100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2439 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2439  glutaredoxin-like protein NrdH  100 
 
 
79 aa  163  5.9999999999999996e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.354839  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10180  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  82.28 
 
 
81 aa  141  3e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.521827  normal 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3453  glutaredoxin-like protein NrdH  87.67 
 
 
81 aa  135  2e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1753  glutaredoxin-like protein NrdH  78.08 
 
 
80 aa  132  9.999999999999999e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0638832 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0803  glutaredoxin-like protein NrdH  73.08 
 
 
79 aa  124  4.0000000000000003e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.815074 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3795  glutaredoxin-like protein NrdH  72.6 
 
 
73 aa  122  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3500  glutaredoxin-like protein NrdH  72.6 
 
 
73 aa  122  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.855754 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2119  glutaredoxin-like protein NrdH  67.09 
 
 
81 aa  119  9e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000183339 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3291  glutaredoxin-like protein NrdH  71.43 
 
 
77 aa  119  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0521  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  76.71 
 
 
73 aa  119  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.317341  normal  0.144081 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2040  glutaredoxin-like protein NrdH  73.08 
 
 
83 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.672826 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2971  glutaredoxin-like protein NrdH  69.62 
 
 
82 aa  118  3e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.454074  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4923  glutaredoxin-like protein NrdH  67.09 
 
 
80 aa  117  3.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0095  glutaredoxin-like protein NrdH  69.23 
 
 
83 aa  117  3.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.729355  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3721  glutaredoxin-like protein NrdH  67.57 
 
 
78 aa  117  7.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.75993  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0446  glutaredoxin-like protein NrdH  71.79 
 
 
81 aa  116  9e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2358  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  72.46 
 
 
81 aa  115  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.543231  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1862  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  73.24 
 
 
83 aa  115  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.150892 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1796  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  73.24 
 
 
83 aa  115  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.297213  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0314  glutaredoxin-like protein nrdH  67.12 
 
 
73 aa  115  3e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.24062  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1815  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  73.24 
 
 
83 aa  115  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.389601  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2952  glutaredoxin-like protein NrdH  68.49 
 
 
73 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.794387  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0290  glutaredoxin-like protein nrdH  67.12 
 
 
115 aa  114  3.9999999999999997e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0883091  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13069  glutaredoxin-like electron transport protein nrdH  68.35 
 
 
79 aa  112  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.193738 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4307  glutaredoxin-like protein NrdH  73.24 
 
 
98 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1119  glutaredoxin-like protein NrdH  60.81 
 
 
78 aa  111  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.556674  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1065  glutaredoxin-related protein NrdH  60.81 
 
 
78 aa  111  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0223724  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4375  glutaredoxin-like protein NrdH  67.12 
 
 
73 aa  111  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.509637 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3540  glutaredoxin-related protein NrdH  60.81 
 
 
78 aa  111  3e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00255736  hitchhiker  0.0090017 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7384  glutaredoxin protein  67.12 
 
 
99 aa  110  6e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.405165  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5535  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  66.22 
 
 
81 aa  110  6e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.038319  hitchhiker  0.0000122398 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10470  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  69.57 
 
 
81 aa  110  9e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00700177  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24930  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  70.59 
 
 
80 aa  107  7.000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.515104  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0354  glutaredoxin-like protein NrdH  61.64 
 
 
74 aa  107  8.000000000000001e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3131  glutaredoxin-like protein NrdH  61.11 
 
 
79 aa  106  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2421  glutaredoxin-like protein NrdH  72.22 
 
 
77 aa  106  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1148  glutaredoxin-like protein NrdH  61.11 
 
 
79 aa  105  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0377  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  64.86 
 
 
74 aa  100  6e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0563  glutaredoxin-like protein NrdH  64.38 
 
 
76 aa  98.2  4e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.629127  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3153  glutaredoxin-like protein  51.9 
 
 
84 aa  92.8  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00125974  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0179  glutaredoxin  46.84 
 
 
86 aa  88.6  3e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1460  glutaredoxin  46.75 
 
 
88 aa  87  7e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4274  glutaredoxin-like protein NrdH  60 
 
 
92 aa  85.5  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1014  glutaredoxin  53.25 
 
 
77 aa  83.6  8e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1033  glutaredoxin-like protein  45.68 
 
 
81 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2795  glutaredoxin-like protein  45.68 
 
 
81 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0109554 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3206  glutaredoxin-like protein  45.83 
 
 
81 aa  82  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3917  glutaredoxin-like protein  45.68 
 
 
81 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0970287 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02493  hypothetical protein  45.68 
 
 
81 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1010  glutaredoxin-like protein NrdH  45.68 
 
