27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_1712 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_1712  glutaredoxin  100 
 
 
114 aa  232  1.0000000000000001e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.266402  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0048  glutaredoxin  72.82 
 
 
105 aa  157  6e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0886  glutaredoxin  77.22 
 
 
87 aa  132  9.999999999999999e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.289839  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0406  glutaredoxin  71.95 
 
 
86 aa  133  9.999999999999999e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.394009  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2107  glutaredoxin  62.89 
 
 
94 aa  128  2.0000000000000002e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.367569  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0554  glutaredoxin  61.04 
 
 
78 aa  100  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2625  glutaredoxin  57.14 
 
 
86 aa  95.5  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.253894  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2946  glutaredoxin  55.84 
 
 
78 aa  93.6  8e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.758078  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2348  glutaredoxin  48 
 
 
79 aa  83.6  9e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0181488 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1787  glutaredoxin  49.38 
 
 
84 aa  81.6  0.000000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.75758  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0256  glutaredoxin  47.44 
 
 
86 aa  74.3  0.0000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.296093  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2423  glutaredoxin  48.78 
 
 
85 aa  73.9  0.0000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0847  glutaredoxin  45.57 
 
 
84 aa  72.4  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.352603  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1175  glutaredoxin  49.38 
 
 
82 aa  68.6  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29383  predicted protein  37.97 
 
 
309 aa  52  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.066564  normal  0.454968 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119472  Carotenoid dioxygenase plastidic fusion protein, putative  29.76 
 
 
914 aa  52.4  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0452333  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45400  predicted protein  33.02 
 
 
342 aa  52  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2195  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.43 
 
 
284 aa  50.8  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26662  predicted protein  32.14 
 
 
317 aa  50.1  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1282  Glutathione S-transferase domain protein  32.47 
 
 
225 aa  50.1  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0976  glutaredoxin  30.77 
 
 
105 aa  45.1  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1950  glutaredoxin  31.08 
 
 
80 aa  42.7  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000181605  normal  0.405053 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00524  glutathione S-transferase  31.94 
 
 
234 aa  42.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01251  putative glutathione S-transferase  34.25 
 
 
241 aa  41.2  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.621374 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1250  glutaredoxin  34.94 
 
 
83 aa  41.2  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.461543  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01821  putative glutathione S-transferase  28.77 
 
 
239 aa  40.8  0.007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0879846  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2034  hypothetical protein  30 
 
 
125 aa  40.8  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144107  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>