69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0886 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0886  glutaredoxin  100 
 
 
87 aa  180  7e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.289839  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2107  glutaredoxin  75.61 
 
 
94 aa  134  3.0000000000000003e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.367569  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0406  glutaredoxin  70.59 
 
 
86 aa  132  9.999999999999999e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.394009  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1712  glutaredoxin  77.22 
 
 
114 aa  132  9.999999999999999e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.266402  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0048  glutaredoxin  72.62 
 
 
105 aa  132  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0554  glutaredoxin  59.74 
 
 
78 aa  100  9e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2625  glutaredoxin  55.56 
 
 
86 aa  99.4  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.253894  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2946  glutaredoxin  54.55 
 
 
78 aa  94  6e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.758078  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2348  glutaredoxin  52.63 
 
 
79 aa  92.4  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0181488 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1787  glutaredoxin  47.5 
 
 
84 aa  79.7  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.75758  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0847  glutaredoxin  47.5 
 
 
84 aa  79  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.352603  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0256  glutaredoxin  42.35 
 
 
86 aa  73.9  0.0000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.296093  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2423  glutaredoxin  44.44 
 
 
85 aa  73.6  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1175  glutaredoxin  46.15 
 
 
82 aa  65.5  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2034  hypothetical protein  35.44 
 
 
125 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144107  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12420  glutaredoxin-like protein  37.5 
 
 
82 aa  47  0.00008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2797  hypothetical protein  32.5 
 
 
118 aa  47  0.00009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2195  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.71 
 
 
284 aa  47  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1282  Glutathione S-transferase domain protein  30.49 
 
 
225 aa  46.6  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29383  predicted protein  31.76 
 
 
309 aa  46.2  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.066564  normal  0.454968 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119472  Carotenoid dioxygenase plastidic fusion protein, putative  31.58 
 
 
914 aa  46.6  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0452333  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1830  glutaredoxin  36.14 
 
 
118 aa  46.2  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0383849  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05393  hypothetical protein  32.5 
 
 
119 aa  45.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26662  predicted protein  33.77 
 
 
317 aa  45.1  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2579  glutaredoxin  33.33 
 
 
118 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.201508 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45400  predicted protein  33.33 
 
 
342 aa  44.7  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2487  glutaredoxin  32.1 
 
 
118 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0780124  normal  0.16751 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2417  glutaredoxin  32.1 
 
 
118 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.656384  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1250  glutaredoxin  35.37 
 
 
83 aa  44.3  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.461543  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0951  glutaredoxin  34.44 
 
 
147 aa  43.9  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.40724  normal  0.0261252 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1598  glutaredoxin  29.89 
 
 
118 aa  43.9  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.328495  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2745  glutaredoxin  31.65 
 
 
122 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0841717  normal  0.856746 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0816  putative glutaredoxin  31.17 
 
 
119 aa  43.1  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1562  glutaredoxin  30 
 
 
118 aa  43.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1714  hypothetical protein  30.38 
 
 
123 aa  43.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1950  glutaredoxin  33.78 
 
 
80 aa  42.4  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000181605  normal  0.405053 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1430  glutaredoxin  32.91 
 
 
123 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.11658  normal  0.297548 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1710  glutaredoxin  31.25 
 
 
118 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.382993  normal  0.506968 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001457  glutaredoxin  29.49 
 
 
119 aa  42.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1948  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.53 
 
 
232 aa  42.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1899  glutaredoxin  31.65 
 
 
123 aa  42.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.508072 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1688  glutaredoxin  31.25 
 
 
118 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1673  glutaredoxin  31.65 
 
 
118 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3218  glutaredoxin  33.93 
 
 
395 aa  41.6  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1844  hypothetical protein  31.65 
 
 
121 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.322707 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2669  glutaredoxin  31.65 
 
 
118 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0368347  normal  0.0510929 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3634  hypothetical protein  32 
 
 
124 aa  41.6  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.466049  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0213  glutaredoxin  34.12 
 
 
118 aa  41.6  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.989623  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01251  putative glutathione S-transferase  34.62 
 
 
241 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.621374 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2549  glutaredoxin 2  28.57 
 
 
226 aa  41.2  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.511119 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3222  glutaredoxin  29.11 
 
 
115 aa  40.8  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2758  glutaredoxin  30.12 
 
 
118 aa  40.8  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.334545  normal  0.0243575 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0078  glutaredoxin  27.38 
 
 
84 aa  40.8  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1032  glutaredoxin  33.33 
 
 
130 aa  40.8  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.783959  normal  0.67876 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0715  glutaredoxin 3  33.9 
 
 
91 aa  40.4  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2410  glutaredoxin  29.49 
 
 
123 aa  40.8  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.786564  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1859  glutaredoxin 3  37.93 
 
 
87 aa  40.4  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.543286  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0788  glutathione S-transferase  33.33 
 
 
264 aa  40.8  0.007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.200068 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1400  glutaredoxin  30.59 
 
 
123 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.111122  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3889  glutaredoxin  32.1 
 
 
123 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.280842 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4194  glutathione S-transferase  34.25 
 
 
209 aa  40.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2019  glutaredoxin GrxC  37.93 
 
 
87 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.908829  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1822  glutaredoxin  30.59 
 
 
123 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0545572  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3628  glutaredoxin  30 
 
 
118 aa  40.4  0.008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3181  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.25 
 
 
207 aa  40.4  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0113  putative glutathione S-transferase  32.43 
 
 
241 aa  40.4  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0854  Glutathione S-transferase domain protein  34.21 
 
 
263 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0881  glutathione S-transferase domain protein  34.21 
 
 
263 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0898679  normal  0.46136 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2379  glutaredoxin family protein  31.58 
 
 
130 aa  40  0.01  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.272824  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>