63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_11170 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_11170  glutaredoxin  100 
 
 
78 aa  163  6.9999999999999995e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07400  glutaredoxin-like protein  45.68 
 
 
82 aa  80.5  0.000000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1950  glutaredoxin  47.44 
 
 
80 aa  78.6  0.00000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000181605  normal  0.405053 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0976  glutaredoxin  44.44 
 
 
105 aa  74.7  0.0000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1084  glutaredoxin  41.33 
 
 
103 aa  67.8  0.00000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1387  glutaredoxin  42.11 
 
 
77 aa  65.5  0.0000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.252635  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0827  putative glutaredoxin  41.56 
 
 
89 aa  63.9  0.0000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3222  glutaredoxin  45.83 
 
 
115 aa  62.8  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12420  glutaredoxin-like protein  40.85 
 
 
82 aa  62  0.000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001457  glutaredoxin  43.24 
 
 
119 aa  60.8  0.000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05393  hypothetical protein  40.54 
 
 
119 aa  58.9  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2745  glutaredoxin  41.56 
 
 
122 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0841717  normal  0.856746 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0816  putative glutaredoxin  38.67 
 
 
119 aa  57  0.00000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0167  glutaredoxin family protein  37.18 
 
 
130 aa  56.2  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.08495 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1540  ATP-dependent helicase HrpB  37.04 
 
 
121 aa  55.8  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1032  glutaredoxin  39.74 
 
 
130 aa  54.7  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.783959  normal  0.67876 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0951  glutaredoxin  34.67 
 
 
147 aa  54.7  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.40724  normal  0.0261252 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1175  glutaredoxin  32.05 
 
 
82 aa  53.1  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1430  glutaredoxin  39.19 
 
 
123 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.11658  normal  0.297548 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1714  hypothetical protein  36.36 
 
 
123 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1400  glutaredoxin  36.36 
 
 
123 aa  52  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.111122  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2379  glutaredoxin family protein  35.06 
 
 
130 aa  52.4  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.272824  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3567  hypothetical protein  38.16 
 
 
123 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3889  glutaredoxin  36.36 
 
 
123 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.280842 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1822  glutaredoxin  36.36 
 
 
123 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0545572  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0213  glutaredoxin  39.19 
 
 
118 aa  50.8  0.000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.989623  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0847  glutaredoxin  35.44 
 
 
84 aa  50.8  0.000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.352603  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3634  hypothetical protein  36.84 
 
 
124 aa  50.1  0.000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.466049  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42020  hypothetical protein  37.33 
 
 
123 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2797  hypothetical protein  38.16 
 
 
118 aa  48.1  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0256  glutaredoxin  35.8 
 
 
86 aa  48.5  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.296093  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1787  glutaredoxin  34.57 
 
 
84 aa  47.4  0.00007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.75758  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2410  glutaredoxin  34.67 
 
 
123 aa  47  0.00008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.786564  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1562  glutaredoxin  36.84 
 
 
118 aa  46.6  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2034  hypothetical protein  35.53 
 
 
125 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144107  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1844  hypothetical protein  34.21 
 
 
121 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.322707 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1594  glutaredoxin  36.36 
 
 
118 aa  46.6  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2005  glutaredoxin  33.33 
 
 
118 aa  45.4  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.916013  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1103  glutaredoxin family protein  30.38 
 
 
130 aa  46.2  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000207624  normal  0.596308 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2423  glutaredoxin  30.38 
 
 
85 aa  45.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2195  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.36 
 
 
284 aa  45.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1688  glutaredoxin  36.84 
 
 
118 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1830  glutaredoxin  37.66 
 
 
118 aa  45.1  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0383849  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0169  glutaredoxin  37.04 
 
 
402 aa  45.1  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0406  glutaredoxin  33.9 
 
 
383 aa  45.1  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0240048  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1710  glutaredoxin  36.84 
 
 
118 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.382993  normal  0.506968 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2669  glutaredoxin  36.84 
 
 
118 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0368347  normal  0.0510929 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1673  glutaredoxin  36.84 
 
 
118 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29383  predicted protein  34.67 
 
 
309 aa  45.1  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.066564  normal  0.454968 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4059  glutaredoxin  32.47 
 
 
130 aa  44.3  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2758  glutaredoxin  33.33 
 
 
118 aa  43.9  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.334545  normal  0.0243575 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1899  glutaredoxin  35.14 
 
 
123 aa  43.9  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.508072 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2487  glutaredoxin  36.84 
 
 
118 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0780124  normal  0.16751 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2579  glutaredoxin  36.84 
 
 
118 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.201508 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2417  glutaredoxin  36.84 
 
 
118 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.656384  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1496  glutaredoxin 3  29.58 
 
 
85 aa  42  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5304  glutaredoxin  33.33 
 
 
148 aa  42  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3628  glutaredoxin  37.68 
 
 
118 aa  42  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3049  glutaredoxin  28.07 
 
 
391 aa  42  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1145  glutaredoxin  29.85 
 
 
77 aa  40.8  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1167  glutaredoxin  29.85 
 
 
77 aa  40.8  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.957373  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1501  glutaredoxin  35.21 
 
 
118 aa  40.4  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.676522  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1501  hypothetical protein  25.37 
 
 
398 aa  40  0.01  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.226157 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>