36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0095 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_0095  glutaredoxin-like protein  100 
 
 
76 aa  159  1e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0141921  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0880  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  43.06 
 
 
73 aa  62.8  0.000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.121758  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1815  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  33.8 
 
 
83 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.389601  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1862  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  33.8 
 
 
83 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.150892 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1796  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  33.8 
 
 
83 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.297213  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0095  glutaredoxin-like protein NrdH  25.97 
 
 
83 aa  47  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.729355  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1460  glutaredoxin  31.08 
 
 
88 aa  47  0.00009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13069  glutaredoxin-like electron transport protein nrdH  30.56 
 
 
79 aa  47  0.00009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.193738 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1010  glutaredoxin-like protein NrdH  33.33 
 
 
81 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02493  hypothetical protein  33.33 
 
 
81 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3917  glutaredoxin-like protein  33.33 
 
 
81 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0970287 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3206  glutaredoxin-like protein  33.33 
 
 
81 aa  45.8  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2795  glutaredoxin-like protein  33.33 
 
 
81 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0109554 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1033  glutaredoxin-like protein  33.33 
 
 
81 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2809  glutaredoxin-like protein  33.33 
 
 
81 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3153  glutaredoxin-like protein  31.94 
 
 
84 aa  45.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00125974  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02529  glutaredoxin-like protein  33.33 
 
 
81 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1148  glutaredoxin-like protein NrdH  26.39 
 
 
79 aa  45.1  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0314  glutaredoxin-like protein nrdH  26.39 
 
 
73 aa  44.7  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.24062  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2119  glutaredoxin-like protein NrdH  27.78 
 
 
81 aa  43.9  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000183339 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3111  glutaredoxin-like protein  30.56 
 
 
81 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.530275  normal  0.463603 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10470  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  30.43 
 
 
81 aa  43.1  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00700177  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0290  glutaredoxin-like protein nrdH  26.39 
 
 
115 aa  43.5  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0883091  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2953  glutaredoxin-like protein  30.56 
 
 
81 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0443282  normal  0.0122925 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2922  glutaredoxin-like protein  30.56 
 
 
81 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2988  glutaredoxin-like protein  30.56 
 
 
81 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0820177 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3005  glutaredoxin-like protein  30.56 
 
 
81 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00424268 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3131  glutaredoxin-like protein NrdH  25 
 
 
79 aa  42.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2971  glutaredoxin-like protein NrdH  28 
 
 
82 aa  42.4  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.454074  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0820  ribonucleoside-diphosphate reductase 2, NrdH-redoxin  28.17 
 
 
74 aa  42  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.959383  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2040  glutaredoxin-like protein NrdH  30 
 
 
83 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.672826 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1753  glutaredoxin-like protein NrdH  27.27 
 
 
80 aa  41.2  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0638832 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2358  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  26.76 
 
 
81 aa  40.4  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.543231  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4307  glutaredoxin-like protein NrdH  28.57 
 
 
98 aa  40.4  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0139  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  36.36 
 
 
81 aa  40  0.01  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3291  glutaredoxin-like protein NrdH  29.17 
 
 
77 aa  40  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>