131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2749 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2749  YruB family glutaredoxin-like protein  100 
 
 		 77 aa  154  4e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2435  YruB family glutaredoxin-like protein  100 
 
 		 77 aa  154  4e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0169  glutaredoxin  44.12 
 
 		 402 aa  66.6  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0084  glutaredoxin  43.48 
 
 		 384 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.833578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0235  YruB family glutaredoxin-like protein  43.06 
 
 		 76 aa  62  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000377018  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0854  YruB family glutaredoxin-like protein  39.13 
 
 		 80 aa  60.8  0.000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00289984  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3049  glutaredoxin  42.86 
 
 		 391 aa  60.1  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1250  glutaredoxin  43.55 
 
 		 83 aa  58.5  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.461543  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2747  YruB family glutaredoxin-like protein  43.24 
 
 		 75 aa  57.8  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2433  glutaredoxin  43.24 
 
 		 75 aa  57.8  0.00000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3219  YruB family glutaredoxin-like protein  36.49 
 
 		 82 aa  58.2  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.890073 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2340  glutaredoxin  36.99 
 
 		 78 aa  58.2  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.340679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0792  glutaredoxin-like protein, YruB-family  41.67 
 
 		 81 aa  57.4  0.00000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000191922  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1719  YruB family glutaredoxin-like protein  34.78 
 
 		 80 aa  57  0.00000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1777  YruB family glutaredoxin-like protein  34.78 
 
 		 80 aa  57  0.00000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.110535  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1427  YruB family glutaredoxin-like protein  36.11 
 
 		 80 aa  56.2  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00494984  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1501  hypothetical protein  39.13 
 
 		 398 aa  55.1  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.226157 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0406  glutaredoxin  34.78 
 
 		 383 aa  55.1  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0240048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0505  glutaredoxin-like protein, YruB-family  31.08 
 
 		 175 aa  54.3  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0034  glutaredoxin-like protein, YruB-family  35.82 
 
 		 81 aa  54.3  0.0000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0552  YruB family glutaredoxin-like protein  38.81 
 
 		 80 aa  53.9  0.0000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1508  glutaredoxin-like protein protein, YruB  35.14 
 
 		 81 aa  52.8  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00379246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1344  YruB family glutaredoxin-like protein  31.34 
 
 		 84 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.458905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1323  YruB family glutaredoxin-like protein  31.34 
 
 		 84 aa  51.6  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0672581  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1082  glutaredoxin  30.14 
 
 		 116 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.976199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1531  peptide methionine sulfoxide reductase  31.08 
 
 		 260 aa  49.7  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0149191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2334  YruB family glutaredoxin-like protein  34.78 
 
 		 194 aa  50.1  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000573032  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1609  glutaredoxin-like protein, YruB  32.43 
 
 		 80 aa  48.9  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.645814  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0566  glutaredoxin family protein  31.58 
 
 		 83 aa  48.5  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.113719  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0982  glutaredoxin  30.14 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0716  glutaredoxin 3  35.44 
 
 		 83 aa  48.1  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3291  glutaredoxin-like protein NrdH  33.33 
 
 		 77 aa  47.8  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1264  glutaredoxin NrdH  28.17 
 
 		 70 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0898475  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1787  glutaredoxin  38.1 
 
 		 84 aa  46.6  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.75758  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1508  glutaredoxin  36.11 
 
 		 76 aa  46.6  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000114631  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1406  glutaredoxin  30.38 
 
 		 84 aa  45.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.583835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2946  glutaredoxin  37.33 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.758078  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2348  glutaredoxin  40.74 
 
 		 79 aa  45.4  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0181488 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0078  glutaredoxin  30.38 
 
 		 84 aa  45.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0296  glutaredoxin GrxC  32.89 
 
 		 86 aa  45.4  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1555  glutaredoxin  35.82 
 
 		 87 aa  45.1  0.0004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000316577  normal  0.150299 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0496  glutaredoxin  35.38 
 
 		 84 aa  44.7  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.460095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1737  glutaredoxin GrxC  35.82 
 
 		 87 aa  45.1  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0513723  normal  0.163963 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2348  glutaredoxin 3  30.95 
 
 		 115 aa  44.7  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000217379  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3102  glutaredoxin 3  26.15 
 
 		 85 aa  44.7  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3815  YruB family glutaredoxin-like protein  33.82 
 
