115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2952 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_2952  glutaredoxin-like protein NrdH  100 
 
 
73 aa  153  6e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.794387  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0314  glutaredoxin-like protein nrdH  90.41 
 
 
73 aa  141  4e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.24062  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0290  glutaredoxin-like protein nrdH  90.41 
 
 
115 aa  139  9.999999999999999e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0883091  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7384  glutaredoxin protein  73.97 
 
 
99 aa  124  4.0000000000000003e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.405165  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3500  glutaredoxin-like protein NrdH  71.23 
 
 
73 aa  116  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.855754 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0521  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  67.12 
 
 
73 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.317341  normal  0.144081 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3795  glutaredoxin-like protein NrdH  68.49 
 
 
73 aa  114  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2439  glutaredoxin-like protein NrdH  68.49 
 
 
79 aa  114  3.9999999999999997e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.354839  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4375  glutaredoxin-like protein NrdH  65.75 
 
 
73 aa  111  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.509637 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10180  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  65.75 
 
 
81 aa  112  3e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.521827  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0803  glutaredoxin-like protein NrdH  68.49 
 
 
79 aa  111  4.0000000000000004e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.815074 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0354  glutaredoxin-like protein NrdH  63.01 
 
 
74 aa  110  6e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1753  glutaredoxin-like protein NrdH  64.38 
 
 
80 aa  108  3e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0638832 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13069  glutaredoxin-like electron transport protein nrdH  64.38 
 
 
79 aa  105  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.193738 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1815  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  64.79 
 
 
83 aa  104  5e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.389601  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1862  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  64.79 
 
 
83 aa  104  5e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.150892 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1796  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  64.79 
 
 
83 aa  104  5e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.297213  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4307  glutaredoxin-like protein NrdH  67.61 
 
 
98 aa  103  5e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3453  glutaredoxin-like protein NrdH  63.01 
 
 
81 aa  104  5e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1065  glutaredoxin-related protein NrdH  58.33 
 
 
78 aa  103  9e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0223724  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3540  glutaredoxin-related protein NrdH  58.33 
 
 
78 aa  103  9e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00255736  hitchhiker  0.0090017 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1119  glutaredoxin-like protein NrdH  58.33 
 
 
78 aa  103  9e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.556674  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3291  glutaredoxin-like protein NrdH  63.01 
 
 
77 aa  102  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3721  glutaredoxin-like protein NrdH  58.9 
 
 
78 aa  103  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.75993  normal 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4923  glutaredoxin-like protein NrdH  61.64 
 
 
80 aa  102  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2040  glutaredoxin-like protein NrdH  65.28 
 
 
83 aa  102  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.672826 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0446  glutaredoxin-like protein NrdH  65.75 
 
 
81 aa  102  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2119  glutaredoxin-like protein NrdH  60.27 
 
 
81 aa  100  5e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000183339 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2358  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  61.43 
 
 
81 aa  99.4  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.543231  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3131  glutaredoxin-like protein NrdH  54.17 
 
 
79 aa  99.8  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0377  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  58.11 
 
 
74 aa  98.6  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1148  glutaredoxin-like protein NrdH  54.17 
 
 
79 aa  98.2  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2971  glutaredoxin-like protein NrdH  58.33 
 
 
82 aa  98.2  3e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.454074  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0095  glutaredoxin-like protein NrdH  57.53 
 
 
83 aa  98.2  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.729355  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2421  glutaredoxin-like protein NrdH  65.28 
 
 
77 aa  95.9  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24930  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  60.29 
 
 
80 aa  95.1  3e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.515104  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5535  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  57.75 
 
 
81 aa  94.4  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.038319  hitchhiker  0.0000122398 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10470  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  57.97 
 
 
81 aa  91.3  4e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00700177  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3153  glutaredoxin-like protein  45.83 
 
 
84 aa  87.8  5e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00125974  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0563  glutaredoxin-like protein NrdH  53.42 
 
 
76 aa  86.3  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.629127  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3005  glutaredoxin-like protein  45.83 
 
 
81 aa  82.4  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00424268 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2988  glutaredoxin-like protein  45.83 
 
 
81 aa  82.4  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0820177 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2953  glutaredoxin-like protein  45.83 
 
 
81 aa  82.4  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0443282  normal  0.0122925 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2922  glutaredoxin-like protein  45.83 
 
 
81 aa  82.4  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3111  glutaredoxin-like protein  45.83 
 
 
81 aa  82.4  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.530275  normal  0.463603 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0179  glutaredoxin  41.1 
 
 
86 aa  82.4  0.000000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1014  glutaredoxin  54.17 
 
 
77 aa  82.4  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02529  glutaredoxin-like protein  44.44 
 