 
81 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2809  glutaredoxin-like protein  45.68 
 
 
81 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02529  glutaredoxin-like protein  45.68 
 
 
81 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3111  glutaredoxin-like protein  47.22 
 
 
81 aa  81.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.530275  normal  0.463603 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2922  glutaredoxin-like protein  47.22 
 
 
81 aa  81.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2953  glutaredoxin-like protein  47.22 
 
 
81 aa  81.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0443282  normal  0.0122925 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2988  glutaredoxin-like protein  47.22 
 
 
81 aa  81.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0820177 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3005  glutaredoxin-like protein  47.22 
 
 
81 aa  81.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00424268 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0820  ribonucleoside-diphosphate reductase 2, NrdH-redoxin  39.44 
 
 
74 aa  67.8  0.00000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.959383  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4639  glutaredoxin  47.5 
 
 
88 aa  67.8  0.00000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1247  glutaredoxin  35.21 
 
 
74 aa  63.5  0.0000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000466466  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0880  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  36.11 
 
 
73 aa  63.5  0.0000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.121758  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0253  glutaredoxin-like protein  36.99 
 
 
76 aa  59.7  0.00000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0324  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  36.11 
 
 
73 aa  58.5  0.00000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0101839  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1063  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  35.21 
 
 
72 aa  57.8  0.00000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000290515  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4233  glutaredoxin  40 
 
 
90 aa  57  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00450128  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0139  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  39.39 
 
 
81 aa  57  0.00000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28890  hypothetical protein  42.86 
 
 
285 aa  56.6  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.998422  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4400  glutaredoxin  37.5 
 
 
88 aa  56.6  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00125164  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2285  glutaredoxin  35.53 
 
 
83 aa  53.1  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.304987 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2145  glutaredoxin  35.53 
 
 
83 aa  53.1  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.201454  normal  0.150522 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4406  hypothetical protein  42.86 
 
 
105 aa  50.4  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1508  glutaredoxin-like protein protein, YruB  35.9 
 
 
81 aa  49.3  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00379246  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0982  glutaredoxin  37.31 
 
 
116 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0034  glutaredoxin-like protein, YruB-family  35.62 
 
 
81 aa  47.4  0.00007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5356  glutaredoxin 3  36.11 
 
 
92 aa  47  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460524  normal  0.957848 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2583  glutaredoxin  37.68 
 
 
84 aa  46.6  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0566  glutaredoxin family protein  32.35 
 
 
83 aa  45.4  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.113719  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3049  glutaredoxin  40.85 
 
 
391 aa  45.4  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0296  glutaredoxin GrxC  32.43 
 
 
86 aa  44.7  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1082  glutaredoxin  35.71 
 
 
116 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.976199  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1508  glutaredoxin  30 
 
 
76 aa  44.3  0.0006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000114631  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0235  YruB family glutaredoxin-like protein  34.25 
 
 
76 aa  43.9  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000377018  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0368  glutaredoxin 3  32.26 
 
 
85 aa  42.4  0.002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1264  glutaredoxin NrdH  35.38 
 
 
70 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0898475  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0808  glutaredoxin 3  32 
 
 
87 aa  42.4  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.166784  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3089  glutaredoxin 3  33.33 
 
 
84 aa  42  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.393298  normal  0.343511 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1344  YruB family glutaredoxin-like protein  34.33 
 
 
84 aa  41.6  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.458905  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2959  glutaredoxin-like protein, YruB  30.88 
 
 
168 aa  42  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0854  YruB family glutaredoxin-like protein  34.38 
 
 
80 aa  41.6  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00289984  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3219  YruB family glutaredoxin-like protein  32.43 
 
 
82 aa  41.6  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.890073 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0311  glutaredoxin 3  34.25 
 
 
89 aa  41.2  0.004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.257705  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1555  glutaredoxin  27.85 
 
 
87 aa  40.8  0.006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000316577  normal  0.150299 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1323  YruB family glutaredoxin-like protein  34.33 
 
 
84 aa  40.8  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0672581  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1737  glutaredoxin GrxC  27.85 
 
 
87 aa  40.8  0.006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0513723  normal  0.163963 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1415  hypothetical protein  39.02 
 
 
274 aa  40.8  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0451  hypothetical protein  34.55 
 
 
255 aa  40.4  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1531  peptide methionine sulfoxide reductase  32.39 
 
 
260 aa  40.4  0.007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0149191  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2903  glutaredoxin GrxC  31.08 
 
 
85 aa  40.8  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.844851  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2369  glutaredoxin  33.82 
 
 
80 aa  40.4  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0319726  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1427  YruB family glutaredoxin-like protein  27.4 
 
 
80 aa  40.4  0.008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00494984  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>