29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0048 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_0048  glutaredoxin  100 
 
 
105 aa  213  7e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1712  glutaredoxin  72.82 
 
 
114 aa  157  6e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.266402  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0406  glutaredoxin  77.38 
 
 
86 aa  143  9e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.394009  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0886  glutaredoxin  72.62 
 
 
87 aa  132  1.9999999999999998e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.289839  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2107  glutaredoxin  67.74 
 
 
94 aa  131  3e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.367569  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0554  glutaredoxin  59.74 
 
 
78 aa  101  4e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2625  glutaredoxin  58.75 
 
 
86 aa  100  6e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.253894  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2946  glutaredoxin  55.84 
 
 
78 aa  93.6  7e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.758078  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2348  glutaredoxin  49.32 
 
 
79 aa  84.3  5e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0181488 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1787  glutaredoxin  50 
 
 
84 aa  80.5  0.000000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.75758  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0256  glutaredoxin  46.84 
 
 
86 aa  77  0.00000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.296093  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2423  glutaredoxin  49.38 
 
 
85 aa  75.9  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0847  glutaredoxin  47.44 
 
 
84 aa  75.5  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.352603  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1175  glutaredoxin  47.5 
 
 
82 aa  68.2  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119472  Carotenoid dioxygenase plastidic fusion protein, putative  34.57 
 
 
914 aa  60.8  0.000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0452333  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29383  predicted protein  37.66 
 
 
309 aa  55.8  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.066564  normal  0.454968 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45400  predicted protein  38.75 
 
 
342 aa  55.1  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26662  predicted protein  33.33 
 
 
317 aa  52.4  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2195  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.18 
 
 
284 aa  50.4  0.000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1282  Glutathione S-transferase domain protein  32.05 
 
 
225 aa  48.9  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0788  glutathione S-transferase  33.33 
 
 
264 aa  44.7  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.200068 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0976  glutaredoxin  29.21 
 
 
105 aa  43.1  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1950  glutaredoxin  31.08 
 
 
80 aa  42.7  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000181605  normal  0.405053 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01231  putative glutathione S-transferase  29.17 
 
 
241 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.168526  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2034  hypothetical protein  30.38 
 
 
125 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144107  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01251  putative glutathione S-transferase  32.05 
 
 
241 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.621374 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0827  putative glutaredoxin  24.72 
 
 
89 aa  40.8  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2745  glutaredoxin  28.92 
 
 
122 aa  40.8  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0841717  normal  0.856746 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0113  putative glutathione S-transferase  30.14 
 
 
241 aa  40.4  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>