 
81 aa  80.9  0.000000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1010  glutaredoxin-like protein NrdH  44.44 
 
 
81 aa  80.9  0.000000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2809  glutaredoxin-like protein  44.44 
 
 
81 aa  80.9  0.000000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1033  glutaredoxin-like protein  44.44 
 
 
81 aa  80.9  0.000000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2795  glutaredoxin-like protein  44.44 
 
 
81 aa  80.9  0.000000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0109554 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3206  glutaredoxin-like protein  44.44 
 
 
81 aa  80.9  0.000000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3917  glutaredoxin-like protein  44.44 
 
 
81 aa  80.9  0.000000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0970287 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02493  hypothetical protein  44.44 
 
 
81 aa  80.9  0.000000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4274  glutaredoxin-like protein NrdH  55.38 
 
 
92 aa  77.8  0.00000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1460  glutaredoxin  39.73 
 
 
88 aa  76.3  0.0000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0253  glutaredoxin-like protein  39.73 
 
 
76 aa  62  0.000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0820  ribonucleoside-diphosphate reductase 2, NrdH-redoxin  34.29 
 
 
74 aa  61.6  0.000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.959383  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4400  glutaredoxin  35.9 
 
 
88 aa  61.6  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00125164  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4233  glutaredoxin  37.5 
 
 
90 aa  59.3  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00450128  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0880  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  34.29 
 
 
73 aa  57.8  0.00000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.121758  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1247  glutaredoxin  32.31 
 
 
74 aa  57.4  0.00000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000466466  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0139  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  37.31 
 
 
81 aa  55.5  0.0000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1063  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  35.21 
 
 
72 aa  55.1  0.0000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000290515  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4639  glutaredoxin  37.14 
 
 
88 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2145  glutaredoxin  32.89 
 
 
83 aa  51.6  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.201454  normal  0.150522 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2285  glutaredoxin  32.89 
 
 
83 aa  51.6  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.304987 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28890  hypothetical protein  36.36 
 
 
285 aa  50.4  0.000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.998422  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0451  hypothetical protein  39.29 
 
 
255 aa  49.7  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0324  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  33.33 
 
 
73 aa  49.7  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0101839  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3049  glutaredoxin  40.85 
 
 
391 aa  48.9  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3219  YruB family glutaredoxin-like protein  33.78 
 
 
82 aa  49.7  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.890073 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0235  YruB family glutaredoxin-like protein  34.25 
 
 
76 aa  48.9  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000377018  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0982  glutaredoxin  34.29 
 
 
116 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1508  glutaredoxin  30 
 
 
76 aa  48.1  0.00004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000114631  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5356  glutaredoxin 3  35.21 
 
 
92 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460524  normal  0.957848 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0566  glutaredoxin family protein  33.82 
 
 
83 aa  47.4  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.113719  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1508  glutaredoxin-like protein protein, YruB  35.14 
 
 
81 aa  47.4  0.00007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00379246  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0758  glutaredoxin family protein  31.75 
 
 
112 aa  45.4  0.0002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0808  glutaredoxin 3  35.38 
 
 
87 aa  45.8  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.166784  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1790  glutaredoxin 3  38.46 
 
 
89 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1555  glutaredoxin  33.33 
 
 
87 aa  44.3  0.0006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000316577  normal  0.150299 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1737  glutaredoxin GrxC  33.33 
 
 
87 aa  44.3  0.0006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0513723  normal  0.163963 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1082  glutaredoxin  31.43 
 
 
116 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.976199  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2019  glutaredoxin GrxC  32.81 
 
 
87 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.908829  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0296  glutaredoxin GrxC  32.81 
 
 
86 aa  42.4  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2749  YruB family glutaredoxin-like protein  34.29 
 
 
77 aa  42.4  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2435  YruB family glutaredoxin-like protein  34.29 
 
 
77 aa  42.4  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1772  glutaredoxin-like protein  40 
 
 
89 aa  42.7  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.16885  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0368  glutaredoxin 3  32.26 
 
 
85 aa  42.7  0.002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0084  glutaredoxin  33.8 
 
 
384 aa  42.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.833578  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1859  glutaredoxin 3  32.81 
 
 
87 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.543286  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1944  glutaredoxin 3  32.81 
 
 
87 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.30403  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1264  glutaredoxin NrdH  31.34 
 
 
70 aa  41.6  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0898475  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2214  peroxiredoxin family protein/glutaredoxin  33.87 
 
 
247 aa  42  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4052  glutaredoxin  28.95 
 
 
88 aa  42  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1830  glutaredoxin  31.51 
 
 
118 aa  42  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0383849  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05131  putative arsenate reductase  31.25 
 
 
118 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.129229  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3634  hypothetical protein  28 
 
 
124 aa  41.2  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.466049  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>