 
 		 125 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144107  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4059  glutaredoxin  48.28 
 
 		 130 aa  105  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2379  glutaredoxin family protein  47.86 
 
 		 130 aa  105  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.272824  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0951  glutaredoxin  40.8 
 
 		 147 aa  97.8  4e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.40724  normal  0.0261252 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1032  glutaredoxin  43.97 
 
 		 130 aa  94.7  4e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.783959  normal  0.67876 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0167  glutaredoxin family protein  41.03 
 
 		 130 aa  94  6e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.08495 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3222  glutaredoxin  45.26 
 
 		 115 aa  88.2  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0827  putative glutaredoxin  42.68 
 
 		 89 aa  73.6  0.0000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0213  glutaredoxin  41.18 
 
 		 118 aa  70.1  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.989623  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29383  predicted protein  32.65 
 
 		 309 aa  57  0.00000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.066564  normal  0.454968 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0976  glutaredoxin  38.82 
 
 		 105 aa  54.3  0.0000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12420  glutaredoxin-like protein  35.44 
 
 		 82 aa  54.3  0.0000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1950  glutaredoxin  42.25 
 
 		 80 aa  50.8  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000181605  normal  0.405053 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1084  glutaredoxin  36.14 
 
 		 103 aa  48.1  0.00004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1387  glutaredoxin  31.51 
 
 		 77 aa  47.8  0.00006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.252635  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119472  Carotenoid dioxygenase plastidic fusion protein, putative  33.75 
 
 		 914 aa  47.4  0.00007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0452333  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1282  Glutathione S-transferase domain protein  34.62 
 
 		 225 aa  47  0.00009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1175  glutaredoxin  31.65 
 
 		 82 aa  46.6  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5304  glutaredoxin  36.49 
 
 		 148 aa  47  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2423  glutaredoxin  27.85 
 
 		 85 aa  45.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3239  hypothetical protein  31.03 
 
 		 90 aa  45.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1562  glutathione S-transferase related protein  30.67 
 
 		 198 aa  43.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.572147  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1787  glutaredoxin  32.91 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.75758  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0256  glutaredoxin  31.65 
 
 		 86 aa  43.5  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.296093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0847  glutaredoxin  29.11 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.352603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07400  glutaredoxin-like protein  36.36 
 
 		 82 aa  42.7  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1250  glutaredoxin  29.49 
 
 		 83 aa  42.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.461543  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2053  hypothetical protein  28.41 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2289  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.53 
 
 		 252 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.497964  normal  0.298446 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01821  putative glutathione S-transferase  33.33 
 
 		 239 aa  41.2  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0879846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29981  predicted protein  31.17 
 
 		 311 aa  40.8  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0281173  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1478  putative glutathione S-transferase  33.33 
 
 		 239 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.184026  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11170  glutaredoxin  35.21 
 
 		 78 aa  40.4  0.008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7384  glutaredoxin protein  30.59 
 
 		 99 aa  40.4  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.405165  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3505  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.49 
 
 		 229 aa  40  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>