56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0096 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0096  glutaredoxin  100 
 
 
83 aa  174  3e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0071  glutaredoxin  56.25 
 
 
86 aa  105  2e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00875586 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2665  glutaredoxin  45.57 
 
 
84 aa  78.6  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22520  glutaredoxin-like protein  45.57 
 
 
86 aa  73.2  0.000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1566  glutaredoxin-like protein  39.74 
 
 
83 aa  68.6  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2050  glutaredoxin-like protein  41.33 
 
 
85 aa  64.7  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2324  glutaredoxin-like protein  40 
 
 
85 aa  63.2  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.365889  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2898  glutaredoxin-like protein  38.67 
 
 
86 aa  61.2  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0792197  normal  0.021739 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5740  glutaredoxin  46.97 
 
 
81 aa  59.3  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.574566  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1178  glutaredoxin-like protein  33.33 
 
 
94 aa  57.8  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.975615  normal  0.0647331 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0714  glutaredoxin-like protein  32.05 
 
 
91 aa  57.8  0.00000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27570  Glutaredoxin-like protein  35.14 
 
 
92 aa  57  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3048  glutaredoxin-like protein  36.49 
 
 
79 aa  56.2  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.196094  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1785  glutaredoxin-like protein  33.78 
 
 
83 aa  55.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.593811  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1408  glutaredoxin-like protein GlrX  36 
 
 
82 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.611823  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1426  glutaredoxin-like protein  36 
 
 
82 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1462  glutaredoxin-like protein  36 
 
 
82 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.200853  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2470  glutaredoxin-like protein  34.67 
 
 
88 aa  55.1  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0277033  hitchhiker  0.00220666 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8361  Glutaredoxin and related protein-like protein  31.58 
 
 
78 aa  54.3  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.647528  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2760  glutaredoxin  36.99 
 
 
74 aa  53.9  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3740  glutaredoxin-like protein  31.17 
 
 
80 aa  52.4  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.137278  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4661  glutaredoxin-like protein  31.08 
 
 
83 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.319136  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1772  glutaredoxin-like protein  33.33 
 
 
89 aa  52  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.16885  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0381  glutaredoxin  31.58 
 
 
85 aa  50.8  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1806  glutaredoxin-like protein  34.67 
 
 
83 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.236258  normal  0.0887235 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1515  glutaredoxin-like protein  32.5 
 
 
82 aa  50.1  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159258  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0084  glutaredoxin  39.66 
 
 
384 aa  50.1  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.833578  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0785  glutaredoxin-like protein  33.33 
 
 
81 aa  49.7  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.315342  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4121  glutaredoxin-like protein  29.87 
 
 
80 aa  49.7  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.274852  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0529  glutaredoxin-like protein GlrX  31.08 
 
 
86 aa  49.3  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3808  glutaredoxin-like protein  32.05 
 
 
86 aa  48.9  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00383121 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3793  glutaredoxin-like protein GlrX  32.88 
 
 
79 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.565911  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13221  glutaredoxin protein  30.77 
 
 
84 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.869947 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3497  glutaredoxin-like protein  32.43 
 
 
94 aa  47.4  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0397961  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2784  glutaredoxin  43.4 
 
 
84 aa  47.4  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.420129  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4233  glutaredoxin-like protein  30.26 
 
 
87 aa  47  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0749  hypothetical protein  32 
 
 
78 aa  45.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0797842  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3744  glutaredoxin  28 
 
 
93 aa  43.9  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00746717  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2967  glutaredoxin-like protein  28.57 
 
 
82 aa  43.5  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0332  glutaredoxin  26.83 
 
 
86 aa  43.5  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.877113  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0413  glutaredoxin  32.1 
 
 
89 aa  43.5  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.584384 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0406  glutaredoxin  39.66 
 
 
383 aa  42.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0240048  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0934  glutaredoxin-like protein  29.33 
 
 
79 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0764967  normal  0.602871 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2435  YruB family glutaredoxin-like protein  38.89 
 
 
77 aa  42.4  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2749  YruB family glutaredoxin-like protein  38.89 
 
 
77 aa  42.4  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1787  glutaredoxin  28.95 
 
 
84 aa  41.6  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.75758  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2340  glutaredoxin  28.07 
 
 
78 aa  41.6  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.340679  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0552  YruB family glutaredoxin-like protein  29.09 
 
 
80 aa  41.6  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0505  glutaredoxin-like protein, YruB-family  34.62 
 
 
175 aa  41.2  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7800  glutaredoxin  36.96 
 
 
84 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4794  Glutathione S-transferase domain  30.43 
 
 
197 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.915466  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1399  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.86 
 
 
200 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250488  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3890  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.86 
 
 
200 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.19285 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1821  glutathione S-transferase family protein  31.34 
 
 
200 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0623474  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1508  glutaredoxin-like protein protein, YruB  32.76 
 
 
81 aa  40.8  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00379246  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0854  YruB family glutaredoxin-like protein  32.08 
 
 
80 aa  40.4  0.008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00289984  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>