55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2348 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2348  glutaredoxin  100 
 
 		 79 aa  160  4.0000000000000004e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0181488 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2625  glutaredoxin  62.34 
 
 		 86 aa  106  1e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.253894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2946  glutaredoxin  58.67 
 
 		 78 aa  99  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.758078  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0554  glutaredoxin  57.33 
 
 		 78 aa  97.8  5e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2107  glutaredoxin  52.63 
 
 		 94 aa  92.8  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.367569  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0886  glutaredoxin  52.63 
 
 		 87 aa  92.4  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.289839  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0406  glutaredoxin  53.42 
 
 		 86 aa  90.1  8e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.394009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0048  glutaredoxin  49.32 
 
 		 105 aa  84.3  5e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1712  glutaredoxin  48 
 
 		 114 aa  83.6  9e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.266402  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1787  glutaredoxin  48.68 
 
 		 84 aa  79  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.75758  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0847  glutaredoxin  47.37 
 
 		 84 aa  78.6  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.352603  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0256  glutaredoxin  48.68 
 
 		 86 aa  75.5  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.296093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2423  glutaredoxin  48.68 
 
 		 85 aa  75.5  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1175  glutaredoxin  47.3 
 
 		 82 aa  65.9  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1250  glutaredoxin  41.33 
 
 		 83 aa  51.2  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.461543  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1501  hypothetical protein  35.14 
 
 		 398 aa  50.1  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.226157 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0235  YruB family glutaredoxin-like protein  43.64 
 
 		 76 aa  49.3  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000377018  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49100  glutathione S-transferase  37.33 
 
 		 209 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000404937 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0078  glutaredoxin  32.5 
 
 		 84 aa  48.1  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4194  glutathione S-transferase  36 
 
 		 209 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12420  glutaredoxin-like protein  33.33 
 
 		 82 aa  46.2  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2435  YruB family glutaredoxin-like protein  40.74 
 
 		 77 aa  45.4  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0406  glutaredoxin  38.33 
 
 		 383 aa  45.4  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0240048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2749  YruB family glutaredoxin-like protein  40.74 
 
 		 77 aa  45.4  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3080  glutathione S-transferase-like  34.18 
 
 		 223 aa  44.3  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4722  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.91 
 
 		 223 aa  44.3  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.247027  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1633  Glutathione S-transferase domain protein  36.36 
 
 		 209 aa  43.9  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0604815 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_186  glutaredoxin protein  54.05 
 
 		 91 aa  43.9  0.0006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.017665  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2295  Glutathione S-transferase domain protein  35.06 
 
 		 228 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.902832 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001457  glutaredoxin  32.89 
 
 		 119 aa  43.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1953  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.71 
 
 		 224 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428029  normal  0.0851297 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2570  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.33 
 
 		 228 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00976958 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0792  glutaredoxin-like protein, YruB-family  34.18 
 
 		 81 aa  43.1  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000191922  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0198  glutaredoxin family protein  38.98 
 
 		 91 aa  43.1  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000961716  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2797  hypothetical protein  32.5 
 
 		 118 aa  42.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2053  hypothetical protein  31.71 
 
 		 87 aa  42.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1830  glutaredoxin  34.18 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0383849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0155  glutaredoxin  50 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0968575  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0832  glutaredoxin  37.31 
 
 		 92 aa  41.6  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.536089  normal  0.276362 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1562  glutaredoxin  33.75 
 
 		 118 aa  41.6  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0854  YruB family glutaredoxin-like protein  32.08 
 
 		 80 aa  41.6  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00289984  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3239  hypothetical protein  29.27 
 
 		 90 aa  41.6  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2579  glutaredoxin  33.75 
 
 		 118 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.201508 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0113  glutaredoxin  37.25 
 
 		 87 aa  41.2  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118663 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2142  glutathione S-transferase-like protein  32.91 
 
 		 223 aa  40.8  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.142397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1282  Glutathione S-transferase domain protein  32.88 
 
 		 225 aa  41.2  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2417  glutaredoxin  32.5 
 
 		 118 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.656384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1608  glutaredoxin  37.5 
 
 		 81 aa  41.2  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0528934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2487  glutaredoxin  32.5 
 
 		 118 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0780124  normal  0.16751 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0788  glutathione S-transferase  34.21 
 
 		 264 aa  40.8  0.007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.200068 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0908  glutaredoxin  32.81 
 
 		 93 aa  40.8  0.007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000277595  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01231  putative glutathione S-transferase  33.78 
 
 		 241 aa  40.4  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.168526  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0084  glutaredoxin  34.48 
 
 		 384 aa  40.4  0.009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.833578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26662  predicted protein  36.49 
 
 		 317 aa  40  0.01  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1406  glutaredoxin  33.9 
 
 		 84 aa  40  0.01  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.583835  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>