126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0256 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0256  glutaredoxin  100 
 
 
86 aa  173  9e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.296093  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2423  glutaredoxin  70.24 
 
 
85 aa  129  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0847  glutaredoxin  75.31 
 
 
84 aa  125  1.0000000000000001e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.352603  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1787  glutaredoxin  69.14 
 
 
84 aa  117  3.9999999999999996e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.75758  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1175  glutaredoxin  61.73 
 
 
82 aa  107  6e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0554  glutaredoxin  56.41 
 
 
78 aa  89.7  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2625  glutaredoxin  52.56 
 
 
86 aa  86.7  9e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.253894  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2946  glutaredoxin  52.56 
 
 
78 aa  84.3  5e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.758078  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2107  glutaredoxin  46.25 
 
 
94 aa  84  7e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.367569  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0406  glutaredoxin  47.62 
 
 
86 aa  77.8  0.00000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.394009  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0048  glutaredoxin  46.84 
 
 
105 aa  77  0.00000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2348  glutaredoxin  48.68 
 
 
79 aa  75.5  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0181488 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1712  glutaredoxin  47.44 
 
 
114 aa  74.3  0.0000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.266402  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0886  glutaredoxin  42.35 
 
 
87 aa  73.9  0.0000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.289839  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26662  predicted protein  46.84 
 
 
317 aa  58.5  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2053  hypothetical protein  47.13 
 
 
87 aa  58.2  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1899  glutaredoxin  32.93 
 
 
123 aa  57  0.00000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.508072 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29383  predicted protein  41.25 
 
 
309 aa  55.5  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.066564  normal  0.454968 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0827  putative glutaredoxin  31.65 
 
 
89 aa  54.7  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2195  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.35 
 
 
284 aa  53.1  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0169  glutaredoxin  41.86 
 
 
402 aa  53.5  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1714  hypothetical protein  33.75 
 
 
123 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2758  glutaredoxin  36.25 
 
 
118 aa  51.6  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.334545  normal  0.0243575 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42020  hypothetical protein  30.59 
 
 
123 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3567  hypothetical protein  30.59 
 
 
123 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2745  glutaredoxin  32.1 
 
 
122 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0841717  normal  0.856746 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0500  Glutathione S-transferase domain  41.56 
 
 
222 aa  48.9  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0342057 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3239  hypothetical protein  38.37 
 
 
90 aa  48.5  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45400  predicted protein  34.15 
 
 
342 aa  48.5  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11170  glutaredoxin  35.8 
 
 
78 aa  48.5  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001457  glutaredoxin  32.05 
 
 
119 aa  48.1  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2797  hypothetical protein  31.65 
 
 
118 aa  47.8  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3222  glutaredoxin  32.91 
 
 
115 aa  47.8  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4059  glutaredoxin  30.12 
 
 
130 aa  47.4  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3049  glutaredoxin  41.27 
 
 
391 aa  47  0.00008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1282  Glutathione S-transferase domain protein  39.74 
 
 
225 aa  47  0.00009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2214  peroxiredoxin family protein/glutaredoxin  33.75 
 
 
247 aa  47  0.00009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1830  glutaredoxin  34.18 
 
 
118 aa  47  0.00009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0383849  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1562  glutaredoxin  31.65 
 
 
118 aa  46.2  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1058  glutathione S-transferase family protein  37.8 
 
 
217 aa  46.2  0.0002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.407682  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4017  glutathione S-transferase-like  38.36 
 
 
232 aa  45.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.678212 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01821  putative glutathione S-transferase  34.67 
 
 
239 aa  45.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0879846  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1501  hypothetical protein  30.77 
 
 
398 aa  45.8  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.226157 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07400  glutaredoxin-like protein  39.76 
 
 
82 aa  45.8  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2357  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.37 
 
 
238 aa  46.2  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.396368  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5304  glutaredoxin  32.91 
 
 
148 aa  45.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1540  ATP-dependent helicase HrpB  32.91 
 
 
121 aa  45.1  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12420  glutaredoxin-like protein  38.55 
 
 
82 aa  45.1  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2410  glutaredoxin  26.83 
 
 
123 aa  45.4  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.786564  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2579  glutaredoxin  31.65 
 
