65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_29383 on replicon NC_009374
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009374  OSTLU_29383  predicted protein  100 
 
 
309 aa  634    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.066564  normal  0.454968 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26662  predicted protein  43.26 
 
 
317 aa  217  2e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45400  predicted protein  37.37 
 
 
342 aa  179  5.999999999999999e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2195  glutathione S-transferase domain-containing protein  36 
 
 
284 aa  149  7e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119472  Carotenoid dioxygenase plastidic fusion protein, putative  34.67 
 
 
914 aa  144  2e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0452333  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2745  glutaredoxin  33.04 
 
 
122 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0841717  normal  0.856746 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1822  glutaredoxin  35.34 
 
 
123 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0545572  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3889  glutaredoxin  35.34 
 
 
123 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.280842 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1400  glutaredoxin  35.34 
 
 
123 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.111122  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1430  glutaredoxin  34.48 
 
 
123 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.11658  normal  0.297548 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3222  glutaredoxin  36.47 
 
 
115 aa  62  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1787  glutaredoxin  40.24 
 
 
84 aa  61.6  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.75758  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2423  glutaredoxin  39.76 
 
 
85 aa  61.2  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0847  glutaredoxin  41.77 
 
 
84 aa  61.2  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.352603  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1032  glutaredoxin  41.18 
 
 
130 aa  61.2  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.783959  normal  0.67876 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1175  glutaredoxin  45.12 
 
 
82 aa  60.5  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3567  hypothetical protein  34.69 
 
 
123 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0816  putative glutaredoxin  32.76 
 
 
119 aa  57.8  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0554  glutaredoxin  40.26 
 
 
78 aa  57  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42020  hypothetical protein  31.36 
 
 
123 aa  57  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0951  glutaredoxin  32.43 
 
 
147 aa  57  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.40724  normal  0.0261252 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1501  glutaredoxin  32.65 
 
 
118 aa  57  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.676522  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4059  glutaredoxin  31.96 
 
 
130 aa  55.8  0.0000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0256  glutaredoxin  41.25 
 
 
86 aa  55.5  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.296093  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0406  glutaredoxin  38.46 
 
 
86 aa  55.1  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.394009  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0048  glutaredoxin  37.66 
 
 
105 aa  55.5  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2410  glutaredoxin  30.84 
 
 
123 aa  54.7  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.786564  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2053  hypothetical protein  36.05 
 
 
87 aa  55.1  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05393  hypothetical protein  35.9 
 
 
119 aa  53.5  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3628  glutaredoxin  28.57 
 
 
118 aa  53.1  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001457  glutaredoxin  31.58 
 
 
119 aa  52.8  0.000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1830  glutaredoxin  32.65 
 
 
118 aa  52.4  0.000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0383849  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2758  glutaredoxin  37.5 
 
 
118 aa  52  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.334545  normal  0.0243575 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0167  glutaredoxin family protein  36.14 
 
 
130 aa  52  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.08495 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1712  glutaredoxin  37.97 
 
 
114 aa  52.4  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.266402  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1714  hypothetical protein  28.45 
 
 
123 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2379  glutaredoxin family protein  37.04 
 
 
130 aa  51.2  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.272824  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1899  glutaredoxin  32.95 
 
 
123 aa  51.6  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.508072 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1688  glutaredoxin  34.15 
 
 
118 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1710  glutaredoxin  32.93 
 
 
118 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.382993  normal  0.506968 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1673  glutaredoxin  33.33 
 
 
118 aa  50.1  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2107  glutaredoxin  32.5 
 
 
94 aa  50.1  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.367569  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07400  glutaredoxin-like protein  39.47 
 
 
82 aa  50.1  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2669  glutaredoxin  33.33 
 
 
118 aa  50.1  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0368347  normal  0.0510929 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1844  hypothetical protein  36.25 
 
 
121 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.322707 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2946  glutaredoxin  33.77 
 
 
78 aa  49.7  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.758078  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2797  hypothetical protein  30.61 
 
 
118 aa  48.5  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2034  hypothetical protein  31.25 
 
 
125 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144107  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2579  glutaredoxin  32.93 
 
 
118 aa  48.5  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.201508 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2625  glutaredoxin  33.73 
 
 
86 aa  48.5  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.253894  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2487  glutaredoxin  32.93 
 
 
118 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0780124  normal  0.16751 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2417  glutaredoxin  32.93 
 
 
118 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.656384  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1598  glutaredoxin  28.75 
 
 
118 aa  47.8  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.328495  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2005  glutaredoxin  29.21 
 
 
118 aa  47.4  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.916013  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3239  hypothetical protein  32.94 
 
 
90 aa  47  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1103  glutaredoxin family protein  30.61 
 
 
130 aa  46.6  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000207624  normal  0.596308 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1562  glutaredoxin  35.8 
 
 
118 aa  46.2  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0886  glutaredoxin  31.76 
 
 
87 aa  46.2  0.0008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.289839  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1594  glutaredoxin  29.27 
 
 
118 aa  45.8  0.0009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11170  glutaredoxin  34.67 
 
 
78 aa  45.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00524  glutathione S-transferase  33.75 
 
 
234 aa  45.1  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0213  glutaredoxin  32.61 
 
 
118 aa  43.5  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.989623  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06497  glutaredoxin 2  36.36 
 
 
209 aa  43.5  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3634  hypothetical protein  29.67 
 
 
124 aa  43.5  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.466049  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0827  putative glutaredoxin  29.11 
 
 
89 aa  43.1  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>