94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1787 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_1787  glutaredoxin  100 
 
 
84 aa  170  5e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.75758  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0847  glutaredoxin  74.39 
 
 
84 aa  126  1.0000000000000001e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.352603  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0256  glutaredoxin  69.14 
 
 
86 aa  117  3.9999999999999996e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.296093  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2423  glutaredoxin  66.27 
 
 
85 aa  113  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1175  glutaredoxin  59.76 
 
 
82 aa  96.7  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0554  glutaredoxin  55.26 
 
 
78 aa  86.7  9e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2625  glutaredoxin  51.9 
 
 
86 aa  86.3  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.253894  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2107  glutaredoxin  48.1 
 
 
94 aa  82.8  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.367569  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1712  glutaredoxin  49.38 
 
 
114 aa  81.6  0.000000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.266402  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0406  glutaredoxin  48.75 
 
 
86 aa  80.5  0.000000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.394009  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0048  glutaredoxin  50 
 
 
105 aa  80.5  0.000000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2946  glutaredoxin  51.32 
 
 
78 aa  79.7  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.758078  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0886  glutaredoxin  47.5 
 
 
87 aa  79.7  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.289839  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2348  glutaredoxin  48.68 
 
 
79 aa  79  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0181488 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29383  predicted protein  40.24 
 
 
309 aa  61.6  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.066564  normal  0.454968 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1899  glutaredoxin  34.15 
 
 
123 aa  58.9  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.508072 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45400  predicted protein  37.35 
 
 
342 aa  57  0.00000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5304  glutaredoxin  35.8 
 
 
148 aa  56.2  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3222  glutaredoxin  33.75 
 
 
115 aa  55.1  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2053  hypothetical protein  38.64 
 
 
87 aa  52.8  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1688  glutaredoxin  35.8 
 
 
118 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1710  glutaredoxin  35.8 
 
 
118 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.382993  normal  0.506968 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1673  glutaredoxin  36.25 
 
 
118 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2669  glutaredoxin  36.25 
 
 
118 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0368347  normal  0.0510929 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2745  glutaredoxin  33.33 
 
 
122 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0841717  normal  0.856746 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2797  hypothetical protein  33.75 
 
 
118 aa  51.2  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26662  predicted protein  40.51 
 
 
317 aa  51.2  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0976  glutaredoxin  34.62 
 
 
105 aa  50.8  0.000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42020  hypothetical protein  32.14 
 
 
123 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2579  glutaredoxin  33.75 
 
 
118 aa  50.4  0.000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.201508 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2487  glutaredoxin  32.5 
 
 
118 aa  50.1  0.000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0780124  normal  0.16751 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2417  glutaredoxin  32.5 
 
 
118 aa  50.1  0.000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.656384  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1562  glutaredoxin  33.75 
 
 
118 aa  50.4  0.000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12420  glutaredoxin-like protein  38.16 
 
 
82 aa  50.1  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0827  putative glutaredoxin  34.18 
 
 
89 aa  50.1  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3239  hypothetical protein  37.21 
 
 
90 aa  49.3  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3567  hypothetical protein  30.95 
 
 
123 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2195  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.75 
 
 
284 aa  49.3  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1250  glutaredoxin  37.18 
 
 
83 aa  49.3  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.461543  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001457  glutaredoxin  32.47 
 
 
119 aa  48.5  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1540  ATP-dependent helicase HrpB  34.18 
 
 
121 aa  48.1  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0816  putative glutaredoxin  32.91 
 
 
119 aa  48.1  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11170  glutaredoxin  34.57 
 
 
78 aa  47.4  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05393  hypothetical protein  30 
 
 
119 aa  47.4  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0169  glutaredoxin  38.46 
 
 
402 aa  46.2  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2435  YruB family glutaredoxin-like protein  38.1 
 
 
77 aa  46.6  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2749  YruB family glutaredoxin-like protein  38.1 
 
 
77 aa  46.6  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0406  glutaredoxin  34.15 
 
