119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0563 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0563  glutaredoxin-like protein NrdH  100 
 
 		 76 aa  156  9e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.629127  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3291  glutaredoxin-like protein NrdH  72.97 
 
 		 77 aa  116  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2040  glutaredoxin-like protein NrdH  72 
 
 		 83 aa  115  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.672826 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4923  glutaredoxin-like protein NrdH  71.62 
 
 		 80 aa  112  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2971  glutaredoxin-like protein NrdH  68.92 
 
 		 82 aa  110  7.000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.454074  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13069  glutaredoxin-like electron transport protein nrdH  67.11 
 
 		 79 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.193738 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1815  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  69.44 
 
 		 83 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.389601  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1862  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  69.44 
 
 		 83 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.150892 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1796  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  69.44 
 
 		 83 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.297213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4307  glutaredoxin-like protein NrdH  70.42 
 
 		 98 aa  107  8.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0446  glutaredoxin-like protein NrdH  65.75 
 
 		 81 aa  103  9e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5535  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  66.67 
 
 		 81 aa  101  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.038319  hitchhiker  0.0000122398 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1753  glutaredoxin-like protein NrdH  62.16 
 
 		 80 aa  100  1e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0638832 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10180  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  63.51 
 
 		 81 aa  99  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.521827  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2421  glutaredoxin-like protein NrdH  67.57 
 
 		 77 aa  99.4  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2439  glutaredoxin-like protein NrdH  64.38 
 
 		 79 aa  98.2  4e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.354839  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3453  glutaredoxin-like protein NrdH  64.38 
 
 		 81 aa  96.3  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3795  glutaredoxin-like protein NrdH  57.53 
 
 		 73 aa  95.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3500  glutaredoxin-like protein NrdH  56.16 
 
 		 73 aa  93.2  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.855754 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2119  glutaredoxin-like protein NrdH  58.9 
 
 		 81 aa  93.2  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000183339 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0521  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  54.79 
 
 		 73 aa  90.9  5e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.317341  normal  0.144081 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4375  glutaredoxin-like protein NrdH  54.79 
 
 		 73 aa  90.9  5e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.509637 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0803  glutaredoxin-like protein NrdH  58.9 
 
 		 79 aa  89.7  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.815074 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1065  glutaredoxin-related protein NrdH  47.22 
 
 		 78 aa  88.6  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0223724  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3721  glutaredoxin-like protein NrdH  52.05 
 
 		 78 aa  89.4  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.75993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3540  glutaredoxin-related protein NrdH  47.22 
 
 		 78 aa  88.6  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00255736  hitchhiker  0.0090017 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1119  glutaredoxin-like protein NrdH  47.22 
 
 		 78 aa  88.6  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.556674  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0314  glutaredoxin-like protein nrdH  53.42 
 
 		 73 aa  88.6  3e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.24062  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7384  glutaredoxin protein  56.16 
 
 		 99 aa  88.2  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.405165  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2358  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  56.34 
 
 		 81 aa  87.4  6e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.543231  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0290  glutaredoxin-like protein nrdH  53.42 
 
 		 115 aa  87.4  6e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0883091  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3131  glutaredoxin-like protein NrdH  51.35 
 
 		 79 aa  87  9e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2952  glutaredoxin-like protein NrdH  53.42 
 
 		 73 aa  86.3  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.794387  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10470  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  56.52 
 
 		 81 aa  86.3  1e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00700177  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0377  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  60.81 
 
 		 74 aa  85.5  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0095  glutaredoxin-like protein NrdH  54.79 
 
 		 83 aa  85.9  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.729355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0354  glutaredoxin-like protein NrdH  50 
 
 		 74 aa  85.1  3e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1148  glutaredoxin-like protein NrdH  50 
 
 		 79 aa  84.7  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4274  glutaredoxin-like protein NrdH  59.7 
 
 		 92 aa  83.6  8e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24930  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  54.41 
 
 		 80 aa  82.8  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.515104  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1460  glutaredoxin  41.1 
 
 		 88 aa  74.7  0.0000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3005  glutaredoxin-like protein  47.22 
 
 		 81 aa  73.6  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424268 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2988  glutaredoxin-like protein  47.22 
 
 		 81 aa  73.6  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0820177 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2953  glutaredoxin-like protein  47.22 
 
 		 81 aa  73.6  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0443282  normal  0.0122925 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2922  glutaredoxin-like protein  47.22 
 
 		 81 aa  73.6  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3111  glutaredoxin-like protein  47.22 
 
 		 81 aa  73.6  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.530275  normal  0.463603 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3153  glutaredoxin-like protein  43.42 
 
