52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1084 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_1084  glutaredoxin  100 
 
 		 103 aa  208  3e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0976  glutaredoxin  46.59 
 
 		 105 aa  84.3  5e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1950  glutaredoxin  44.87 
 
 		 80 aa  70.5  0.000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000181605  normal  0.405053 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11170  glutaredoxin  41.33 
 
 		 78 aa  67.8  0.00000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12420  glutaredoxin-like protein  44.16 
 
 		 82 aa  65.1  0.0000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1387  glutaredoxin  43.9 
 
 		 77 aa  58.9  0.00000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.252635  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07400  glutaredoxin-like protein  41.1 
 
 		 82 aa  57.8  0.00000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1032  glutaredoxin  33.73 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.783959  normal  0.67876 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1562  glutaredoxin  34.57 
 
 		 118 aa  48.5  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001457  glutaredoxin  28.92 
 
 		 119 aa  48.5  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05393  hypothetical protein  32.53 
 
 		 119 aa  48.5  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0816  putative glutaredoxin  31.33 
 
 		 119 aa  48.1  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42020  hypothetical protein  32.53 
 
 		 123 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1501  glutaredoxin  36.14 
 
 		 118 aa  48.1  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.676522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3567  hypothetical protein  35.14 
 
 		 123 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2745  glutaredoxin  33.78 
 
 		 122 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0841717  normal  0.856746 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1899  glutaredoxin  36.14 
 
 		 123 aa  47.8  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.508072 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1714  hypothetical protein  31.33 
 
 		 123 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0167  glutaredoxin family protein  32.53 
 
 		 130 aa  47.8  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.08495 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1540  ATP-dependent helicase HrpB  32.91 
 
 		 121 aa  47.4  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2797  hypothetical protein  36 
 
 		 118 aa  47  0.00009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2005  glutaredoxin  34.94 
 
 		 118 aa  46.6  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.916013  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1430  glutaredoxin  33.78 
 
 		 123 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.11658  normal  0.297548 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1400  glutaredoxin  36.49 
 
 		 123 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.111122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0951  glutaredoxin  28.92 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.40724  normal  0.0261252 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1175  glutaredoxin  30.49 
 
 		 82 aa  45.4  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3889  glutaredoxin  36.49 
 
 		 123 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.280842 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1822  glutaredoxin  36.49 
 
 		 123 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0545572  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0827  putative glutaredoxin  32.58 
 
 		 89 aa  45.1  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1103  glutaredoxin family protein  34.15 
 
 		 130 aa  45.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000207624  normal  0.596308 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2410  glutaredoxin  35.14 
 
 		 123 aa  45.4  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.786564  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2379  glutaredoxin family protein  34.62 
 
 		 130 aa  44.3  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.272824  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3472  glutaredoxin family protein  35.14 
 
 		 243 aa  44.3  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.99974  normal  0.318929 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1594  glutaredoxin  33.73 
 
 		 118 aa  44.3  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1598  glutaredoxin  36 
 
 		 118 aa  43.9  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.328495  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0213  glutaredoxin  37.66 
 
 		 118 aa  43.9  0.0007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.989623  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1830  glutaredoxin  33.33 
 
 		 118 aa  43.9  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0383849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2579  glutaredoxin  36 
 
 		 118 aa  43.9  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.201508 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0127  glutaredoxin 3  25.93 
 
 		 86 aa  43.5  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.243764  normal  0.0245939 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3634  hypothetical protein  29.49 
 
 		 124 aa  43.5  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.466049  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2417  glutaredoxin  34.67 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.656384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2487  glutaredoxin  34.67 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0780124  normal  0.16751 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2669  glutaredoxin  31.03 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0368347  normal  0.0510929 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1710  glutaredoxin  31.4 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.382993  normal  0.506968 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1688  glutaredoxin  31.4 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1673  glutaredoxin  31.03 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3222  glutaredoxin  30.49 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2423  glutaredoxin  27.91 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4776  glutaredoxin family protein  30.77 
 
 		 243 aa  42  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112593 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2758  glutaredoxin  33.33 
 
 		 118 aa  41.6  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.334545  normal  0.0243575 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4059  glutaredoxin  30.68 
 
 		 130 aa  41.2  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29383  predicted protein  33 
 
 		 309 aa  40.4  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.066564  normal  0.454968 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>