88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_4639 on replicon NC_011881
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011881  Achl_4639  glutaredoxin  100 
 
 		 88 aa  185  1e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2119  glutaredoxin-like protein NrdH  53.95 
 
 		 81 aa  76.6  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000183339 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2358  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  57.14 
 
 		 81 aa  73.6  0.0000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.543231  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4233  glutaredoxin  51.32 
 
 		 90 aa  72.4  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00450128  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2971  glutaredoxin-like protein NrdH  51.43 
 
 		 82 aa  69.7  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.454074  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4400  glutaredoxin  49.38 
 
 		 88 aa  69.7  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00125164  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10470  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  51.43 
 
 		 81 aa  68.6  0.00000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00700177  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3453  glutaredoxin-like protein NrdH  48.05 
 
 		 81 aa  68.2  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2439  glutaredoxin-like protein NrdH  47.5 
 
 		 79 aa  67.8  0.00000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.354839  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1148  glutaredoxin-like protein NrdH  48.57 
 
 		 79 aa  67.4  0.00000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3131  glutaredoxin-like protein NrdH  48.57 
 
 		 79 aa  67  0.00000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1753  glutaredoxin-like protein NrdH  42.86 
 
 		 80 aa  67  0.00000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0638832 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4307  glutaredoxin-like protein NrdH  48.65 
 
 		 98 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2040  glutaredoxin-like protein NrdH  48.65 
 
 		 83 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.672826 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10180  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  50 
 
 		 81 aa  66.6  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.521827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3721  glutaredoxin-like protein NrdH  41.56 
 
 		 78 aa  65.5  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.75993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0521  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  44.74 
 
 		 73 aa  65.9  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.317341  normal  0.144081 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2421  glutaredoxin-like protein NrdH  49.37 
 
 		 77 aa  65.9  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13069  glutaredoxin-like electron transport protein nrdH  48.57 
 
 		 79 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.193738 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3291  glutaredoxin-like protein NrdH  47.22 
 
 		 77 aa  63.9  0.0000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0095  glutaredoxin-like protein NrdH  44.44 
 
 		 83 aa  62.8  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.729355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5535  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  44.3 
 
 		 81 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.038319  hitchhiker  0.0000122398 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1862  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  48.57 
 
 		 83 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.150892 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1815  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  48.57 
 
 		 83 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.389601  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1796  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  48.57 
 
 		 83 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.297213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1119  glutaredoxin-like protein NrdH  42.86 
 
 		 78 aa  62.8  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.556674  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3540  glutaredoxin-related protein NrdH  42.86 
 
 		 78 aa  62.8  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00255736  hitchhiker  0.0090017 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1065  glutaredoxin-related protein NrdH  42.86 
 
 		 78 aa  62.8  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0223724  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4375  glutaredoxin-like protein NrdH  45.71 
 
 		 73 aa  62.8  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.509637 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1014  glutaredoxin  44.29 
 
 		 77 aa  61.6  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24930  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  47.83 
 
 		 80 aa  62  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.515104  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0377  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  42.47 
 
 		 74 aa  60.8  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0803  glutaredoxin-like protein NrdH  45.71 
 
 		 79 aa  60.8  0.000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.815074 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4274  glutaredoxin-like protein NrdH  46.97 
 
 		 92 aa  60.1  0.000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0179  glutaredoxin  41.89 
 
 		 86 aa  59.7  0.00000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0563  glutaredoxin-like protein NrdH  45.95 
 
 		 76 aa  59.3  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.629127  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1460  glutaredoxin  39.19 
 
 		 88 aa  58.5  0.00000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0354  glutaredoxin-like protein NrdH  41.43 
 
 		 74 aa  57.4  0.00000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4923  glutaredoxin-like protein NrdH  40 
 
 		 80 aa  55.5  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3500  glutaredoxin-like protein NrdH  42.86 
 
 		 73 aa  55.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.855754 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0446  glutaredoxin-like protein NrdH  44.29 
 
 		 81 aa  55.1  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3795  glutaredoxin-like protein NrdH  41.43 
 
 		 73 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0880  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  35.71 
 
 		 73 aa  53.5  0.0000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.121758  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2952  glutaredoxin-like protein NrdH  37.14 
 
