109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0880 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008528  OEOE_0880  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  100 
 
 		 73 aa  154  3e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.121758  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2119  glutaredoxin-like protein NrdH  44.78 
 
 		 81 aa  71.2  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000183339 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2358  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  43.28 
 
 		 81 aa  67.8  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.543231  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02529  glutaredoxin-like protein  40.3 
 
 		 81 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1010  glutaredoxin-like protein NrdH  40.3 
 
 		 81 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2809  glutaredoxin-like protein  40.3 
 
 		 81 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1033  glutaredoxin-like protein  40.3 
 
 		 81 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2795  glutaredoxin-like protein  40.3 
 
 		 81 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0109554 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3917  glutaredoxin-like protein  40.3 
 
 		 81 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0970287 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02493  hypothetical protein  40.3 
 
 		 81 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3206  glutaredoxin-like protein  40.3 
 
 		 81 aa  67  0.00000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1063  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  35.21 
 
 		 72 aa  66.6  0.0000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000290515  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0563  glutaredoxin-like protein NrdH  44.78 
 
 		 76 aa  66.2  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.629127  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13069  glutaredoxin-like electron transport protein nrdH  40 
 
 		 79 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.193738 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0377  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  45.45 
 
 		 74 aa  65.1  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3153  glutaredoxin-like protein  37.31 
 
 		 84 aa  65.5  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00125974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0324  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  37.68 
 
 		 73 aa  65.1  0.0000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0101839  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3453  glutaredoxin-like protein NrdH  40 
 
 		 81 aa  65.1  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3291  glutaredoxin-like protein NrdH  44.29 
 
 		 77 aa  65.1  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1815  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  40.85 
 
 		 83 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.389601  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0253  glutaredoxin-like protein  42.65 
 
 		 76 aa  65.1  0.0000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1862  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  40.85 
 
 		 83 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.150892 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1796  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  40.85 
 
 		 83 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.297213  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1014  glutaredoxin  44.29 
 
 		 77 aa  64.7  0.0000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3131  glutaredoxin-like protein NrdH  38.57 
 
 		 79 aa  65.1  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2971  glutaredoxin-like protein NrdH  40.85 
 
 		 82 aa  64.7  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.454074  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0139  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  43.94 
 
 		 81 aa  64.7  0.0000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1148  glutaredoxin-like protein NrdH  38.57 
 
 		 79 aa  64.3  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1065  glutaredoxin-related protein NrdH  36.11 
 
 		 78 aa  63.9  0.0000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0223724  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3540  glutaredoxin-related protein NrdH  36.11 
 
 		 78 aa  63.9  0.0000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00255736  hitchhiker  0.0090017 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1119  glutaredoxin-like protein NrdH  36.11 
 
 		 78 aa  63.9  0.0000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.556674  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0095  glutaredoxin-like protein NrdH  34.29 
 
 		 83 aa  63.9  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.729355  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0820  ribonucleoside-diphosphate reductase 2, NrdH-redoxin  38.03 
 
 		 74 aa  63.9  0.0000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.959383  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2439  glutaredoxin-like protein NrdH  36.11 
 
 		 79 aa  63.5  0.0000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.354839  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2421  glutaredoxin-like protein NrdH  42.25 
 
 		 77 aa  63.2  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0095  glutaredoxin-like protein  43.06 
 
 		 76 aa  62.8  0.000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0141921  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4307  glutaredoxin-like protein NrdH  40 
 
 		 98 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3721  glutaredoxin-like protein NrdH  35.71 
 
 		 78 aa  62.8  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.75993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2040  glutaredoxin-like protein NrdH  40 
 
 		 83 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.672826 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10470  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  35.82 
 
 		 81 aa  62.4  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00700177  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4923  glutaredoxin-like protein NrdH  43.28 
 
 		 80 aa  62.4  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3005  glutaredoxin-like protein  37.31 
 
 		 81 aa  61.6  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424268 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2988  glutaredoxin-like protein  37.31 
 
 		 81 aa  61.6  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0820177 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2953  glutaredoxin-like protein  37.31 
 
 		 81 aa  61.6  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0443282  normal  0.0122925 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2922  glutaredoxin-like protein  37.31 
 
 		 81 aa  61.6  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3111  glutaredoxin-like protein  37.31 
 
 		 81 aa  62  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.530275  normal  0.463603 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1753  glutaredoxin-like protein NrdH  34.29 
 
 		 80 aa  61.6  0.000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0638832 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0446  glutaredoxin-like protein NrdH  40 
 
