97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7384 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011981  Avi_7384  glutaredoxin protein  100 
 
 		 99 aa  209  9e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.405165  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0314  glutaredoxin-like protein nrdH  73.97 
 
 		 73 aa  125  2.0000000000000002e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.24062  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2952  glutaredoxin-like protein NrdH  73.97 
 
 		 73 aa  125  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.794387  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0290  glutaredoxin-like protein nrdH  73.97 
 
 		 115 aa  125  3e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0883091  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10180  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  72.6 
 
 		 81 aa  116  9e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.521827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4375  glutaredoxin-like protein NrdH  72.6 
 
 		 73 aa  116  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.509637 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3795  glutaredoxin-like protein NrdH  72.6 
 
 		 73 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3500  glutaredoxin-like protein NrdH  71.23 
 
 		 73 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.855754 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0354  glutaredoxin-like protein NrdH  67.12 
 
 		 74 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2439  glutaredoxin-like protein NrdH  67.12 
 
 		 79 aa  110  4.0000000000000004e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.354839  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0521  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  65.75 
 
 		 73 aa  110  7.000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.317341  normal  0.144081 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13069  glutaredoxin-like electron transport protein nrdH  65.75 
 
 		 79 aa  107  7.000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.193738 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1065  glutaredoxin-related protein NrdH  61.64 
 
 		 78 aa  107  7.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0223724  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1119  glutaredoxin-like protein NrdH  61.64 
 
 		 78 aa  107  7.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.556674  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3540  glutaredoxin-related protein NrdH  61.64 
 
 		 78 aa  107  7.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00255736  hitchhiker  0.0090017 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0803  glutaredoxin-like protein NrdH  64.38 
 
 		 79 aa  105  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.815074 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3453  glutaredoxin-like protein NrdH  65.75 
 
 		 81 aa  105  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3721  glutaredoxin-like protein NrdH  60.27 
 
 		 78 aa  104  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.75993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1862  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  64.79 
 
 		 83 aa  104  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.150892 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1815  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  64.79 
 
 		 83 aa  104  4e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.389601  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1796  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  64.79 
 
 		 83 aa  104  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.297213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3291  glutaredoxin-like protein NrdH  64.38 
 
 		 77 aa  102  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4923  glutaredoxin-like protein NrdH  64.38 
 
 		 80 aa  103  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4307  glutaredoxin-like protein NrdH  64.79 
 
 		 98 aa  102  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1753  glutaredoxin-like protein NrdH  61.64 
 
 		 80 aa  102  2e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0638832 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2040  glutaredoxin-like protein NrdH  62.5 
 
 		 83 aa  102  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.672826 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0095  glutaredoxin-like protein NrdH  61.64 
 
 		 83 aa  102  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.729355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5535  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  67.14 
 
 		 81 aa  101  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.038319  hitchhiker  0.0000122398 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3131  glutaredoxin-like protein NrdH  58.33 
 
 		 79 aa  100  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1148  glutaredoxin-like protein NrdH  56.94 
 
 		 79 aa  99.8  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0446  glutaredoxin-like protein NrdH  64.38 
 
 		 81 aa  99  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0377  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  60.81 
 
 		 74 aa  99  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2119  glutaredoxin-like protein NrdH  58.9 
 
 		 81 aa  98.2  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000183339 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2971  glutaredoxin-like protein NrdH  61.43 
 
 		 82 aa  97.1  7e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.454074  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2358  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  60 
 
 		 81 aa  96.7  9e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.543231  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2421  glutaredoxin-like protein NrdH  63.51 
 
 		 77 aa  95.1  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24930  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  61.76 
 
 		 80 aa  94  6e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.515104  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10470  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  57.97 
 
 		 81 aa  90.5  6e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00700177  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0563  glutaredoxin-like protein NrdH  56.16 
 
 		 76 aa  87.4  6e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.629127  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3111  glutaredoxin-like protein  48.61 
 
 		 81 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.530275  normal  0.463603 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3153  glutaredoxin-like protein  47.95 
 
 		 84 aa  86.7  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00125974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2953  glutaredoxin-like protein  48.61 
 
 		 81 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0443282  normal  0.0122925 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2988  glutaredoxin-like protein  48.61 
 
 		 81 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0820177 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2922  glutaredoxin-like protein  48.61 
 
 		 81 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3005  glutaredoxin-like protein  48.61 
 
 		 81 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424268 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1014  glutaredoxin  54.17 
 
