67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2075 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_2075  glutaredoxin  100 
 
 		 79 aa  159  9e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2449  hypothetical protein  100 
 
 		 79 aa  159  9e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3239  glutaredoxin  59.21 
 
 		 87 aa  100  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0851867  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4052  glutaredoxin  52.63 
 
 		 88 aa  94  6e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2583  glutaredoxin  47.37 
 
 		 84 aa  74.7  0.0000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12420  glutaredoxin-like protein  45.16 
 
 		 82 aa  56.6  0.0000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2334  YruB family glutaredoxin-like protein  40.28 
 
 		 194 aa  51.2  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000573032  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1609  glutaredoxin-like protein, YruB  40.85 
 
 		 80 aa  50.8  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.645814  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0235  YruB family glutaredoxin-like protein  35.06 
 
 		 76 aa  48.9  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000377018  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2586  glutaredoxin 3  33.33 
 
 		 88 aa  48.9  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.630404 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1149  glutaredoxin family protein  35.14 
 
 		 78 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2784  glutaredoxin  36.36 
 
 		 84 aa  48.1  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.420129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2340  glutaredoxin  38.67 
 
 		 78 aa  47  0.00009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.340679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4091  glutaredoxin family protein  35.14 
 
 		 78 aa  47  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1038  glutaredoxin-like protein  34.92 
 
 		 83 aa  46.6  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4108  glutaredoxin family protein  33.78 
 
 		 78 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4003  glutaredoxin family protein  33.78 
 
 		 78 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0034  glutaredoxin-like protein, YruB-family  33.33 
 
 		 81 aa  46.2  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3729  glutaredoxin family protein  33.78 
 
 		 78 aa  45.4  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4037  glutaredoxin family protein  33.78 
 
 		 78 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.141219  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3745  glutaredoxin family protein  33.78 
 
 		 78 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0640  putative glutaredoxin  38.57 
 
 		 75 aa  44.7  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.189959  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1145  glutaredoxin  26.56 
 
 		 77 aa  44.7  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1167  glutaredoxin  26.56 
 
 		 77 aa  44.7  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.957373  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0758  glutaredoxin family protein  30.95 
 
 		 112 aa  44.3  0.0005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2421  glutaredoxin-like protein NrdH  33.33 
 
 		 77 aa  44.3  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4201  glutaredoxin family protein  32.43 
 
 		 78 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3897  glutaredoxin family protein  32.43 
 
 		 78 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1427  YruB family glutaredoxin-like protein  33.33 
 
 		 80 aa  43.5  0.0008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00494984  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0127  glutaredoxin 3  39.39 
 
 		 86 aa  43.5  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.243764  normal  0.0245939 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0521  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  37.04 
 
 		 73 aa  43.5  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.317341  normal  0.144081 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0982  glutaredoxin  33.33 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1876  glutaredoxin 3  39.66 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1807  glutaredoxin 3  39.66 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.433283  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2689  YruB family glutaredoxin-like protein  31.08 
 
 		 80 aa  43.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0355  glutaredoxin 3 (GRX3) protein  36.36 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.119855 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3815  YruB family glutaredoxin-like protein  31.17 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0707  glutaredoxin  38.18 
 
 		 81 aa  42.7  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.161206  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2958  glutaredoxin  36 
 
 		 84 aa  42  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0186705 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0230  glutaredoxin 3  38.33 
 
 		 85 aa  41.6  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.53184  hitchhiker  0.00238728 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0252  glutaredoxin GrxC  38.33 
 
 		 85 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2013  glutaredoxin GrxC  39.34 
 
 		 88 aa  42  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.319354  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0738  glutaredoxin GrxC  42.42 
 
 		 88 aa  42  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.218135  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0211  glutaredoxin 3  38.33 
 
 		 85 aa  41.6  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.154177 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0503  redox-active disulfide protein 1  36.25 
 
 		 82 aa  41.2  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.859338  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1344  YruB family glutaredoxin-like protein  31.75 
 
 		 84 aa  41.6  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.458905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1323  YruB family glutaredoxin-like protein  31.75 
 
 		 84 aa  41.2  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0672581  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2064  glutaredoxin  41.82 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1508  glutaredoxin  34.38 
 
 		 76 aa  41.6  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000114631  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2714  glutaredoxin 3  35.53 
 
 		 84 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1460  glutaredoxin  32.79 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1950  glutaredoxin  31.75 
 
 		 80 aa  40.8  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000181605  normal  0.405053 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2081  glutaredoxin  44.07 
 
 		 74 aa  41.2  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0296  glutaredoxin GrxC  41.79 
 
 		 86 aa  41.2  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3219  YruB family glutaredoxin-like protein  35.94 
 
 		 82 aa  40.8  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.890073 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3005  glutaredoxin 3  34.57 
 
 		 93 aa  40.8  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0829  glutaredoxin  37.29 
 
 		 80 aa  40.8  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0671  hypothetical protein  27.27 
 
 		 78 aa  40.8  0.006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4139  glutaredoxin 3  36.92 
 
 		 82 aa  40.8  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.451689  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0071  glutaredoxin 3  36.92 
 
 		 82 aa  40.8  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0077  glutaredoxin 3  36.92 
 
 		 82 aa  40.8  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0808  glutaredoxin 3  30.23 
 
 		 87 aa  40.4  0.007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.166784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2124  glutaredoxin-like protein  31.75 
 
 		 83 aa  40.4  0.007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0253  glutaredoxin-like protein  28.79 
 
 		 76 aa  40.4  0.008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3507  glutaredoxin-3  36.47 
 
 		 85 aa  40.4  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.838286 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0854  YruB family glutaredoxin-like protein  31.17 
 
 		 80 aa  40.4  0.009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00289984  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2772  glutaredoxin 3  38.18 
 
 		 86 aa  40  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>