 		 78 aa  45.1  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1859  glutaredoxin 3  39.06 
 
 		 87 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.543286  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1785  glutaredoxin-like protein  30.51 
 
 		 83 aa  44.7  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.593811  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2967  glutaredoxin-like protein  32.43 
 
 		 82 aa  44.3  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04215  glutaredoxin Grx1, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06100)  38.46 
 
 		 102 aa  43.9  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1784  glutaredoxin and related proteins  35.19 
 
 		 59 aa  43.9  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2457  glutaredoxin  32 
 
 		 213 aa  43.9  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.393373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2960  YruB family glutaredoxin-like protein  31.58 
 
 		 125 aa  43.9  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000757136  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1944  glutaredoxin 3  37.5 
 
 		 87 aa  43.5  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.30403  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0332  glutaredoxin  27.85 
 
 		 86 aa  43.5  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.877113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2919  glutaredoxin  30.86 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000608309 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2019  glutaredoxin GrxC  38.1 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.908829  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2856  glutaredoxin  34.38 
 
 		 221 aa  43.5  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.667379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2230  glutaredoxin  30.38 
 
 		 87 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.381794  normal  0.448349 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3740  glutaredoxin-like protein  35.19 
 
 		 80 aa  42.7  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.137278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0554  glutaredoxin  32 
 
 		 78 aa  43.5  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3985  glutaredoxin  30.67 
 
 		 266 aa  43.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.28691  normal  0.032093 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8361  Glutaredoxin and related protein-like protein  32.14 
 
 		 78 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.647528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0292  glutaredoxin  32.84 
 
 		 75 aa  42.7  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1149  glutaredoxin family protein  33.82 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0256  glutaredoxin  40.74 
 
 		 86 aa  43.5  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.296093  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0640  putative glutaredoxin  30.3 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.189959  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2959  glutaredoxin-like protein, YruB  26.32 
 
 		 168 aa  42.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04690  Dithiol-glutaredoxin protein  35.48 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.981866  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2665  glutaredoxin  33.33 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2324  glutaredoxin-like protein  36.84 
 
 		 85 aa  42.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.365889  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0348  glutaredoxin  33.33 
 
 		 81 aa  42.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.178838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2064  glutaredoxin  33.33 
 
 		 78 aa  42.7  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3856  glutaredoxin 3  38.46 
 
 		 85 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2130  glutaredoxin  32 
 
 		 218 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0740536 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0563  glutaredoxin-like protein NrdH  29.41 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.629127  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0155  glutaredoxin  31.65 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0968575  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2952  glutaredoxin-like protein NrdH  34.29 
 
 		 73 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.794387  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1065  glutaredoxin-related protein NrdH  30.14 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0223724  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4121  glutaredoxin-like protein  35.19 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.274852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3540  glutaredoxin-related protein NrdH  30.14 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00255736  hitchhiker  0.0090017 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1119  glutaredoxin-like protein NrdH  30.14 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.556674  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0096  glutaredoxin  38.89 
 
 		 83 aa  42.4  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4091  glutaredoxin family protein  33.82 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2157  glutaredoxin  32 
 
 		 213 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1652  glutaredoxin  32 
 
 		 218 aa  42.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3897  glutaredoxin family protein  33.82 
 
 		 78 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0446  glutaredoxin-like protein NrdH  29.33 
 
 		 81 aa  42  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2434  hypothetical protein  29.85 
 
 		 179 aa  42  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.332001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4201  glutaredoxin family protein  33.82 
 
 		 78 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0847  glutaredoxin  38.89 
 
 		 84 aa  41.6  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.352603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1311  glutaredoxin GrxC  33.85 
 
 		 89 aa  42  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.755155  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1815  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  32.39 
 
 		 83 aa  41.6  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.389601  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1862  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  32.39 
 
 		 83 aa  41.6  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.150892 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1796  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  32.39 
 
 		 83 aa  41.6  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.297213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1790  glutaredoxin 3  34.92 
 
 		 89 aa  41.6  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0464  glutaredoxin  33.33 
 
 		 85 aa  42  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1703  glutaredoxin 3  33.33 
 
 		 85 aa  42  0.003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5356  glutaredoxin 3  29.69 
 
 		 92 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460524  normal  0.957848 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2625  glutaredoxin  28.38 
 
 		 86 aa  42  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.253894  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>