79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1562 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1562  glutaredoxin  100 
 
 		 118 aa  244  2e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2797  hypothetical protein  88.98 
 
 		 118 aa  219  9e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2579  glutaredoxin  87.29 
 
 		 118 aa  219  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.201508 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2487  glutaredoxin  87.29 
 
 		 118 aa  219  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0780124  normal  0.16751 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2417  glutaredoxin  87.29 
 
 		 118 aa  219  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.656384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1688  glutaredoxin  87.29 
 
 		 118 aa  218  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1710  glutaredoxin  87.29 
 
 		 118 aa  218  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.382993  normal  0.506968 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1673  glutaredoxin  86.44 
 
 		 118 aa  216  6e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2669  glutaredoxin  86.44 
 
 		 118 aa  216  6e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0368347  normal  0.0510929 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1830  glutaredoxin  74.58 
 
 		 118 aa  198  1.9999999999999998e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0383849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2758  glutaredoxin  71.19 
 
 		 118 aa  192  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.334545  normal  0.0243575 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1598  glutaredoxin  70.34 
 
 		 118 aa  190  4e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.328495  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1501  glutaredoxin  68.64 
 
 		 118 aa  180  7e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.676522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1594  glutaredoxin  67.8 
 
 		 118 aa  175  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3628  glutaredoxin  68.64 
 
 		 118 aa  172  1.9999999999999998e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2005  glutaredoxin  66.95 
 
 		 118 aa  169  7.999999999999999e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.916013  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001457  glutaredoxin  59.66 
 
 		 119 aa  154  4e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05393  hypothetical protein  57.14 
 
 		 119 aa  149  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0816  putative glutaredoxin  50.85 
 
 		 119 aa  132  9.999999999999999e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3634  hypothetical protein  51.72 
 
 		 124 aa  133  9.999999999999999e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.466049  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1540  ATP-dependent helicase HrpB  56.9 
 
 		 121 aa  128  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3567  hypothetical protein  52.59 
 
 		 123 aa  124  6e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2745  glutaredoxin  51.72 
 
 		 122 aa  122  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0841717  normal  0.856746 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2410  glutaredoxin  47.93 
 
 		 123 aa  122  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.786564  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1899  glutaredoxin  48.72 
 
 		 123 aa  120  7e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.508072 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42020  hypothetical protein  50.86 
 
 		 123 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1430  glutaredoxin  46.55 
 
 		 123 aa  118  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.11658  normal  0.297548 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1822  glutaredoxin  47.41 
 
 		 123 aa  115  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0545572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3889  glutaredoxin  47.41 
 
 		 123 aa  115  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.280842 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1400  glutaredoxin  46.55 
 
 		 123 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.111122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1714  hypothetical protein  49.59 
 
 		 123 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0951  glutaredoxin  45.6 
 
 		 147 aa  114  6e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.40724  normal  0.0261252 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0167  glutaredoxin family protein  46.15 
 
 		 130 aa  110  6e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.08495 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1032  glutaredoxin  45.69 
 
 		 130 aa  108  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.783959  normal  0.67876 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1103  glutaredoxin family protein  43.59 
 
 		 130 aa  107  7.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000207624  normal  0.596308 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4059  glutaredoxin  43.59 
 
 		 130 aa  106  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2034  hypothetical protein  41.18 
 
 		 125 aa  101  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144107  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2379  glutaredoxin family protein  41.88 
 
 		 130 aa  99.4  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.272824  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1844  hypothetical protein  41.18 
 
 		 121 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.322707 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3222  glutaredoxin  46.32 
 
 		 115 aa  97.1  8e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0827  putative glutaredoxin  53.85 
 
 		 89 aa  85.5  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0213  glutaredoxin  44.05 
 
 		 118 aa  79.3  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.989623  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12420  glutaredoxin-like protein  41.03 
 
 		 82 aa  66.6  0.0000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5304  glutaredoxin  38.16 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0976  glutaredoxin  38.27 
 
 		 105 aa  58.5  0.00000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1950  glutaredoxin  44.16 
 
 		 80 aa  56.6  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000181605  normal  0.405053 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2423  glutaredoxin  32.91 
 
 		 85 aa  55.5  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2195  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.59 
 
 		 284 aa  50.8  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1175  glutaredoxin  31.65 
 
 		 82 aa  50.8  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1387  glutaredoxin  34.72 
 
 		 77 aa  50.4  0.000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.252635  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1787  glutaredoxin  33.75 
 
 		 84 aa  50.4  0.000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.75758  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119472  Carotenoid dioxygenase plastidic fusion protein, putative  31 
 
 		 914 aa  48.9  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0452333  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1084  glutaredoxin  34.57 
 
 		 103 aa  48.5  0.00003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11170  glutaredoxin  36.84 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0256  glutaredoxin  31.65 
 
 		 86 aa  46.2  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.296093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29383  predicted protein  35.8 
 
 		 309 aa  46.2  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.066564  normal  0.454968 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000623  glutaredoxin 2  42.67 
 
 		 209 aa  45.8  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0245  glutaredoxin 2  41.33 
 
 		 218 aa  44.7  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0847  glutaredoxin  29.11 
 
 		 84 aa  44.3  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.352603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1250  glutaredoxin  29.27 
 
 		 83 aa  43.9  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.461543  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2053  hypothetical protein  30.68 
 
 		 87 aa  43.9  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0886  glutaredoxin  30 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.289839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07400  glutaredoxin-like protein  36.36 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1651  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.25 
 
 		 261 aa  42.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.491053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1777  YruB family glutaredoxin-like protein  34.55 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.110535  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06497  glutaredoxin 2  41.33 
 
 		 209 aa  42.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1719  YruB family glutaredoxin-like protein  34.55 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2348  glutaredoxin  33.75 
 
 		 79 aa  41.6  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0181488 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0343  putative glutathione S-transferase  32.89 
 
 		 241 aa  42  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.889809  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0314  glutaredoxin-like protein nrdH  30.14 
 
 		 73 aa  41.6  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.24062  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0290  glutaredoxin-like protein nrdH  29.87 
 
 		 115 aa  42  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0883091  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1562  glutathione S-transferase related protein  29.33 
 
 		 198 aa  40.4  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.572147  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45400  predicted protein  27.38 
 
 		 342 aa  40.8  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1402  glutaredoxin 3  28.99 
 
 		 85 aa  40.8  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2145  glutaredoxin  27.03 
 
 		 83 aa  40.4  0.008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.201454  normal  0.150522 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2285  glutaredoxin  27.03 
 
 		 83 aa  40.4  0.008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.304987 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01251  putative glutathione S-transferase  29.73 
 
 		 241 aa  40  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.621374 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2798  glutaredoxin 2  32.47 
 
 		 215 aa  40  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.848662  normal  0.112338 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0296  glutathione S-transferase-like protein  26.32 
 
 		 214 aa  40  0.01  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.351442  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>