 		 81 aa  61.6  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10180  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  37.14 
 
 		 81 aa  61.2  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.521827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5535  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  37.31 
 
 		 81 aa  60.1  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.038319  hitchhiker  0.0000122398 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0314  glutaredoxin-like protein nrdH  34.29 
 
 		 73 aa  59.7  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.24062  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1247  glutaredoxin  37.31 
 
 		 74 aa  58.9  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000466466  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0290  glutaredoxin-like protein nrdH  34.29 
 
 		 115 aa  58.9  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0883091  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2952  glutaredoxin-like protein NrdH  34.29 
 
 		 73 aa  57.8  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.794387  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1460  glutaredoxin  30.77 
 
 		 88 aa  57.8  0.00000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3500  glutaredoxin-like protein NrdH  31.43 
 
 		 73 aa  57  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.855754 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3795  glutaredoxin-like protein NrdH  31.43 
 
 		 73 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1508  glutaredoxin  38.71 
 
 		 76 aa  56.6  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000114631  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4375  glutaredoxin-like protein NrdH  29.85 
 
 		 73 aa  55.8  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.509637 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24930  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  35.29 
 
 		 80 aa  56.2  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.515104  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0521  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  29.23 
 
 		 73 aa  55.5  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.317341  normal  0.144081 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0354  glutaredoxin-like protein NrdH  32.84 
 
 		 74 aa  54.7  0.0000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0803  glutaredoxin-like protein NrdH  31.43 
 
 		 79 aa  54.7  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.815074 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0179  glutaredoxin  28.57 
 
 		 86 aa  53.9  0.0000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1508  glutaredoxin-like protein protein, YruB  36.11 
 
 		 81 aa  53.1  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00379246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4639  glutaredoxin  35.71 
 
 		 88 aa  53.5  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7384  glutaredoxin protein  32.86 
 
 		 99 aa  52.8  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.405165  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4274  glutaredoxin-like protein NrdH  38.71 
 
 		 92 aa  50.4  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2689  YruB family glutaredoxin-like protein  34.72 
 
 		 80 aa  48.9  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1149  glutaredoxin family protein  33.33 
 
 		 78 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3815  YruB family glutaredoxin-like protein  34.72 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4091  glutaredoxin family protein  33.33 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4037  glutaredoxin family protein  33.33 
 
 		 78 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.141219  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3729  glutaredoxin family protein  33.33 
 
 		 78 aa  45.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3745  glutaredoxin family protein  33.33 
 
 		 78 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4108  glutaredoxin family protein  33.33 
 
 		 78 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4003  glutaredoxin family protein  33.33 
 
 		 78 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0169  glutaredoxin  27.94 
 
 		 402 aa  45.1  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2230  glutaredoxin  36.62 
 
 		 87 aa  44.7  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.381794  normal  0.448349 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1790  glutaredoxin GrxC  30.16 
 
 		 86 aa  43.9  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.711086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0406  glutaredoxin  29.41 
 
 		 383 aa  43.5  0.0009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0240048  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3897  glutaredoxin family protein  31.94 
 
 		 78 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4201  glutaredoxin family protein  31.94 
 
 		 78 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0911  arsenate reductase  56.25 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0335675  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2437  thioredoxin reductase  31.25 
 
 		 442 aa  43.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1835  transcriptional regulator Spx  40.91 
 
 		 131 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.27338  normal  0.376442 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0671  hypothetical protein  37.74 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1126  glutaredoxin 3  29.69 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0880684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1501  hypothetical protein  32.76 
 
 		 398 aa  42.7  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.226157 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0235  YruB family glutaredoxin-like protein  29.17 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000377018  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3411  transcriptional regulator Spx  38.64 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000835539  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3423  transcriptional regulator Spx  38.64 
 
 		 131 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.126084  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3202  transcriptional regulator Spx  38.64 
 
 		 131 aa  41.6  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0489409  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3181  transcriptional regulator Spx  38.64 
 
 		 131 aa  41.6  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.359932  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3109  transcriptional regulator Spx  38.64 
 
 		 131 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3456  transcriptional regulator Spx  38.64 
 
 		 131 aa  41.6  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1145  glutaredoxin  33.96 
 
 		 77 aa  42  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1167  glutaredoxin  33.96 
 
 		 77 aa  42  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.957373  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3422  transcriptional regulator Spx  38.64 
 
 		 131 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0556  glutaredoxin  27.4 
 
 		 77 aa  42  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0146434  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>