 
118 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.201508 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1400  glutaredoxin  31.25 
 
 
123 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.111122  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1822  glutaredoxin  31.65 
 
 
123 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0545572  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2863  putative lignin beta-etherase  40 
 
 
222 aa  44.7  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.300835  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2417  glutaredoxin  30.38 
 
 
118 aa  45.1  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.656384  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2487  glutaredoxin  30.38 
 
 
118 aa  45.1  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0780124  normal  0.16751 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3889  glutaredoxin  31.65 
 
 
123 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.280842 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03468  glutaredoxin 3  32.26 
 
 
83 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0095  glutaredoxin 3  32.26 
 
 
83 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3822  glutaredoxin 3  32.26 
 
 
83 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4114  glutaredoxin 3  32.26 
 
 
83 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0098  glutaredoxin 3  32.26 
 
 
83 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3947  glutaredoxin 3  32.26 
 
 
83 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.824691 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4038  glutaredoxin 3  32.26 
 
 
83 aa  44.7  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4983  glutaredoxin 3  32.26 
 
 
83 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03419  hypothetical protein  32.26 
 
 
83 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2034  hypothetical protein  31.25 
 
 
125 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144107  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0139  glutaredoxin-like region  32 
 
 
247 aa  44.3  0.0006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.406414  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0816  putative glutaredoxin  30 
 
 
119 aa  44.3  0.0006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0406  glutaredoxin  39.29 
 
 
383 aa  44.3  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0240048  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3690  glutaredoxin 3  35.48 
 
 
87 aa  43.5  0.0009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.059145 
 
 
-
 
NC_004310  BR1876  glutaredoxin 3  33.87 
 
 
88 aa  43.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1608  glutaredoxin  36.92 
 
 
81 aa  42.7  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0528934  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2749  YruB family glutaredoxin-like protein  40.74 
 
 
77 aa  43.5  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2435  YruB family glutaredoxin-like protein  40.74 
 
 
77 aa  43.5  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1501  glutaredoxin  31.65 
 
 
118 aa  43.5  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.676522  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1807  glutaredoxin 3  33.87 
 
 
88 aa  43.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.433283  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05393  hypothetical protein  30 
 
 
119 aa  43.5  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1598  glutaredoxin  29.63 
 
 
118 aa  43.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.328495  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1387  glutaredoxin  32.47 
 
 
77 aa  43.1  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.252635  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2618  glutathione S-transferase domain protein  35.96 
 
 
236 aa  43.5  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0556  glutaredoxin  34.18 
 
 
77 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0146434  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002319  peroxiredoxin family protein/glutaredoxin  35.59 
 
 
242 aa  42.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1478  putative glutathione S-transferase  33.33 
 
 
239 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.184026  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0788  glutathione S-transferase  38.96 
 
 
264 aa  42.4  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.200068 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2005  glutaredoxin  29.11 
 
 
118 aa  42.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.916013  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1250  glutaredoxin  33.75 
 
 
83 aa  42.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.461543  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4244  glutaredoxin 3  30.65 
 
 
86 aa  42.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.119016 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1977  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.71 
 
 
222 aa  42.4  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290176  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00036  glutaredoxin  35.59 
 
 
242 aa  42.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0488  glutaredoxin-family domain protein  32.43 
 
 
243 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.191714  normal  0.360445 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1430  glutaredoxin  30 
 
 
123 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.11658  normal  0.297548 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0474  glutaredoxin-family domain protein  32.43 
 
 
243 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1844  hypothetical protein  28.75 
 
 
121 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.322707 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3472  glutaredoxin family protein  26.67 
 
 
243 aa  42  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.99974  normal  0.318929 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3628  glutaredoxin  26.25 
 
 
118 aa  42  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0136  hybrid peroxiredoxin hyPrx5  29.49 
 
 
243 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0117  hybrid peroxiredoxin hyPrx5  29.49 
 
 
243 aa  42  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4080  glutaredoxin family protein  29.49 
 
 
243 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1032  glutaredoxin  32.91 
 
 
130 aa  41.2  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.783959  normal  0.67876 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0084  glutaredoxin  35.48 
 
 
384 aa  41.6  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.833578  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>