59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3628 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_3628  glutaredoxin  100 
 
 		 118 aa  243  8e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1501  glutaredoxin  71.19 
 
 		 118 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.676522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2579  glutaredoxin  72.88 
 
 		 118 aa  179  9.000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.201508 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2797  hypothetical protein  71.19 
 
 		 118 aa  177  4e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2487  glutaredoxin  70.34 
 
 		 118 aa  176  1e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0780124  normal  0.16751 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2417  glutaredoxin  70.34 
 
 		 118 aa  176  1e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.656384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1598  glutaredoxin  64.41 
 
 		 118 aa  174  3e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.328495  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1830  glutaredoxin  67.8 
 
 		 118 aa  174  4e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0383849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2758  glutaredoxin  66.95 
 
 		 118 aa  174  5e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.334545  normal  0.0243575 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1562  glutaredoxin  68.64 
 
 		 118 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1594  glutaredoxin  66.95 
 
 		 118 aa  171  2.9999999999999996e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1688  glutaredoxin  68.64 
 
 		 118 aa  170  7.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1710  glutaredoxin  68.64 
 
 		 118 aa  169  1e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.382993  normal  0.506968 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1673  glutaredoxin  68.38 
 
 		 118 aa  167  4e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2669  glutaredoxin  68.38 
 
 		 118 aa  167  4e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0368347  normal  0.0510929 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2005  glutaredoxin  64.41 
 
 		 118 aa  164  5.9999999999999996e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.916013  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05393  hypothetical protein  54.62 
 
 		 119 aa  142  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001457  glutaredoxin  52.94 
 
 		 119 aa  139  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0816  putative glutaredoxin  51.69 
 
 		 119 aa  135  2e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2745  glutaredoxin  53.45 
 
 		 122 aa  133  8e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0841717  normal  0.856746 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1540  ATP-dependent helicase HrpB  56.67 
 
 		 121 aa  132  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3634  hypothetical protein  51.26 
 
 		 124 aa  120  5e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.466049  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42020  hypothetical protein  47.41 
 
 		 123 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1430  glutaredoxin  46.55 
 
 		 123 aa  115  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.11658  normal  0.297548 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2410  glutaredoxin  45.45 
 
 		 123 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.786564  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1400  glutaredoxin  45.69 
 
 		 123 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.111122  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1822  glutaredoxin  44.83 
 
 		 123 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0545572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3889  glutaredoxin  44.83 
 
 		 123 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.280842 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1714  hypothetical protein  49.59 
 
 		 123 aa  114  6e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1844  hypothetical protein  47.9 
 
 		 121 aa  113  8.999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.322707 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3567  hypothetical protein  45.69 
 
 		 123 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2034  hypothetical protein  46.22 
 
 		 125 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144107  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0951  glutaredoxin  43.2 
 
 		 147 aa  111  3e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.40724  normal  0.0261252 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1103  glutaredoxin family protein  45.3 
 
 		 130 aa  110  6e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000207624  normal  0.596308 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1032  glutaredoxin  43.97 
 
 		 130 aa  106  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.783959  normal  0.67876 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1899  glutaredoxin  44.44 
 
 		 123 aa  106  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.508072 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2379  glutaredoxin family protein  43.59 
 
 		 130 aa  101  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.272824  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4059  glutaredoxin  43.97 
 
 		 130 aa  100  9e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0167  glutaredoxin family protein  41.88 
 
 		 130 aa  99.8  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.08495 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3222  glutaredoxin  43.16 
 
 		 115 aa  85.9  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0827  putative glutaredoxin  45.12 
 
 		 89 aa  69.3  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0213  glutaredoxin  34.88 
 
 		 118 aa  62.8  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.989623  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12420  glutaredoxin-like protein  36.36 
 
 		 82 aa  55.1  0.0000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29383  predicted protein  28.57 
 
 		 309 aa  53.5  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.066564  normal  0.454968 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1950  glutaredoxin  40 
 
 		 80 aa  48.9  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000181605  normal  0.405053 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5304  glutaredoxin  31.58 
 
 		 148 aa  46.2  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0847  glutaredoxin  30.86 
 
 		 84 aa  45.1  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.352603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29981  predicted protein  33.77 
 
 		 311 aa  44.3  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0281173  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0976  glutaredoxin  34.15 
 
 		 105 aa  44.3  0.0006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1250  glutaredoxin  31.71 
 
 		 83 aa  44.3  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.461543  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2423  glutaredoxin  26.25 
 
 		 85 aa  43.5  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0343  putative glutathione S-transferase  34.21 
 
 		 241 aa  43.1  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.889809  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1787  glutaredoxin  29.63 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.75758  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0256  glutaredoxin  26.25 
 
 		 86 aa  42  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.296093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11170  glutaredoxin  37.68 
 
 		 78 aa  42  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119472  Carotenoid dioxygenase plastidic fusion protein, putative  30.12 
 
 		 914 aa  41.2  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0452333  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2195  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.33 
 
 		 284 aa  41.2  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0409  Glutathione S-transferase domain protein  29.49 
 
 		 214 aa  40.4  0.009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0886  glutaredoxin  30 
 
 		 87 aa  40.4  0.009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.289839  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>