185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1250 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1250  glutaredoxin  100 
 
 		 83 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.461543  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0854  YruB family glutaredoxin-like protein  40.32 
 
 		 80 aa  63.2  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00289984  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0084  glutaredoxin  42.86 
 
 		 384 aa  59.7  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.833578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2749  YruB family glutaredoxin-like protein  43.55 
 
 		 77 aa  58.5  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2435  YruB family glutaredoxin-like protein  43.55 
 
 		 77 aa  58.5  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0343  putative glutathione S-transferase  41.67 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.889809  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1777  YruB family glutaredoxin-like protein  32.31 
 
 		 80 aa  55.8  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.110535  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1719  YruB family glutaredoxin-like protein  32.31 
 
 		 80 aa  55.1  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1103  glutaredoxin family protein  34.83 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000207624  normal  0.596308 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0169  glutaredoxin  42.86 
 
 		 402 aa  54.7  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26121  putative glutathione S-transferase  38.89 
 
 		 241 aa  53.9  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.551591 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29981  predicted protein  34.15 
 
 		 311 aa  53.1  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0281173  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2348  putative glutathione S-transferase  38.89 
 
 		 246 aa  52.8  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3049  glutaredoxin  38.71 
 
 		 391 aa  52.4  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3102  glutaredoxin 3  37.1 
 
 		 85 aa  52.8  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4059  glutaredoxin  32.95 
 
 		 130 aa  52.8  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0552  YruB family glutaredoxin-like protein  32.31 
 
 		 80 aa  52.4  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1737  glutaredoxin 3  39.34 
 
 		 85 aa  51.6  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0406  glutaredoxin  34.43 
 
 		 383 aa  52  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0240048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3209  glutaredoxin 3  37.29 
 
 		 83 aa  51.6  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.28852 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2348  glutaredoxin  41.33 
 
 		 79 aa  51.2  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0181488 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4088  glutaredoxin 3  35.29 
 
 		 83 aa  50.4  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3920  glutaredoxin 3  35.29 
 
 		 83 aa  50.4  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3982  glutaredoxin 3  35.29 
 
 		 83 aa  50.4  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.592495  normal  0.830419 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4027  glutaredoxin 3  35.29 
 
 		 83 aa  50.4  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0235  YruB family glutaredoxin-like protein  38.71 
 
 		 76 aa  50.4  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000377018  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3901  glutaredoxin 3  35.29 
 
 		 83 aa  50.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.174559 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1427  YruB family glutaredoxin-like protein  29.23 
 
 		 80 aa  50.1  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00494984  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3089  glutaredoxin 3  41.38 
 
 		 84 aa  50.1  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.393298  normal  0.343511 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1542  glutaredoxin 3  42.62 
 
 		 89 aa  49.3  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.458759  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1787  glutaredoxin  37.18 
 
 		 84 aa  49.3  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.75758  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0881  glutathione S-transferase domain protein  36.99 
 
 		 263 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0898679  normal  0.46136 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0854  Glutathione S-transferase domain protein  36.99 
 
 		 263 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3219  YruB family glutaredoxin-like protein  36.92 
 
 		 82 aa  49.7  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.890073 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04690  Dithiol-glutaredoxin protein  37.93 
 
 		 84 aa  48.1  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.981866  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1387  glutaredoxin  34.29 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.252635  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0125  glutaredoxin 3  32.35 
 
 		 82 aa  48.5  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2423  glutaredoxin  35 
 
 		 85 aa  48.5  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1071  glutathione S-transferase  37.21 
 
 		 214 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.292672  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0788  glutathione S-transferase  38.36 
 
 		 264 aa  48.1  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.200068 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2670  putative glutathione S-transferase  37.21 
 
 		 297 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0792  glutaredoxin-like protein, YruB-family  31.08 
 
 		 81 aa  48.1  0.00004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000191922  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0407  glutathione S-transferase  39.74 
 
 		 217 aa  47.8  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03468  glutaredoxin 3  32.35 
 
 		 83 aa  47  0.00009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0095  glutaredoxin 3  32.35 
 
 		 83 aa  47  0.00009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3822  glutaredoxin 3  32.35 
 
 		 83 aa  47  0.00009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4038  glutaredoxin 3  32.35 
 
 		 83 aa  47  0.00009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4114  glutaredoxin 3  32.35 
 
 		 83 aa  47  0.00009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3947  glutaredoxin 3  32.35 
 