 		 84 aa  72.4  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00125974  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1014  glutaredoxin  43.42 
 
 		 77 aa  72  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0179  glutaredoxin  42.47 
 
 		 86 aa  70.5  0.000000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02529  glutaredoxin-like protein  41.67 
 
 		 81 aa  69.3  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1010  glutaredoxin-like protein NrdH  41.67 
 
 		 81 aa  69.3  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2809  glutaredoxin-like protein  41.67 
 
 		 81 aa  69.3  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1033  glutaredoxin-like protein  41.67 
 
 		 81 aa  69.3  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2795  glutaredoxin-like protein  41.67 
 
 		 81 aa  69.3  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0109554 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3917  glutaredoxin-like protein  41.67 
 
 		 81 aa  69.3  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0970287 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02493  hypothetical protein  41.67 
 
 		 81 aa  69.3  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3206  glutaredoxin-like protein  41.67 
 
 		 81 aa  69.3  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0880  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  44.78 
 
 		 73 aa  66.2  0.0000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.121758  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1247  glutaredoxin  34.29 
 
 		 74 aa  62.8  0.000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000466466  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0820  ribonucleoside-diphosphate reductase 2, NrdH-redoxin  33.8 
 
 		 74 aa  61.2  0.000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.959383  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4400  glutaredoxin  37.04 
 
 		 88 aa  60.5  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00125164  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4233  glutaredoxin  37.04 
 
 		 90 aa  60.1  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00450128  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4639  glutaredoxin  45.95 
 
 		 88 aa  59.3  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0169  glutaredoxin  38.16 
 
 		 402 aa  56.2  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2145  glutaredoxin  32.89 
 
 		 83 aa  55.8  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.201454  normal  0.150522 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2285  glutaredoxin  32.89 
 
 		 83 aa  55.8  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.304987 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1063  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  30.99 
 
 		 72 aa  53.9  0.0000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000290515  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28890  hypothetical protein  38.46 
 
 		 285 aa  53.5  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.998422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0253  glutaredoxin-like protein  33.78 
 
 		 76 aa  52.4  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1508  glutaredoxin-like protein protein, YruB  35.9 
 
 		 81 aa  51.2  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00379246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3049  glutaredoxin  38.03 
 
 		 391 aa  50.8  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0139  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  34.85 
 
 		 81 aa  48.1  0.00004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3815  YruB family glutaredoxin-like protein  32 
 
 		 78 aa  47.8  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0084  glutaredoxin  34.72 
 
 		 384 aa  47.4  0.00008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.833578  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2967  glutaredoxin-like protein  37.93 
 
 		 82 aa  46.6  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0324  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  27.78 
 
 		 73 aa  46.6  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0101839  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1149  glutaredoxin family protein  32 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3897  glutaredoxin family protein  30.67 
 
 		 78 aa  45.4  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4201  glutaredoxin family protein  30.67 
 
 		 78 aa  45.4  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3366  glutaredoxin  30 
 
 		 191 aa  45.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1531  peptide methionine sulfoxide reductase  35.21 
 
 		 260 aa  46.2  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0149191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2959  glutaredoxin-like protein, YruB  32.35 
 
 		 168 aa  45.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2340  glutaredoxin  31.94 
 
 		 78 aa  45.1  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.340679  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3745  glutaredoxin family protein  30.67 
 
 		 78 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4091  glutaredoxin family protein  30.67 
 
 		 78 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1508  glutaredoxin  29.41 
 
 		 76 aa  44.7  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000114631  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4037  glutaredoxin family protein  30.67 
 
 		 78 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.141219  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3729  glutaredoxin family protein  30.67 
 
 		 78 aa  44.7  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4108  glutaredoxin family protein  30.67 
 
 		 78 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4003  glutaredoxin family protein  30.67 
 
 		 78 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1785  glutaredoxin-like protein  37.97 
 
 		 83 aa  44.3  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.593811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1145  glutaredoxin  32 
 
 		 100 aa  43.9  0.0008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0311964 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4406  hypothetical protein  35.06 
 
 		 105 aa  43.9  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3740  glutaredoxin-like protein  40 
 
 		 80 aa  43.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.137278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2632  glutaredoxin 3  35.94 
 
 		 85 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8361  Glutaredoxin and related protein-like protein  35 
 
 		 78 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.647528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1427  YruB family glutaredoxin-like protein  28.95 
 
 		 80 aa  43.1  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00494984  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0296  glutaredoxin GrxC  34.38 
 
 		 86 aa  42.4  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2749  YruB family glutaredoxin-like protein  29.41 
 
 		 77 aa  42.4  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2435  YruB family glutaredoxin-like protein  29.41 
 
 		 77 aa  42.4  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>