61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_07400 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_07400  glutaredoxin-like protein  100 
 
 		 82 aa  169  1e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11170  glutaredoxin  45.68 
 
 		 78 aa  80.5  0.000000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1950  glutaredoxin  47.44 
 
 		 80 aa  72  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000181605  normal  0.405053 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12420  glutaredoxin-like protein  49.32 
 
 		 82 aa  63.9  0.0000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1387  glutaredoxin  37.5 
 
 		 77 aa  61.6  0.000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.252635  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0976  glutaredoxin  37.33 
 
 		 105 aa  61.2  0.000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1084  glutaredoxin  41.1 
 
 		 103 aa  57.8  0.00000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0827  putative glutaredoxin  37.35 
 
 		 89 aa  55.1  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2745  glutaredoxin  39.24 
 
 		 122 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0841717  normal  0.856746 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1540  ATP-dependent helicase HrpB  38.1 
 
 		 121 aa  52.4  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0816  putative glutaredoxin  40.51 
 
 		 119 aa  52.4  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3634  hypothetical protein  41.25 
 
 		 124 aa  51.6  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.466049  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0167  glutaredoxin family protein  44.3 
 
 		 130 aa  51.2  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.08495 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2379  glutaredoxin family protein  37.35 
 
 		 130 aa  51.2  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.272824  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1430  glutaredoxin  36.36 
 
 		 123 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.11658  normal  0.297548 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3567  hypothetical protein  33.75 
 
 		 123 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4059  glutaredoxin  37.8 
 
 		 130 aa  49.7  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29383  predicted protein  39.47 
 
 		 309 aa  50.1  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.066564  normal  0.454968 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1714  hypothetical protein  34.62 
 
 		 123 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42020  hypothetical protein  33.75 
 
 		 123 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001457  glutaredoxin  37.18 
 
 		 119 aa  48.5  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2034  hypothetical protein  37.18 
 
 		 125 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144107  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1175  glutaredoxin  37.97 
 
 		 82 aa  48.1  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1899  glutaredoxin  35 
 
 		 123 aa  47.4  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.508072 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2797  hypothetical protein  37.66 
 
 		 118 aa  47.4  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1844  hypothetical protein  37.18 
 
 		 121 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.322707 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3889  glutaredoxin  35.06 
 
 		 123 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.280842 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1822  glutaredoxin  35.06 
 
 		 123 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0545572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1400  glutaredoxin  35.06 
 
 		 123 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.111122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05393  hypothetical protein  39.47 
 
 		 119 aa  47  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3222  glutaredoxin  39.74 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0256  glutaredoxin  39.76 
 
 		 86 aa  45.8  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.296093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2410  glutaredoxin  32.5 
 
 		 123 aa  45.4  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.786564  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1032  glutaredoxin  38.27 
 
 		 130 aa  45.1  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.783959  normal  0.67876 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0847  glutaredoxin  39.24 
 
 		 84 aa  44.7  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.352603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2417  glutaredoxin  35.06 
 
 		 118 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.656384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2487  glutaredoxin  35.06 
 
 		 118 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0780124  normal  0.16751 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1787  glutaredoxin  38.55 
 
 		 84 aa  43.9  0.0007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.75758  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2579  glutaredoxin  33.77 
 
 		 118 aa  43.9  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.201508 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0406  glutaredoxin  32.81 
 
 		 383 aa  43.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0240048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2669  glutaredoxin  37.66 
 
 		 118 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0368347  normal  0.0510929 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2423  glutaredoxin  35.44 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1688  glutaredoxin  37.66 
 
 		 118 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1710  glutaredoxin  37.66 
 
 		 118 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.382993  normal  0.506968 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1673  glutaredoxin  37.66 
 
 		 118 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1562  glutaredoxin  36.36 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0213  glutaredoxin  37.35 
 
 		 118 aa  42.7  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.989623  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1250  glutaredoxin  30.67 
 
 		 83 aa  42.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.461543  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2005  glutaredoxin  38.46 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.916013  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1501  glutaredoxin  36.36 
 
 		 118 aa  42.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.676522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1598  glutaredoxin  31.65 
 
 		 118 aa  42  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.328495  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1501  hypothetical protein  29.73 
 
 		 398 aa  41.6  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.226157 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0738  glutaredoxin GrxC  33.33 
 
 		 88 aa  41.6  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.218135  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4088  glutaredoxin 3  28.57 
 
 		 83 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3920  glutaredoxin 3  28.57 
 
 		 83 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4027  glutaredoxin 3  28.57 
 
 		 83 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3982  glutaredoxin 3  28.57 
 
 		 83 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.592495  normal  0.830419 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1103  glutaredoxin family protein  31.33 
 
 		 130 aa  40.8  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000207624  normal  0.596308 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0554  glutaredoxin  38.96 
 
 		 78 aa  40.8  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2946  glutaredoxin  31.65 
 
 		 78 aa  40.4  0.008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.758078  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2758  glutaredoxin  33.33 
 
 		 118 aa  40  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.334545  normal  0.0243575 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>