 		 83 aa  47  0.00009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.824691 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03419  hypothetical protein  32.35 
 
 		 83 aa  47  0.00009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0098  glutaredoxin 3  32.35 
 
 		 83 aa  47  0.00009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4983  glutaredoxin 3  32.35 
 
 		 83 aa  47  0.00009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2797  hypothetical protein  32.89 
 
 		 118 aa  47  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0107  glutathione S-transferase  36.05 
 
 		 214 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0292  glutaredoxin  38.33 
 
 		 75 aa  46.6  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0496  glutaredoxin  35.59 
 
 		 84 aa  46.2  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.460095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1175  glutaredoxin  39.29 
 
 		 82 aa  46.6  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0368  glutaredoxin 3  36.84 
 
 		 85 aa  46.2  0.0001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1267  glutathione S-transferase  36.05 
 
 		 214 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261228  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1501  hypothetical protein  33.87 
 
 		 398 aa  46.2  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.226157 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2817  glutathione S-transferase  36.05 
 
 		 300 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0125  glutathione S-transferase  36.05 
 
 		 266 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1790  glutaredoxin 3  34.43 
 
 		 89 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0505  glutaredoxin-like protein, YruB-family  30.65 
 
 		 175 aa  45.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3291  glutaredoxin-like protein NrdH  44.83 
 
 		 77 aa  45.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2064  glutaredoxin  26.39 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1785  glutaredoxin-like protein  27.54 
 
 		 83 aa  45.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.593811  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2255  hypothetical protein  37.7 
 
 		 84 aa  45.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3092  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.47 
 
 		 205 aa  45.4  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.061874 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1609  glutaredoxin-like protein, YruB  29.87 
 
 		 80 aa  45.4  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.645814  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2579  glutaredoxin  32.89 
 
 		 118 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.201508 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2226  hypothetical protein  37.7 
 
 		 84 aa  45.1  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0071  glutaredoxin 3  32.35 
 
 		 82 aa  44.7  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1478  putative glutathione S-transferase  30.99 
 
 		 239 aa  44.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.184026  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0554  glutaredoxin  35.9 
 
 		 78 aa  44.7  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4139  glutaredoxin 3  32.35 
 
 		 82 aa  44.7  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.451689  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2417  glutaredoxin  31.58 
 
 		 118 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.656384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2487  glutaredoxin  31.58 
 
 		 118 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0780124  normal  0.16751 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1323  YruB family glutaredoxin-like protein  28.75 
 
 		 84 aa  44.7  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0672581  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0077  glutaredoxin 3  32.35 
 
 		 82 aa  44.7  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0645  glutathione S-transferase-like  35.9 
 
 		 225 aa  44.7  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.722095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67740  glutaredoxin  31.94 
 
 		 84 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000831594  normal  0.879837 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3310  glutaredoxin 3  36.51 
 
 		 95 aa  44.7  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.320297  normal  0.672061 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27371  glutaredoxin  36.67 
 
 		 87 aa  44.3  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.89752 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1223  putative glutaredoxin  35.82 
 
 		 77 aa  44.7  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5863  glutaredoxin  31.94 
 
 		 84 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.499641  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01251  putative glutathione S-transferase  31.88 
 
 		 241 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.621374 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0886  glutaredoxin  35.37 
 
 		 87 aa  44.3  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.289839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3628  glutaredoxin  31.71 
 
 		 118 aa  44.3  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2107  glutaredoxin  37.8 
 
 		 94 aa  44.3  0.0006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.367569  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0640  putative glutaredoxin  29.31 
 
 		 75 aa  43.9  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.189959  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1478  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.25 
 
 		 263 aa  43.9  0.0007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.204587  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0847  glutaredoxin  35.9 
 
 		 84 aa  43.9  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.352603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5040  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.72 
 
 		 221 aa  43.9  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.222458  normal  0.367084 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1562  glutaredoxin  29.27 
 
 		 118 aa  43.9  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1344  YruB family glutaredoxin-like protein  28.75 
 
 		 84 aa  44.3  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.458905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2946  glutaredoxin  35.9 
 
 		 78 aa  43.9  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.758078  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06190  putative glutathione S-transferase  45.45 
 
 		 249 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0166402 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2625  glutaredoxin  36.36 
 
 		 86 aa  43.9  0.0008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.253894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0181  glutaredoxin GrxC  32.79 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>