 
383 aa  45.8  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0240048  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2379  glutaredoxin family protein  31.33 
 
 
130 aa  45.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.272824  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0167  glutaredoxin family protein  33.73 
 
 
130 aa  45.8  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.08495 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2410  glutaredoxin  28.05 
 
 
123 aa  45.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.786564  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0951  glutaredoxin  30 
 
 
147 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.40724  normal  0.0261252 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1032  glutaredoxin  32.5 
 
 
130 aa  45.8  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.783959  normal  0.67876 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1830  glutaredoxin  35.8 
 
 
118 aa  45.4  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0383849  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4017  glutathione S-transferase-like  34.78 
 
 
232 aa  45.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.678212 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2758  glutaredoxin  34.15 
 
 
118 aa  45.4  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.334545  normal  0.0243575 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0213  glutaredoxin  37.33 
 
 
118 aa  45.4  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.989623  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1714  hypothetical protein  28.75 
 
 
123 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2034  hypothetical protein  30.86 
 
 
125 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144107  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1950  glutaredoxin  35.8 
 
 
80 aa  44.7  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000181605  normal  0.405053 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1844  hypothetical protein  29.63 
 
 
121 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.322707 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07400  glutaredoxin-like protein  38.55 
 
 
82 aa  43.9  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3634  hypothetical protein  32.47 
 
 
124 aa  43.9  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.466049  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1400  glutaredoxin  31.25 
 
 
123 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.111122  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01251  putative glutathione S-transferase  37.33 
 
 
241 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.621374 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0788  glutathione S-transferase  38.96 
 
 
264 aa  43.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.200068 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1501  hypothetical protein  40.38 
 
 
398 aa  43.5  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.226157 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1501  glutaredoxin  32.91 
 
 
118 aa  43.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.676522  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3889  glutaredoxin  30 
 
 
123 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.280842 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1822  glutaredoxin  30 
 
 
123 aa  42.7  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0545572  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1703  glutaredoxin 3  33.33 
 
 
85 aa  43.1  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0464  glutaredoxin  33.33 
 
 
85 aa  43.1  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4059  glutaredoxin  30 
 
 
130 aa  42.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3628  glutaredoxin  29.63 
 
 
118 aa  42.7  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1608  glutaredoxin  38.46 
 
 
81 aa  42.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0528934  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2005  glutaredoxin  28.92 
 
 
118 aa  42.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.916013  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1282  Glutathione S-transferase domain protein  37.18 
 
 
225 aa  42  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0084  glutaredoxin  28.57 
 
 
384 aa  41.6  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.833578  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4080  glutaredoxin family protein  33.78 
 
 
243 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0117  hybrid peroxiredoxin hyPrx5  33.78 
 
 
243 aa  42  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0136  hybrid peroxiredoxin hyPrx5  33.78 
 
 
243 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3049  glutaredoxin  33.85 
 
 
391 aa  42  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2441  glutaredoxin GrxC  33.33 
 
 
85 aa  42  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0488  glutaredoxin-family domain protein  33.33 
 
 
243 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.191714  normal  0.360445 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2277  glutaredoxin, GrxB family  36.25 
 
 
215 aa  41.6  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0474  glutaredoxin-family domain protein  33.33 
 
 
243 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0096  glutaredoxin  28.95 
 
 
83 aa  41.6  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1430  glutaredoxin  28.75 
 
 
123 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.11658  normal  0.297548 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0235  YruB family glutaredoxin-like protein  34.92 
 
 
76 aa  41.6  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000377018  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01821  putative glutathione S-transferase  32 
 
 
239 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0879846  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1058  glutathione S-transferase family protein  37.04 
 
 
217 aa  41.2  0.005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.407682  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0500  Glutathione S-transferase domain  38.67 
 
 
222 aa  40.8  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0342057 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0139  glutaredoxin-like region  32.88 
 
 
247 aa  40.8  0.007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.406414  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1103  glutaredoxin family protein  25.3 
 
 
130 aa  40.4  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000207624  normal  0.596308 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>