57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1540 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1540  ATP-dependent helicase HrpB  100 
 
 		 121 aa  248  2e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0816  putative glutaredoxin  57.5 
 
 		 119 aa  149  1e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001457  glutaredoxin  55.46 
 
 		 119 aa  143  7.0000000000000006e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05393  hypothetical protein  56.3 
 
 		 119 aa  142  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3628  glutaredoxin  56.67 
 
 		 118 aa  132  9.999999999999999e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2579  glutaredoxin  57.76 
 
 		 118 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.201508 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1562  glutaredoxin  56.9 
 
 		 118 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2417  glutaredoxin  56.9 
 
 		 118 aa  128  3e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.656384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2487  glutaredoxin  56.9 
 
 		 118 aa  128  3e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0780124  normal  0.16751 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2758  glutaredoxin  55.17 
 
 		 118 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.334545  normal  0.0243575 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2797  hypothetical protein  56.9 
 
 		 118 aa  126  9.000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2005  glutaredoxin  56.03 
 
 		 118 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.916013  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1598  glutaredoxin  51.26 
 
 		 118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.328495  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1673  glutaredoxin  55.17 
 
 		 118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1710  glutaredoxin  55.17 
 
 		 118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.382993  normal  0.506968 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1688  glutaredoxin  55.17 
 
 		 118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2669  glutaredoxin  55.17 
 
 		 118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0368347  normal  0.0510929 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2410  glutaredoxin  47.06 
 
 		 123 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.786564  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1830  glutaredoxin  52.1 
 
 		 118 aa  124  3e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0383849  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3634  hypothetical protein  49.57 
 
 		 124 aa  121  3e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.466049  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1899  glutaredoxin  48.74 
 
 		 123 aa  120  6e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.508072 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1501  glutaredoxin  53.04 
 
 		 118 aa  120  9e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.676522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42020  hypothetical protein  48.28 
 
 		 123 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2745  glutaredoxin  49.56 
 
 		 122 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0841717  normal  0.856746 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1594  glutaredoxin  51.72 
 
 		 118 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3567  hypothetical protein  47.41 
 
 		 123 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1822  glutaredoxin  46.9 
 
 		 123 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0545572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3889  glutaredoxin  46.9 
 
 		 123 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.280842 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1400  glutaredoxin  46.9 
 
 		 123 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.111122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0167  glutaredoxin family protein  44.83 
 
 		 130 aa  108  3e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.08495 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1430  glutaredoxin  46.9 
 
 		 123 aa  107  5e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.11658  normal  0.297548 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1844  hypothetical protein  47.9 
 
 		 121 aa  107  5e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.322707 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1032  glutaredoxin  46.43 
 
 		 130 aa  107  6e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.783959  normal  0.67876 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1103  glutaredoxin family protein  41.38 
 
 		 130 aa  105  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000207624  normal  0.596308 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2034  hypothetical protein  47.06 
 
 		 125 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144107  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2379  glutaredoxin family protein  41.38 
 
 		 130 aa  104  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.272824  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0951  glutaredoxin  43.75 
 
 		 147 aa  102  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.40724  normal  0.0261252 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1714  hypothetical protein  46.55 
 
 		 123 aa  102  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4059  glutaredoxin  42.24 
 
 		 130 aa  97.1  7e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3222  glutaredoxin  40.22 
 
 		 115 aa  81.3  0.000000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0827  putative glutaredoxin  44.59 
 
 		 89 aa  77.4  0.00000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0213  glutaredoxin  39.77 
 
 		 118 aa  64.7  0.0000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.989623  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1950  glutaredoxin  42.5 
 
 		 80 aa  60.8  0.000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000181605  normal  0.405053 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1387  glutaredoxin  34.57 
 
 		 77 aa  56.6  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.252635  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11170  glutaredoxin  37.04 
 
 		 78 aa  55.8  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0976  glutaredoxin  33.75 
 
 		 105 aa  53.5  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07400  glutaredoxin-like protein  38.1 
 
 		 82 aa  52.4  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1175  glutaredoxin  35.44 
 
 		 82 aa  52.4  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12420  glutaredoxin-like protein  37.66 
 
 		 82 aa  52  0.000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2423  glutaredoxin  32.91 
 
 		 85 aa  49.7  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5304  glutaredoxin  36.49 
 
 		 148 aa  48.5  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1787  glutaredoxin  34.18 
 
 		 84 aa  48.1  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.75758  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1084  glutaredoxin  32.91 
 
 		 103 aa  47.4  0.00007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0256  glutaredoxin  32.91 
 
 		 86 aa  45.1  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.296093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0847  glutaredoxin  31.65 
 
 		 84 aa  44.3  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.352603  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0556  glutaredoxin  29.51 
 
 		 77 aa  42  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0146434  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29383  predicted protein  29 
 
 		 309 aa  40.8  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.066564  normal  0.454968 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>