81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0847 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0847  glutaredoxin  100 
 
 
84 aa  169  9e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.352603  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1787  glutaredoxin  74.39 
 
 
84 aa  126  1.0000000000000001e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.75758  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0256  glutaredoxin  75.31 
 
 
86 aa  125  1.0000000000000001e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.296093  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2423  glutaredoxin  72.62 
 
 
85 aa  124  6e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1175  glutaredoxin  60.98 
 
 
82 aa  99.4  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2107  glutaredoxin  51.9 
 
 
94 aa  87.4  6e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.367569  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2625  glutaredoxin  54.43 
 
 
86 aa  87  7e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.253894  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0554  glutaredoxin  57.89 
 
 
78 aa  85.9  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0406  glutaredoxin  51.28 
 
 
86 aa  85.5  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.394009  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2946  glutaredoxin  52.63 
 
 
78 aa  81.3  0.000000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.758078  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0886  glutaredoxin  47.5 
 
 
87 aa  79  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.289839  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2348  glutaredoxin  47.37 
 
 
79 aa  78.6  0.00000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0181488 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0048  glutaredoxin  47.44 
 
 
105 aa  75.5  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1712  glutaredoxin  45.57 
 
 
114 aa  72.4  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.266402  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29383  predicted protein  41.77 
 
 
309 aa  61.2  0.000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.066564  normal  0.454968 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1899  glutaredoxin  32.93 
 
 
123 aa  59.3  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.508072 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26662  predicted protein  42.31 
 
 
317 aa  58.9  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2053  hypothetical protein  45.98 
 
 
87 aa  57  0.00000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2745  glutaredoxin  34.15 
 
 
122 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0841717  normal  0.856746 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0827  putative glutaredoxin  33.33 
 
 
89 aa  55.5  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3222  glutaredoxin  33.75 
 
 
115 aa  51.6  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2195  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.97 
 
 
284 aa  51.6  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45400  predicted protein  37.5 
 
 
342 aa  51.2  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11170  glutaredoxin  35.44 
 
 
78 aa  50.8  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42020  hypothetical protein  30.95 
 
 
123 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1714  hypothetical protein  30.86 
 
 
123 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2758  glutaredoxin  33.75 
 
 
118 aa  49.3  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.334545  normal  0.0243575 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1830  glutaredoxin  32.91 
 
 
118 aa  49.3  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0383849  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3567  hypothetical protein  29.76 
 
 
123 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2797  hypothetical protein  31.65 
 
 
118 aa  48.5  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2410  glutaredoxin  28.05 
 
 
123 aa  48.5  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.786564  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3239  hypothetical protein  36.05 
 
 
90 aa  48.5  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001457  glutaredoxin  29.87 
 
 
119 aa  48.1  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3889  glutaredoxin  30.49 
 
 
123 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.280842 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1400  glutaredoxin  30.49 
 
 
123 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.111122  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0169  glutaredoxin  34.15 
 
 
402 aa  46.2  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1822  glutaredoxin  29.27 
 
 
123 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0545572  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0976  glutaredoxin  33.33 
 
 
105 aa  46.6  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0213  glutaredoxin  36 
 
 
118 aa  45.4  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.989623  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0788  glutathione S-transferase  41.56 
 
 
264 aa  45.8  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.200068 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1430  glutaredoxin  28.4 
 
 
123 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.11658  normal  0.297548 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5304  glutaredoxin  32.5 
 
 
148 aa  45.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1103  glutaredoxin family protein  27.71 
 
 
130 aa  45.4  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000207624  normal  0.596308 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0951  glutaredoxin  30 
 
 
147 aa  45.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.40724  normal  0.0261252 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2487  glutaredoxin  30.38 
 
 
118 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0780124  normal  0.16751 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2417  glutaredoxin  30.38 
 
 
118 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.656384  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1710  glutaredoxin  30.38 
 
 
118 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.382993  normal  0.506968 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1688  glutaredoxin  30.38 
 
 
118 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05393  hypothetical protein  27.5 
 
 
119 aa  45.4  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2034  hypothetical protein  29.27 
 
 
125 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144107  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0816  putative glutaredoxin  28.75 
 
 
119 aa  45.1  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2669  glutaredoxin  30.77 
 
 
118 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0368347  normal  0.0510929 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2618  glutathione S-transferase domain protein  39.53 
 
 
236 aa  44.7  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1673  glutaredoxin  30.77 
 
 
118 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2579  glutaredoxin  30.38 
 
 
118 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.201508 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3628  glutaredoxin  30.86 
 
 
118 aa  45.1  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07400  glutaredoxin-like protein  39.24 
 
 
82 aa  44.7  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1562  glutaredoxin  29.11 
 
 
118 aa  44.3  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4059  glutaredoxin  28.75 
 
 
130 aa  44.3  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1540  ATP-dependent helicase HrpB  31.65 
 
 
121 aa  44.3  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1250  glutaredoxin  35.9 
 
 
83 aa  43.9  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.461543  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1844  hypothetical protein  26.83 
 
 
121 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.322707 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1032  glutaredoxin  34.21 
 
 
130 aa  43.9  0.0008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.783959  normal  0.67876 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49100  glutathione S-transferase  36.47 
 
 
209 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000404937 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0406  glutaredoxin  36.92 
 
 
383 aa  43.9  0.0008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0240048  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119472  Carotenoid dioxygenase plastidic fusion protein, putative  33.77 
 
 
914 aa  43.1  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0452333  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2005  glutaredoxin  31.25 
 
 
118 aa  42.4  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.916013  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1501  glutaredoxin  29.11 
 
 
118 aa  42.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.676522  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12420  glutaredoxin-like protein  34.62 
 
 
82 aa  41.6  0.003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0167  glutaredoxin family protein  31.33 
 
 
130 aa  42  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.08495 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2435  YruB family glutaredoxin-like protein  38.89 
 
 
77 aa  41.6  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2749  YruB family glutaredoxin-like protein  38.89 
 
 
77 aa  41.6  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2379  glutaredoxin family protein  29.27 
 
 
130 aa  41.6  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.272824  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1501  hypothetical protein  34.25 
 
 
398 aa  40.8  0.006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.226157 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1950  glutaredoxin  33.33 
 
 
80 aa  41.2  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000181605  normal  0.405053 
 
 
-
 
NC_002978  WD1058  glutathione S-transferase family protein  35.8 
 
 
217 aa  40.8  0.006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.407682  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2357  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.71 
 
 
238 aa  40.4  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.396368  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2182  glutaredoxin, GrxB family  39.47 
 
 
215 aa  40.4  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.497266  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5791  glutathione S-transferase  35.29 
 
 
236 aa  40  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5058  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.06 
 
 
207 aa  40  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000892035 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3634  hypothetical protein  30.26 
 
 
124 aa  40  0.01  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.466049  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>