46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2053 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_2053  hypothetical protein  100 
 
 
87 aa  172  9.999999999999999e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3239  hypothetical protein  62.79 
 
 
90 aa  116  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0256  glutaredoxin  47.13 
 
 
86 aa  58.2  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.296093  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0847  glutaredoxin  45.98 
 
 
84 aa  57  0.00000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.352603  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29383  predicted protein  36.05 
 
 
309 aa  54.7  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.066564  normal  0.454968 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2195  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.7 
 
 
284 aa  54.3  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2423  glutaredoxin  41.38 
 
 
85 aa  53.5  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1787  glutaredoxin  38.64 
 
 
84 aa  52.8  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.75758  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4025  hypothetical protein  69.7 
 
 
50 aa  51.2  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3222  glutaredoxin  37.08 
 
 
115 aa  48.9  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1714  hypothetical protein  31.82 
 
 
123 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1688  glutaredoxin  30.68 
 
 
118 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1710  glutaredoxin  30.68 
 
 
118 aa  47.4  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.382993  normal  0.506968 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2797  hypothetical protein  31.82 
 
 
118 aa  46.6  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1175  glutaredoxin  36.67 
 
 
82 aa  46.6  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1032  glutaredoxin  36.67 
 
 
130 aa  45.8  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.783959  normal  0.67876 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2669  glutaredoxin  29.55 
 
 
118 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0368347  normal  0.0510929 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1673  glutaredoxin  29.55 
 
 
118 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0554  glutaredoxin  31.18 
 
 
78 aa  45.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001457  glutaredoxin  36.78 
 
 
119 aa  44.7  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1400  glutaredoxin  32.58 
 
 
123 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.111122  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05393  hypothetical protein  35.63 
 
 
119 aa  44.3  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1822  glutaredoxin  32.58 
 
 
123 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0545572  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3889  glutaredoxin  32.58 
 
 
123 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.280842 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1282  Glutathione S-transferase domain protein  31.03 
 
 
225 aa  43.9  0.0007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1562  glutaredoxin  30.68 
 
 
118 aa  43.9  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2946  glutaredoxin  31.18 
 
 
78 aa  43.5  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.758078  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1103  glutaredoxin family protein  26.97 
 
 
130 aa  43.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000207624  normal  0.596308 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26662  predicted protein  37.21 
 
 
317 aa  42.7  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2579  glutaredoxin  31.11 
 
 
118 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.201508 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42020  hypothetical protein  32.58 
 
 
123 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3567  hypothetical protein  32.58 
 
 
123 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1501  glutaredoxin  28.41 
 
 
118 aa  42.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.676522  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2348  glutaredoxin  31.71 
 
 
79 aa  42.7  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0181488 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2487  glutaredoxin  29.55 
 
 
118 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0780124  normal  0.16751 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2417  glutaredoxin  29.55 
 
 
118 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.656384  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0976  glutaredoxin  32.56 
 
 
105 aa  42  0.003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1950  glutaredoxin  29.76 
 
 
80 aa  41.6  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000181605  normal  0.405053 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1899  glutaredoxin  34.09 
 
 
123 aa  42  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.508072 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2625  glutaredoxin  32.95 
 
 
86 aa  41.6  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.253894  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12420  glutaredoxin-like protein  37.8 
 
 
82 aa  41.2  0.005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1430  glutaredoxin  31.46 
 
 
123 aa  40.8  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.11658  normal  0.297548 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1844  hypothetical protein  28.74 
 
 
121 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.322707 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1830  glutaredoxin  29.21 
 
 
118 aa  40.8  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0383849  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4059  glutaredoxin  28.09 
 
 
130 aa  40.4  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119472  Carotenoid dioxygenase plastidic fusion protein, putative  35.44 
 
 
914 aa  40.4  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0452333  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>