68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1032 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_1032  glutaredoxin  100 
 
 
130 aa  264  2e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.783959  normal  0.67876 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0951  glutaredoxin  69.23 
 
 
147 aa  190  6e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.40724  normal  0.0261252 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0167  glutaredoxin family protein  57.48 
 
 
130 aa  150  5.9999999999999996e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.08495 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2379  glutaredoxin family protein  51.97 
 
 
130 aa  128  3e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.272824  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1103  glutaredoxin family protein  45.67 
 
 
130 aa  127  4.0000000000000003e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000207624  normal  0.596308 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05393  hypothetical protein  46.55 
 
 
119 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4059  glutaredoxin  45.67 
 
 
130 aa  117  3.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3634  hypothetical protein  44.83 
 
 
124 aa  116  7.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.466049  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001457  glutaredoxin  43.97 
 
 
119 aa  115  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0816  putative glutaredoxin  47.32 
 
 
119 aa  114  3e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2745  glutaredoxin  45 
 
 
122 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0841717  normal  0.856746 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1562  glutaredoxin  45.69 
 
 
118 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3567  hypothetical protein  43.33 
 
 
123 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2005  glutaredoxin  45.69 
 
 
118 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.916013  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1430  glutaredoxin  44.92 
 
 
123 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.11658  normal  0.297548 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42020  hypothetical protein  44.17 
 
 
123 aa  107  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1540  ATP-dependent helicase HrpB  46.43 
 
 
121 aa  107  6e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2410  glutaredoxin  42.28 
 
 
123 aa  106  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.786564  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2758  glutaredoxin  48.72 
 
 
118 aa  106  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.334545  normal  0.0243575 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3628  glutaredoxin  43.97 
 
 
118 aa  106  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1899  glutaredoxin  44.09 
 
 
123 aa  105  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.508072 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2797  hypothetical protein  45.69 
 
 
118 aa  104  5e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1400  glutaredoxin  43.22 
 
 
123 aa  103  8e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.111122  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2579  glutaredoxin  46.15 
 
 
118 aa  103  8e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.201508 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1830  glutaredoxin  45.69 
 
 
118 aa  103  9e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0383849  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1688  glutaredoxin  44.83 
 
 
118 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1710  glutaredoxin  44.83 
 
 
118 aa  102  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.382993  normal  0.506968 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1822  glutaredoxin  42.37 
 
 
123 aa  102  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0545572  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1673  glutaredoxin  44.83 
 
 
118 aa  102  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3889  glutaredoxin  42.37 
 
 
123 aa  102  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.280842 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2417  glutaredoxin  46.15 
 
 
118 aa  102  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.656384  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2487  glutaredoxin  46.15 
 
 
118 aa  102  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0780124  normal  0.16751 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2669  glutaredoxin  44.83 
 
 
118 aa  102  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0368347  normal  0.0510929 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2034  hypothetical protein  45 
 
 
125 aa  101  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144107  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1594  glutaredoxin  47.01 
 
 
118 aa  100  6e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1598  glutaredoxin  40.17 
 
 
118 aa  95.5  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.328495  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1501  glutaredoxin  43.97 
 
 
118 aa  94.7  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.676522  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1714  hypothetical protein  42.5 
 
 
123 aa  94  6e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1844  hypothetical protein  43.7 
 
 
121 aa  94  6e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.322707 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0827  putative glutaredoxin  50.63 
 
 
89 aa  93.2  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3222  glutaredoxin  46.32 
 
 
115 aa  92.4  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0213  glutaredoxin  45.35 
 
 
118 aa  69.3  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.989623  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29383  predicted protein  41.18 
 
 
309 aa  61.2  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.066564  normal  0.454968 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5304  glutaredoxin  42.86 
 
 
148 aa  60.8  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12420  glutaredoxin-like protein  43.04 
 
 
82 aa  57.4  0.00000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0976  glutaredoxin  37.8 
 
 
105 aa  55.8  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1950  glutaredoxin  43.24 
 
 
80 aa  55.5  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000181605  normal  0.405053 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11170  glutaredoxin  39.74 
 
 
78 aa  54.7  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1175  glutaredoxin  34.67 
 
 
82 aa  53.5  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2195  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.2 
 
 
284 aa  52.4  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45400  predicted protein  33.72 
 
 
342 aa  50.1  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2423  glutaredoxin  31.65 
 
 
85 aa  49.7  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1084  glutaredoxin  33.73 
 
 
103 aa  49.3  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1387  glutaredoxin  35.06 
 
 
77 aa  49.3  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.252635  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1787  glutaredoxin  32.5 
 
 
84 aa  45.8  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.75758  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2053  hypothetical protein  36.67 
 
 
87 aa  45.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2207  glutaredoxin 2  40 
 
 
215 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.158739 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2023  glutaredoxin 2  40 
 
 
215 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1233  glutaredoxin 2  40 
 
 
215 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.929078  normal  0.25689 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1277  glutaredoxin 2  40 
 
 
215 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0995017  normal  0.525696 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07400  glutaredoxin-like protein  38.27 
 
 
82 aa  45.1  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1262  glutaredoxin 2  38.67 
 
 
215 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.224556 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0847  glutaredoxin  34.21 
 
 
84 aa  43.9  0.0008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.352603  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1578  glutaredoxin 2  40 
 
 
215 aa  43.5  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0256  glutaredoxin  32.91 
 
 
86 aa  41.2  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.296093  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26662  predicted protein  33.73 
 
 
317 aa  41.2  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0886  glutaredoxin  33.33 
 
 
87 aa  40.8  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.289839  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2107  glutaredoxin  32 
 
 
94 aa  40.4  0.009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.367569  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>