71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_1710 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_1710  glutaredoxin  100 
 
 
118 aa  244  2e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.382993  normal  0.506968 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1688  glutaredoxin  99.15 
 
 
118 aa  244  3e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1673  glutaredoxin  99.15 
 
 
118 aa  243  6.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2669  glutaredoxin  99.15 
 
 
118 aa  243  6.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0368347  normal  0.0510929 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2579  glutaredoxin  91.53 
 
 
118 aa  223  6e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.201508 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2417  glutaredoxin  90.68 
 
 
118 aa  221  2e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.656384  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2487  glutaredoxin  90.68 
 
 
118 aa  221  2e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0780124  normal  0.16751 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1562  glutaredoxin  87.29 
 
 
118 aa  218  1.9999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2797  hypothetical protein  88.14 
 
 
118 aa  216  7e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1501  glutaredoxin  72.88 
 
 
118 aa  190  7e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.676522  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2758  glutaredoxin  70.34 
 
 
118 aa  188  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.334545  normal  0.0243575 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1830  glutaredoxin  71.19 
 
 
118 aa  188  2.9999999999999997e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0383849  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1598  glutaredoxin  68.64 
 
 
118 aa  186  7e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.328495  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1594  glutaredoxin  68.64 
 
 
118 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3628  glutaredoxin  68.64 
 
 
118 aa  169  1e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2005  glutaredoxin  65.25 
 
 
118 aa  161  3e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.916013  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001457  glutaredoxin  57.98 
 
 
119 aa  147  6e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05393  hypothetical protein  55.46 
 
 
119 aa  143  9e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3634  hypothetical protein  52.17 
 
 
124 aa  130  7.999999999999999e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.466049  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0816  putative glutaredoxin  49.15 
 
 
119 aa  128  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1540  ATP-dependent helicase HrpB  55.17 
 
 
121 aa  125  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1430  glutaredoxin  50 
 
 
123 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.11658  normal  0.297548 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2745  glutaredoxin  52.59 
 
 
122 aa  122  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0841717  normal  0.856746 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3567  hypothetical protein  52.59 
 
 
123 aa  122  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3889  glutaredoxin  50 
 
 
123 aa  120  5e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.280842 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1822  glutaredoxin  50 
 
 
123 aa  120  5e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0545572  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1400  glutaredoxin  49.14 
 
 
123 aa  120  6e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.111122  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1714  hypothetical protein  51.24 
 
 
123 aa  120  8e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42020  hypothetical protein  50.86 
 
 
123 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0951  glutaredoxin  48 
 
 
147 aa  114  5e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.40724  normal  0.0261252 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1899  glutaredoxin  44.44 
 
 
123 aa  113  8.999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.508072 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2410  glutaredoxin  43.8 
 
 
123 aa  111  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.786564  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1103  glutaredoxin family protein  45.3 
 
 
130 aa  110  8.000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000207624  normal  0.596308 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0167  glutaredoxin family protein  45.3 
 
 
130 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.08495 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2034  hypothetical protein  43.7 
 
 
125 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144107  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1032  glutaredoxin  44.83 
 
 
130 aa  102  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.783959  normal  0.67876 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2379  glutaredoxin family protein  45.3 
 
 
130 aa  103  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.272824  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4059  glutaredoxin  44.44 
 
 
130 aa  102  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1844  hypothetical protein  42.86 
 
 
121 aa  101  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.322707 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3222  glutaredoxin  47.37 
 
 
115 aa  99  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0827  putative glutaredoxin  50 
 
 
89 aa  79.3  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0213  glutaredoxin  44.05 
 
 
118 aa  76.6  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.989623  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12420  glutaredoxin-like protein  42.31 
 
 
82 aa  65.5  0.0000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5304  glutaredoxin  44.59 
 
 
148 aa  63.9  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0976  glutaredoxin  40.74 
 
 
105 aa  62  0.000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1950  glutaredoxin  44.44 
 
 
80 aa  55.5  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000181605  normal  0.405053 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1787  glutaredoxin  35.8 
 
 
84 aa  52.4  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.75758  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29383  predicted protein  32.93 
 
 
309 aa  50.4  0.000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.066564  normal  0.454968 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2423  glutaredoxin  30.49 
 
 
85 aa  48.9  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2195  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.59 
 
 
284 aa  48.5  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2053  hypothetical protein  30.68 
 
 
87 aa  47.4  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119472  Carotenoid dioxygenase plastidic fusion protein, putative  35 
 
 
914 aa  47.4  0.00007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0452333  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1387  glutaredoxin  34.72 
 
 
77 aa  47  0.00008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.252635  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1175  glutaredoxin  30.38 
 
 
82 aa  45.8  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0847  glutaredoxin  30.38 
 
 
84 aa  45.1  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.352603  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3239  hypothetical protein  29.89 
 
 
90 aa  44.7  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11170  glutaredoxin  36.84 
 
 
78 aa  45.1  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07400  glutaredoxin-like protein  37.66 
 
 
82 aa  43.5  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1084  glutaredoxin  31.4 
 
 
103 aa  43.1  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1651  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.75 
 
 
261 aa  42.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.491053  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0886  glutaredoxin  31.25 
 
 
87 aa  42.4  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.289839  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0245  glutaredoxin 2  38.67 
 
 
218 aa  41.6  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1250  glutaredoxin  32.89 
 
 
83 aa  41.2  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.461543  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1402  glutaredoxin 3  30.43 
 
 
85 aa  40.8  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2207  glutaredoxin 2  30.38 
 
 
215 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.158739 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2023  glutaredoxin 2  30.38 
 
 
215 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1233  glutaredoxin 2  30.38 
 
 
215 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.929078  normal  0.25689 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45400  predicted protein  28.57 
 
 
342 aa  40.4  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1277  glutaredoxin 2  30.38 
 
 
215 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0995017  normal  0.525696 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0296  glutathione S-transferase-like protein  28.95 
 
 
214 aa  40.4  0.009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.351442  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0529  glutaredoxin-like protein GlrX  33.33 
 
 
86 aa  40  0.01  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>