146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_1175 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_1175  glutaredoxin  100 
 
 
82 aa  168  2e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2423  glutaredoxin  76.54 
 
 
85 aa  127  4.0000000000000003e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0256  glutaredoxin  61.73 
 
 
86 aa  107  6e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.296093  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0847  glutaredoxin  60.98 
 
 
84 aa  99.4  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.352603  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1787  glutaredoxin  59.76 
 
 
84 aa  96.7  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.75758  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0554  glutaredoxin  51.28 
 
 
78 aa  77  0.00000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2107  glutaredoxin  51.25 
 
 
94 aa  76.3  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.367569  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2625  glutaredoxin  50 
 
 
86 aa  76.6  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.253894  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2946  glutaredoxin  46.15 
 
 
78 aa  69.7  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.758078  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0048  glutaredoxin  47.5 
 
 
105 aa  68.2  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1712  glutaredoxin  49.38 
 
 
114 aa  68.6  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.266402  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0406  glutaredoxin  47.5 
 
 
86 aa  68.2  0.00000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.394009  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2348  glutaredoxin  47.3 
 
 
79 aa  65.9  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0181488 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0886  glutaredoxin  46.15 
 
 
87 aa  65.5  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.289839  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29383  predicted protein  45.12 
 
 
309 aa  60.5  0.000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.066564  normal  0.454968 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0827  putative glutaredoxin  30.77 
 
 
89 aa  57  0.00000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2745  glutaredoxin  32.93 
 
 
122 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0841717  normal  0.856746 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1103  glutaredoxin family protein  31.71 
 
 
130 aa  55.8  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000207624  normal  0.596308 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3222  glutaredoxin  32.91 
 
 
115 aa  56.2  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1822  glutaredoxin  33.75 
 
 
123 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0545572  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0816  putative glutaredoxin  32.5 
 
 
119 aa  54.7  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1400  glutaredoxin  32.5 
 
 
123 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.111122  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3634  hypothetical protein  32.1 
 
 
124 aa  53.9  0.0000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.466049  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3889  glutaredoxin  32.91 
 
 
123 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.280842 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1899  glutaredoxin  31.71 
 
 
123 aa  53.9  0.0000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.508072 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0167  glutaredoxin family protein  32.5 
 
 
130 aa  53.1  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.08495 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1032  glutaredoxin  34.67 
 
 
130 aa  53.5  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.783959  normal  0.67876 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11170  glutaredoxin  32.05 
 
 
78 aa  53.1  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001457  glutaredoxin  30.77 
 
 
119 aa  52.4  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1540  ATP-dependent helicase HrpB  35.44 
 
 
121 aa  52.4  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42020  hypothetical protein  30.49 
 
 
123 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3567  hypothetical protein  30.49 
 
 
123 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0406  glutaredoxin  35.37 
 
 
383 aa  51.6  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0240048  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2758  glutaredoxin  32.5 
 
 
118 aa  52  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.334545  normal  0.0243575 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4059  glutaredoxin  31.25 
 
 
130 aa  51.6  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5304  glutaredoxin  31.65 
 
 
148 aa  51.6  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0951  glutaredoxin  29.11 
 
 
147 aa  51.2  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.40724  normal  0.0261252 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1562  glutaredoxin  31.65 
 
 
118 aa  50.8  0.000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05393  hypothetical protein  30 
 
 
119 aa  50.8  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1714  hypothetical protein  29.63 
 
 
123 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2005  glutaredoxin  31.65 
 
 
118 aa  50.1  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.916013  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0235  YruB family glutaredoxin-like protein  34.33 
 
 
76 aa  50.1  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000377018  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2379  glutaredoxin family protein  27.71 
 
 
130 aa  49.3  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.272824  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1430  glutaredoxin  30 
 
 
123 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.11658  normal  0.297548 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0084  glutaredoxin  38.6 
 
 
384 aa  48.5  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.833578  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1830  glutaredoxin  30.38 
 
 
118 aa  48.5  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0383849  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0976  glutaredoxin  32.05 
 
 
105 aa  48.1  0.00004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0139  glutaredoxin-like region  33.78 
 
 
247 aa  48.1  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.406414  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07400  glutaredoxin-like protein  37.97 
 
