22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0671 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0671  hypothetical protein  100 
 
 
78 aa  158  2e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1167  glutaredoxin  62.5 
 
 
77 aa  105  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.957373  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1145  glutaredoxin  62.5 
 
 
77 aa  105  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2689  YruB family glutaredoxin-like protein  41.89 
 
 
80 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4091  glutaredoxin family protein  36.11 
 
 
78 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3897  glutaredoxin family protein  36.11 
 
 
78 aa  56.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1149  glutaredoxin family protein  36.11 
 
 
78 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4201  glutaredoxin family protein  36.11 
 
 
78 aa  56.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4037  glutaredoxin family protein  36.11 
 
 
78 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.141219  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4003  glutaredoxin family protein  36.11 
 
 
78 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4108  glutaredoxin family protein  36.11 
 
 
78 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3745  glutaredoxin family protein  36.11 
 
 
78 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3729  glutaredoxin family protein  36.11 
 
 
78 aa  56.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3815  YruB family glutaredoxin-like protein  33.33 
 
 
78 aa  49.7  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0865  glutaredoxin  35 
 
 
81 aa  43.9  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.765785  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0880  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  37.74 
 
 
73 aa  42.4  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.121758  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2075  glutaredoxin  27.27 
 
 
79 aa  40.8  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2449  hypothetical protein  27.27 
 
 
79 aa  40.8  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1924  glutaredoxin  42.42 
 
 
211 aa  40.4  0.009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0714876 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1609  glutaredoxin-like protein, YruB  23.61 
 
 
80 aa  40.4  0.009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.645814  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2230  glutaredoxin  27.27 
 
 
87 aa  40  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.381794  normal  0.448349 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0640  putative glutaredoxin  35.29 
 
 
75 aa  40  0.01  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.189959  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>