 		 77 aa  84.7  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2809  glutaredoxin-like protein  48.61 
 
 		 81 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1010  glutaredoxin-like protein NrdH  48.61 
 
 		 81 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1033  glutaredoxin-like protein  48.61 
 
 		 81 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2795  glutaredoxin-like protein  48.61 
 
 		 81 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0109554 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3206  glutaredoxin-like protein  48.61 
 
 		 81 aa  84.3  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3917  glutaredoxin-like protein  48.61 
 
 		 81 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0970287 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02493  hypothetical protein  48.61 
 
 		 81 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02529  glutaredoxin-like protein  48.61 
 
 		 81 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0179  glutaredoxin  46.58 
 
 		 86 aa  82.4  0.000000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1460  glutaredoxin  42.47 
 
 		 88 aa  77  0.00000000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4274  glutaredoxin-like protein NrdH  55.38 
 
 		 92 aa  74.3  0.0000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0820  ribonucleoside-diphosphate reductase 2, NrdH-redoxin  35.62 
 
 		 74 aa  61.6  0.000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.959383  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4233  glutaredoxin  38.16 
 
 		 90 aa  60.8  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00450128  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1247  glutaredoxin  35.82 
 
 		 74 aa  59.7  0.00000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000466466  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0139  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  40.58 
 
 		 81 aa  58.9  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0253  glutaredoxin-like protein  34.67 
 
 		 76 aa  59.3  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28890  hypothetical protein  44.16 
 
 		 285 aa  58.2  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.998422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4400  glutaredoxin  34.62 
 
 		 88 aa  57  0.00000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00125164  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1063  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  32.39 
 
 		 72 aa  52.4  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000290515  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0880  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  32.86 
 
 		 73 aa  52.4  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.121758  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2145  glutaredoxin  32.89 
 
 		 83 aa  52  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.201454  normal  0.150522 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2285  glutaredoxin  32.89 
 
 		 83 aa  52  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.304987 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5356  glutaredoxin 3  40.54 
 
 		 92 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460524  normal  0.957848 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0324  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  31.94 
 
 		 73 aa  50.8  0.000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0101839  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0451  hypothetical protein  38.18 
 
 		 255 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3219  YruB family glutaredoxin-like protein  34.25 
 
 		 82 aa  48.5  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.890073 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3049  glutaredoxin  36.49 
 
 		 391 aa  47.8  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4639  glutaredoxin  38.57 
 
 		 88 aa  47.4  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1508  glutaredoxin-like protein protein, YruB  33.78 
 
 		 81 aa  47.4  0.00007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00379246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0808  glutaredoxin 3  35.62 
 
 		 87 aa  46.6  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.166784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0084  glutaredoxin  35.14 
 
 		 384 aa  45.8  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.833578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0982  glutaredoxin  33.33 
 
 		 116 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1082  glutaredoxin  33.33 
 
 		 116 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.976199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1508  glutaredoxin  29.17 
 
 		 76 aa  44.3  0.0006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000114631  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0566  glutaredoxin family protein  31.88 
 
 		 83 aa  44.3  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.113719  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4052  glutaredoxin  33.33 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1772  glutaredoxin-like protein  38.1 
 
 		 89 aa  42.7  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.16885  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1264  glutaredoxin NrdH  32.84 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0898475  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2903  glutaredoxin GrxC  30.3 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.844851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2583  glutaredoxin  35.94 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1830  glutaredoxin  29.76 
 
 		 118 aa  41.6  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0383849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1555  glutaredoxin  31.34 
 
 		 87 aa  41.2  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000316577  normal  0.150299 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1737  glutaredoxin GrxC  31.34 
 
 		 87 aa  41.2  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0513723  normal  0.163963 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1501  glutaredoxin  30.11 
 
 		 118 aa  41.6  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.676522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0296  glutaredoxin GrxC  29.85 
 
 		 86 aa  41.2  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2064  glutaredoxin  28 
 
 		 78 aa  41.2  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4712  glutaredoxin-like protein  37.31 
 
 		 105 aa  40.8  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1790  glutaredoxin GrxC  33.33 
 
 		 86 aa  40.8  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.711086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3089  glutaredoxin 3  30.3 
 
 		 84 aa  40.8  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.393298  normal  0.343511 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0235  YruB family glutaredoxin-like protein  31.51 
 
 		 76 aa  40.4  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000377018  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0311  glutaredoxin 3  37.5 
 
 		 89 aa  40  0.01  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.257705  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>