58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1598 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_1598  glutaredoxin  100 
 
 		 118 aa  246  7e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.328495  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1830  glutaredoxin  70.34 
 
 		 118 aa  192  1e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0383849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2758  glutaredoxin  69.49 
 
 		 118 aa  192  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.334545  normal  0.0243575 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2417  glutaredoxin  70.34 
 
 		 118 aa  191  3e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.656384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2487  glutaredoxin  70.34 
 
 		 118 aa  191  3e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0780124  normal  0.16751 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1562  glutaredoxin  70.34 
 
 		 118 aa  190  4e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2797  hypothetical protein  71.19 
 
 		 118 aa  190  5e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2579  glutaredoxin  69.49 
 
 		 118 aa  189  7e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.201508 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1710  glutaredoxin  68.64 
 
 		 118 aa  186  7e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.382993  normal  0.506968 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1688  glutaredoxin  68.64 
 
 		 118 aa  186  8e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2669  glutaredoxin  67.8 
 
 		 118 aa  184  2e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0368347  normal  0.0510929 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1673  glutaredoxin  67.8 
 
 		 118 aa  184  2e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1501  glutaredoxin  63.56 
 
 		 118 aa  175  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.676522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3628  glutaredoxin  64.41 
 
 		 118 aa  174  3e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1594  glutaredoxin  59.32 
 
 		 118 aa  168  3e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2005  glutaredoxin  58.47 
 
 		 118 aa  160  5.0000000000000005e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.916013  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001457  glutaredoxin  50.42 
 
 		 119 aa  145  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05393  hypothetical protein  47.9 
 
 		 119 aa  140  4e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0816  putative glutaredoxin  52.54 
 
 		 119 aa  140  9e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2745  glutaredoxin  47.41 
 
 		 122 aa  131  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0841717  normal  0.856746 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3567  hypothetical protein  48.28 
 
 		 123 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1540  ATP-dependent helicase HrpB  51.26 
 
 		 121 aa  125  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42020  hypothetical protein  46.55 
 
 		 123 aa  122  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1714  hypothetical protein  49.59 
 
 		 123 aa  122  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1430  glutaredoxin  43.97 
 
 		 123 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.11658  normal  0.297548 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2410  glutaredoxin  44.83 
 
 		 123 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.786564  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3889  glutaredoxin  43.97 
 
 		 123 aa  118  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.280842 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1822  glutaredoxin  43.97 
 
 		 123 aa  118  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0545572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1400  glutaredoxin  43.1 
 
 		 123 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.111122  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3634  hypothetical protein  46.09 
 
 		 124 aa  118  3.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.466049  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2034  hypothetical protein  44.54 
 
 		 125 aa  111  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144107  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1899  glutaredoxin  43.59 
 
 		 123 aa  108  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.508072 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0167  glutaredoxin family protein  40.17 
 
 		 130 aa  107  8.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.08495 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1844  hypothetical protein  42.02 
 
 		 121 aa  106  9.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.322707 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1103  glutaredoxin family protein  41.88 
 
 		 130 aa  104  5e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000207624  normal  0.596308 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0951  glutaredoxin  39.2 
 
 		 147 aa  100  6e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.40724  normal  0.0261252 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4059  glutaredoxin  40.17 
 
 		 130 aa  100  9e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2379  glutaredoxin family protein  38.46 
 
 		 130 aa  96.3  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.272824  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1032  glutaredoxin  40.17 
 
 		 130 aa  95.5  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.783959  normal  0.67876 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3222  glutaredoxin  37.89 
 
 		 115 aa  84.7  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0213  glutaredoxin  39.29 
 
 		 118 aa  75.1  0.0000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.989623  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0827  putative glutaredoxin  41.56 
 
 		 89 aa  71.6  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12420  glutaredoxin-like protein  33.75 
 
 		 82 aa  54.3  0.0000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1950  glutaredoxin  40.54 
 
 		 80 aa  53.9  0.0000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000181605  normal  0.405053 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119472  Carotenoid dioxygenase plastidic fusion protein, putative  35.9 
 
 		 914 aa  52  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0452333  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29383  predicted protein  28.75 
 
 		 309 aa  47.8  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.066564  normal  0.454968 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0976  glutaredoxin  33.72 
 
 		 105 aa  47.4  0.00007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2423  glutaredoxin  29.63 
 
 		 85 aa  46.2  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5304  glutaredoxin  28 
 
 		 148 aa  44.7  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1084  glutaredoxin  36 
 
 		 103 aa  43.9  0.0007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0886  glutaredoxin  29.89 
 
 		 87 aa  43.9  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.289839  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0256  glutaredoxin  29.63 
 
 		 86 aa  43.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.296093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1387  glutaredoxin  28.36 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.252635  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07400  glutaredoxin-like protein  31.65 
 
 		 82 aa  42  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1175  glutaredoxin  27.16 
 
 		 82 aa  42  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2899  glutaredoxin-like protein, YruB-family  26.92 
 
 		 81 aa  41.2  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1578  glutaredoxin 2  31.17 
 
 		 215 aa  40.4  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2195  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.17 
 
 		 284 aa  40  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>