 		 73 aa  53.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.794387  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0314  glutaredoxin-like protein nrdH  37.14 
 
 		 73 aa  53.1  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.24062  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0290  glutaredoxin-like protein nrdH  37.14 
 
 		 115 aa  52.8  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0883091  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3153  glutaredoxin-like protein  34.72 
 
 		 84 aa  51.6  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00125974  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0820  ribonucleoside-diphosphate reductase 2, NrdH-redoxin  39.29 
 
 		 74 aa  51.6  0.000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.959383  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3917  glutaredoxin-like protein  34.29 
 
 		 81 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0970287 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02529  glutaredoxin-like protein  34.29 
 
 		 81 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02493  hypothetical protein  34.29 
 
 		 81 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1010  glutaredoxin-like protein NrdH  34.29 
 
 		 81 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2809  glutaredoxin-like protein  34.29 
 
 		 81 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1719  YruB family glutaredoxin-like protein  38.46 
 
 		 80 aa  49.7  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3206  glutaredoxin-like protein  34.29 
 
 		 81 aa  49.7  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1033  glutaredoxin-like protein  34.29 
 
 		 81 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1777  YruB family glutaredoxin-like protein  38.46 
 
 		 80 aa  50.1  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.110535  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2795  glutaredoxin-like protein  34.29 
 
 		 81 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0109554 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2583  glutaredoxin  39.39 
 
 		 84 aa  48.9  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1427  YruB family glutaredoxin-like protein  40.38 
 
 		 80 aa  48.1  0.00004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00494984  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0707  glutaredoxin  38.46 
 
 		 81 aa  47.8  0.00005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.161206  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2953  glutaredoxin-like protein  33.33 
 
 		 81 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0443282  normal  0.0122925 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7384  glutaredoxin protein  38.57 
 
 		 99 aa  47.4  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.405165  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2988  glutaredoxin-like protein  33.33 
 
 		 81 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0820177 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3005  glutaredoxin-like protein  33.33 
 
 		 81 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424268 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2922  glutaredoxin-like protein  33.33 
 
 		 81 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3111  glutaredoxin-like protein  33.33 
 
 		 81 aa  47.4  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.530275  normal  0.463603 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0451  hypothetical protein  37.29 
 
 		 255 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0854  YruB family glutaredoxin-like protein  34.62 
 
 		 80 aa  45.4  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00289984  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0253  glutaredoxin-like protein  35.71 
 
 		 76 aa  44.7  0.0004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2810  glutaredoxin-like protein  32.86 
 
 		 84 aa  43.9  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.201567 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0010  glutaredoxin  37.74 
 
 		 91 aa  42.7  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0851893 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0034  glutaredoxin-like protein, YruB-family  33.78 
 
 		 81 aa  42.7  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0784  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  56.67 
 
 		 459 aa  43.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.241048  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2437  thioredoxin reductase  56.67 
 
 		 442 aa  43.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1344  YruB family glutaredoxin-like protein  35.29 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.458905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2285  glutaredoxin  34.78 
 
 		 83 aa  42.4  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.304987 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2145  glutaredoxin  34.78 
 
 		 83 aa  42.4  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.201454  normal  0.150522 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1609  glutaredoxin-like protein, YruB  28.3 
 
 		 80 aa  41.6  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.645814  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0235  YruB family glutaredoxin-like protein  42.31 
 
 		 76 aa  42  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000377018  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1323  YruB family glutaredoxin-like protein  35.29 
 
 		 84 aa  41.6  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0672581  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1531  peptide methionine sulfoxide reductase  30 
 
 		 260 aa  41.2  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0149191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1508  glutaredoxin  33.9 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000114631  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0311  glutaredoxin 3  47.06 
 
 		 89 aa  40.8  0.006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.257705  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0529  glutaredoxin-like protein GlrX  38.18 
 
 		 86 aa  40.8  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0084  glutaredoxin  33.9 
 
 		 384 aa  40.8  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.833578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1178  glutaredoxin-like protein  40.74 
 
 		 94 aa  40.8  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.975615  normal  0.0647331 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1790  glutaredoxin GrxC  32.84 
 
 		 86 aa  40.8  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.711086  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>