 
82 aa  48.1  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2034  hypothetical protein  29.63 
 
 
125 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144107  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1844  hypothetical protein  30.86 
 
 
121 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.322707 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4776  glutaredoxin family protein  33.78 
 
 
243 aa  47.8  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00112593 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2797  hypothetical protein  29.11 
 
 
118 aa  47.8  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3690  glutaredoxin 3  33.93 
 
 
87 aa  47.4  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.059145 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0136  hybrid peroxiredoxin hyPrx5  35.62 
 
 
243 aa  47  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0117  hybrid peroxiredoxin hyPrx5  35.62 
 
 
243 aa  47  0.00008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4080  glutaredoxin family protein  35.62 
 
 
243 aa  47  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2214  peroxiredoxin family protein/glutaredoxin  33.33 
 
 
247 aa  47  0.00009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002319  peroxiredoxin family protein/glutaredoxin  34.25 
 
 
242 aa  47  0.00009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00036  glutaredoxin  34.25 
 
 
242 aa  47  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0556  glutaredoxin  32.05 
 
 
77 aa  47  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0146434  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1250  glutaredoxin  39.29 
 
 
83 aa  46.6  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.461543  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1501  glutaredoxin  31.65 
 
 
118 aa  46.6  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.676522  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3102  glutaredoxin 3  37.5 
 
 
85 aa  46.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12420  glutaredoxin-like protein  33.75 
 
 
82 aa  46.6  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2053  hypothetical protein  36.67 
 
 
87 aa  46.6  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1084  glutaredoxin  30.49 
 
 
103 aa  45.4  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2417  glutaredoxin  30.38 
 
 
118 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.656384  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2487  glutaredoxin  30.38 
 
 
118 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0780124  normal  0.16751 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0169  glutaredoxin  34.55 
 
 
402 aa  45.8  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1688  glutaredoxin  30.38 
 
 
118 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4244  glutaredoxin 3  33.78 
 
 
86 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.119016 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0120  glutaredoxin  29.63 
 
 
90 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1710  glutaredoxin  30.38 
 
 
118 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.382993  normal  0.506968 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0044  glutaredoxin 3  38.67 
 
 
89 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.31587  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1387  glutaredoxin  31.17 
 
 
77 aa  45.4  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.252635  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2579  glutaredoxin  29.11 
 
 
118 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.201508 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1501  hypothetical protein  36.36 
 
 
398 aa  45.4  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.226157 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2669  glutaredoxin  30.77 
 
 
118 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0368347  normal  0.0510929 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1673  glutaredoxin  30.77 
 
 
118 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0077  glutaredoxin 3  35.38 
 
 
82 aa  45.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0071  glutaredoxin 3  35.38 
 
 
82 aa  45.1  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4139  glutaredoxin 3  35.38 
 
 
82 aa  45.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.451689  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0488  glutaredoxin-family domain protein  32.88 
 
 
243 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.191714  normal  0.360445 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1594  glutaredoxin  29.11 
 
 
118 aa  44.7  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3472  glutaredoxin family protein  30.77 
 
 
243 aa  45.1  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.99974  normal  0.318929 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0213  glutaredoxin  29.87 
 
 
118 aa  45.1  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.989623  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26662  predicted protein  40.24 
 
 
317 aa  44.7  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0125  glutaredoxin 3  33.78 
 
 
82 aa  44.7  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3982  glutaredoxin 3  33.78 
 
 
83 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.592495  normal  0.830419 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4027  glutaredoxin 3  33.78 
 
 
83 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3901  glutaredoxin 3  33.78 
 
 
83 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.174559 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3920  glutaredoxin 3  33.78 
 
 
83 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4088  glutaredoxin 3  33.78 
 
 
83 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0474  glutaredoxin-family domain protein  32.88 
 
 
243 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2410  glutaredoxin  27.71 
 
 
123 aa  44.7  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.786564  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2747  YruB family glutaredoxin-like protein  30.3 
 
 
75 aa  44.7  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2433  glutaredoxin  30.3 
 
 
75 aa  44.3  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2013  glutaredoxin GrxC  34.67 
 
 
88 aa  44.3  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.319354  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0035  peroxiredoxin  32.88 
 
 
238 aa  44.3  0.0006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>