61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2410 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2410  glutaredoxin  100 
 
 		 123 aa  255  1e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.786564  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1899  glutaredoxin  64.23 
 
 		 123 aa  176  9e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.508072 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2745  glutaredoxin  60.33 
 
 		 122 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0841717  normal  0.856746 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42020  hypothetical protein  61.16 
 
 		 123 aa  161  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1430  glutaredoxin  59.5 
 
 		 123 aa  156  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.11658  normal  0.297548 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3567  hypothetical protein  58.68 
 
 		 123 aa  155  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1822  glutaredoxin  56.2 
 
 		 123 aa  148  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0545572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1400  glutaredoxin  57.02 
 
 		 123 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.111122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3889  glutaredoxin  56.2 
 
 		 123 aa  148  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.280842 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05393  hypothetical protein  53.78 
 
 		 119 aa  142  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0816  putative glutaredoxin  50.85 
 
 		 119 aa  140  7e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2034  hypothetical protein  53.66 
 
 		 125 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144107  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001457  glutaredoxin  49.58 
 
 		 119 aa  135  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1714  hypothetical protein  53.33 
 
 		 123 aa  135  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1844  hypothetical protein  52.94 
 
 		 121 aa  130  5e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.322707 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2005  glutaredoxin  49.59 
 
 		 118 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.916013  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1540  ATP-dependent helicase HrpB  47.06 
 
 		 121 aa  125  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1830  glutaredoxin  46.28 
 
 		 118 aa  124  6e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0383849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1562  glutaredoxin  47.93 
 
 		 118 aa  122  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2579  glutaredoxin  47.93 
 
 		 118 aa  120  5e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.201508 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2417  glutaredoxin  47.93 
 
 		 118 aa  120  8e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.656384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2487  glutaredoxin  47.93 
 
 		 118 aa  120  8e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0780124  normal  0.16751 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2758  glutaredoxin  46.55 
 
 		 118 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.334545  normal  0.0243575 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1598  glutaredoxin  44.83 
 
 		 118 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.328495  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2797  hypothetical protein  47.11 
 
 		 118 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3628  glutaredoxin  45.45 
 
 		 118 aa  115  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0167  glutaredoxin family protein  42.74 
 
 		 130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.08495 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1501  glutaredoxin  43.8 
 
 		 118 aa  114  3e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.676522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1594  glutaredoxin  41.32 
 
 		 118 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1688  glutaredoxin  43.8 
 
 		 118 aa  111  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1710  glutaredoxin  43.8 
 
 		 118 aa  111  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.382993  normal  0.506968 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2669  glutaredoxin  42.98 
 
 		 118 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0368347  normal  0.0510929 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0951  glutaredoxin  41.73 
 
 		 147 aa  110  7.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.40724  normal  0.0261252 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3634  hypothetical protein  42.37 
 
 		 124 aa  110  7.000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.466049  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1673  glutaredoxin  42.98 
 
 		 118 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2379  glutaredoxin family protein  42.19 
 
 		 130 aa  108  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.272824  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1103  glutaredoxin family protein  40.32 
 
 		 130 aa  107  4.0000000000000004e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000207624  normal  0.596308 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1032  glutaredoxin  42.28 
 
 		 130 aa  106  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.783959  normal  0.67876 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4059  glutaredoxin  40.32 
 
 		 130 aa  105  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3222  glutaredoxin  46.32 
 
 		 115 aa  97.4  6e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0827  putative glutaredoxin  46.25 
 
 		 89 aa  86.3  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0213  glutaredoxin  30.85 
 
 		 118 aa  58.2  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.989623  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29383  predicted protein  30.84 
 
 		 309 aa  55.1  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.066564  normal  0.454968 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0976  glutaredoxin  39.51 
 
 		 105 aa  48.9  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0847  glutaredoxin  28.05 
 
 		 84 aa  48.5  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.352603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1387  glutaredoxin  29.49 
 
 		 77 aa  48.1  0.00004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.252635  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11170  glutaredoxin  34.67 
 
 		 78 aa  47  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2423  glutaredoxin  24.39 
 
 		 85 aa  47  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1787  glutaredoxin  28.05 
 
 		 84 aa  45.8  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.75758  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12420  glutaredoxin-like protein  36 
 
 		 82 aa  46.2  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0256  glutaredoxin  26.83 
 
 		 86 aa  45.4  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.296093  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0406  glutaredoxin  30.86 
 
 		 86 aa  45.1  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.394009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07400  glutaredoxin-like protein  32.5 
 
 		 82 aa  45.4  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1084  glutaredoxin  35.14 
 
 		 103 aa  45.4  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1175  glutaredoxin  27.71 
 
 		 82 aa  44.7  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2107  glutaredoxin  30.77 
 
 		 94 aa  43.9  0.0008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.367569  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1950  glutaredoxin  32.93 
 
 		 80 aa  43.5  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000181605  normal  0.405053 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119472  Carotenoid dioxygenase plastidic fusion protein, putative  31.58 
 
 		 914 aa  42.4  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0452333  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5304  glutaredoxin  28.57 
 
 		 148 aa  40.8  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0886  glutaredoxin  29.49 
 
 		 87 aa  40.8  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.289839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2195  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.33 
 
 		 284 aa  40.4  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>