72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2745 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2745  glutaredoxin  100 
 
 		 122 aa  251  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0841717  normal  0.856746 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1822  glutaredoxin  73.77 
 
 		 123 aa  195  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0545572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1400  glutaredoxin  73.77 
 
 		 123 aa  194  3e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.111122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3889  glutaredoxin  73.55 
 
 		 123 aa  193  6e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.280842 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1430  glutaredoxin  72.95 
 
 		 123 aa  189  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.11658  normal  0.297548 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3567  hypothetical protein  69.42 
 
 		 123 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42020  hypothetical protein  68.6 
 
 		 123 aa  181  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2034  hypothetical protein  65.57 
 
 		 125 aa  168  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144107  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1714  hypothetical protein  65.57 
 
 		 123 aa  167  6e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2410  glutaredoxin  60.33 
 
 		 123 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.786564  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1844  hypothetical protein  63.33 
 
 		 121 aa  157  4e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.322707 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0816  putative glutaredoxin  51.69 
 
 		 119 aa  145  2.0000000000000003e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05393  hypothetical protein  53.78 
 
 		 119 aa  144  5e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001457  glutaredoxin  51.26 
 
 		 119 aa  137  4.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1899  glutaredoxin  47.11 
 
 		 123 aa  135  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.508072 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3628  glutaredoxin  53.45 
 
 		 118 aa  133  7.000000000000001e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1598  glutaredoxin  47.41 
 
 		 118 aa  131  3e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.328495  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2005  glutaredoxin  50.43 
 
 		 118 aa  128  3e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.916013  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0167  glutaredoxin family protein  48.78 
 
 		 130 aa  128  3e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.08495 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2379  glutaredoxin family protein  48.36 
 
 		 130 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.272824  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1594  glutaredoxin  50 
 
 		 118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2579  glutaredoxin  52.59 
 
 		 118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.201508 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2797  hypothetical protein  52.59 
 
 		 118 aa  124  3e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2758  glutaredoxin  50.86 
 
 		 118 aa  124  5e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.334545  normal  0.0243575 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0951  glutaredoxin  48.33 
 
 		 147 aa  123  7e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.40724  normal  0.0261252 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1830  glutaredoxin  50.89 
 
 		 118 aa  123  8.000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0383849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1710  glutaredoxin  52.59 
 
 		 118 aa  122  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.382993  normal  0.506968 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1562  glutaredoxin  51.72 
 
 		 118 aa  122  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1688  glutaredoxin  52.59 
 
 		 118 aa  123  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2487  glutaredoxin  51.72 
 
 		 118 aa  123  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0780124  normal  0.16751 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2417  glutaredoxin  51.72 
 
 		 118 aa  123  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.656384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2669  glutaredoxin  51.72 
 
 		 118 aa  121  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0368347  normal  0.0510929 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1673  glutaredoxin  51.72 
 
 		 118 aa  121  3e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1501  glutaredoxin  50 
 
 		 118 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.676522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1540  ATP-dependent helicase HrpB  49.56 
 
 		 121 aa  118  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1103  glutaredoxin family protein  43.44 
 
 		 130 aa  114  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000207624  normal  0.596308 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3634  hypothetical protein  45.3 
 
 		 124 aa  114  3.9999999999999997e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.466049  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1032  glutaredoxin  45 
 
 		 130 aa  113  6.9999999999999995e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.783959  normal  0.67876 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4059  glutaredoxin  44.26 
 
 		 130 aa  111  4.0000000000000004e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3222  glutaredoxin  49.47 
 
 		 115 aa  100  7e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0827  putative glutaredoxin  45.57 
 
 		 89 aa  84.3  5e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0213  glutaredoxin  44.05 
 
 		 118 aa  78.2  0.00000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.989623  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29383  predicted protein  33.04 
 
 		 309 aa  64.3  0.0000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.066564  normal  0.454968 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2423  glutaredoxin  32.1 
 
 		 85 aa  58.5  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11170  glutaredoxin  41.56 
 
 		 78 aa  58.5  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1175  glutaredoxin  32.93 
 
 		 82 aa  56.6  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5304  glutaredoxin  40 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0847  glutaredoxin  34.15 
 
 		 84 aa  55.8  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.352603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07400  glutaredoxin-like protein  39.24 
 
 		 82 aa  54.7  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2107  glutaredoxin  35.29 
 
 		 94 aa  54.3  0.0000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.367569  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0976  glutaredoxin  35.37 
 
 		 105 aa  52.4  0.000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1787  glutaredoxin  33.33 
 
 		 84 aa  51.6  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.75758  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2195  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.93 
 
 		 284 aa  51.2  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12420  glutaredoxin-like protein  34.62 
 
 		 82 aa  49.7  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0256  glutaredoxin  32.1 
 
 		 86 aa  49.3  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.296093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45400  predicted protein  29.7 
 
 		 342 aa  48.5  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1084  glutaredoxin  33.78 
 
 		 103 aa  48.1  0.00004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1950  glutaredoxin  41.33 
 
 		 80 aa  47  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000181605  normal  0.405053 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0406  glutaredoxin  31.65 
 
 		 86 aa  46.6  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.394009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1282  Glutathione S-transferase domain protein  34.18 
 
 		 225 aa  44.7  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0886  glutaredoxin  31.65 
 
 		 87 aa  43.9  0.0008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.289839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1387  glutaredoxin  27.78 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.252635  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29981  predicted protein  31 
 
 		 311 aa  41.6  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0281173  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1277  glutaredoxin 2  32.89 
 
 		 215 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0995017  normal  0.525696 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1233  glutaredoxin 2  32.89 
 
 		 215 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.929078  normal  0.25689 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2023  glutaredoxin 2  32.89 
 
 		 215 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2207  glutaredoxin 2  32.89 
 
 		 215 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.158739 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2899  glutaredoxin-like protein, YruB-family  29.49 
 
 		 81 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0982  glutaredoxin  29.7 
 
 		 116 aa  40.8  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0048  glutaredoxin  28.92 
 
 		 105 aa  40.8  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0556  glutaredoxin  28.38 
 
 		 77 aa  40.8  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0146434  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1262  glutaredoxin 2  31.58 
 
 		 215 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.224556 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>